Basic Information

Symbol
CD200
RNA class
mRNA
Alias
CD200 Molecule CD200 Antigen OX-2 MOX1 MOX2 MRC Antigen Identified By Monoclonal Antibody MRC OX-2 OX-2 Membrane Glycoprotein
Location (GRCh38)
3:112332235-112363181
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005944.7
Sequence length
2129.0 nt
GC content
0.4279

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-583.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -625.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 447.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001004196.4 NCBI
AGAGCUCCAGGCGCACAUCCGCAGUCAGCCACCUCGCGCGCGCCUCCAG… 2204 nt 0.4306
NM_001318826.2 NCBI
AGAGCUCCAGGCGCACAUCCGCAGUCAGCCACCUCGCGCGCGCCUCCAG… 2124 nt 0.4280
NM_001318828.2 NCBI
AGAGCUCCAGGCGCACAUCCGCAGUCAGCCACCUCGCGCGCGCCUCCAG… 2047 nt 0.4231
NM_001318830.2 NCBI
AGAGCUCCAGGCGCACAUCCGCAGUCAGCCACCUCGCGCGCGCCUCCAG… 2042 nt 0.4231
NM_001365851.2 NCBI
AGAGCUCCAGGCGCACAUCCGCAGUCAGCCACCUCGCGCGCGCCUCCAG… 1075 nt 0.4707
NM_001365852.1 NCBI
AGAGCUCCAGGCGCACAUCCGCAGUCAGCCACCUCGCGCGCGCCUCCAG… 2542 nt 0.4378
NM_001365853.1 NCBI
ACAGAGCGAGACUCCGUCUCAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGGAGAA… 2189 nt 0.4189
NM_001365854.1 NCBI
ACAGAGCGAGACUCCGUCUCAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGGAGAA… 2264 nt 0.4218
NM_001365855.1 NCBI
ACAGAGCGAGACUCCGUCUCAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGGAGAA… 2184 nt 0.4190
NM_005944.7 NCBI
AGAGCUCCAGGCGCACAUCCGCAGUCAGCCACCUCGCGCGCGCCUCCAG… 2129 nt 0.4279
Summary

This gene encodes a type I membrane glycoprotein containing two extracellular immunoglobulin domains, a transmembrane and a cytoplasmic domain. This gene is expressed by various cell types, including B cells, a subset of T cells, thymocytes, endothelial cells, and neurons. The encoded protein plays an important role in immunosuppression and regulation of anti-tumor activity. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jan 2016]

Forensic Context

A study in mice identified CD200 as a crucial immune molecule associated with septic cardiomyopathy via differential expression analysis [Zhao et al. DOI:10.2147/JIR.S486763].