Basic Information

Symbol
CD36
RNA class
mRNA
Alias
CD36 Molecule (CD36 Blood Group) GPIIIB GPIV GP3B FAT GP4 Platelet Glycoprotein 4 Fatty Acid Translocase SCARB3 CD36 Antigen (Collagen Type I Receptor, Thrombospondin Receptor) CD36 Molecule (Thrombospondin Receptor) Leukocyte Differentiation Antigen CD36 Platelet Glycoprotein IV Glycoprotein IIIb PAS IV CD36 Molecule (CD36 Blood Group) Transcript Scavenger Receptor Class B, Member 3 Scavenger Receptor Class B Member 3 Platelet Collagen Receptor Thrombospondin Receptor Cluster Determinant 36 PAS-4 Protein CD36 Antigen BDPLT10 CHDS7 PASIV PAS-4
Location (GRCh38)
7:80369532-80679277
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001001548.3
Sequence length
4598.0 nt
GC content
0.3706

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1162.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1253.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1096.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((((((((((((...))))))....((((.(((((.........((((..(((((...)))))..))))((((....))))..(((....((((..((((....))))..))))...))).((((((((((.......))...))))))))....................((((((((...((((((..(((.((((((..((((((((..((................))..))))))))....(((((.(((....)))..))))).((((((((.(...(((((..(((((.((((.(((((((((((.((((((((.((.......)).)))))))).)))...(.((((.(((((((....))))))))))).)((((((((((..(((((.((((((((.(((((((......))).))))))))))))....(((((((((.(((((((.(((..(((((......(((((.(((((...((((((((..(((...))).(.(((.(((((.((((((((((((.............(..(((((((..(((...(.(((((((((((......)))))))).))).)...))).)))))))..).(((((((...(((((((((....(((...........)))((((.((..((.(((((..(((((((.........(((........)))..((((((((((((......(((((..........(((((((.((.(((........))).))...)))))))..............(((((....(((((((((...(((((((.((((((...((.(((.(((..........))).))).)))))))).)).........(.((((((....................)))))).)))))).)))))))))...))))).)))))......))..)))))))))).........................((((((.(((((((....(((.....)))....))))))).)))))).)))))))..))))).))..)).)))).....((((((((....(((((.(((((((..((((((..(((.(((((((((.......((.(((...............))).)).....)))))))))......((((((..((((....))))....(((((..........)))))....(((((....)))))..................(((((((....))))))).(((((((((....((((.(((((((((....(((.......)))...))).))))))...))))....)))))))))...........))))))....))))))))).)))))))...)))))))))))))....((((((.......)).))))..................)))))))))...(((....))).((((((..((((....((((.((........)).)))).(((.((......)).))).)))).))))))...)))))))..(((((......((((((((((....(((.(((..((((((.....((.........))..))))))))))))....)).)))).))))........))))))))).))))))))))))).))).)...))))))))..))))).))))).......)))))))))))...(((((((....))))))))))).))))))))))))))..))))))))))....(((....)))((((......))))...........))))).))))))).))))).)))))((((((((((((......((((...((.((((((((((.((((((...((((.(((((...(((((....(((((.....)))))((((.(((((..(((....)))..))))).)))).....(((..((((((.(((((((((((((.(.....).))))))...........)))))))...))))))...))))))))))))).....)))).........((((((..(((........((((((.(((((((.....(((((.(((....((((((.(((((((((((...............)))))))))))((.......))...(((((((...((((((.....))))))..))))))).........(((((.(((((((((((.....((((.(((((...))))).))))..)))).))))))).)))))((((((((((...........(((((((((.....(((......)))...((((((....(((((((.(((((((.((......(((((((((((((((........................)))))))))..(((.......)))..............(((((((((((((.(((....((((((.(((.....((((((((...((((((.........))))))....)))))))).))).))))))...)))..))).)))))..)))))...............(((((......)))))))))))..(((((((..((((((((...))))))))....)))))))..((((((....))))))....(((((.(.(((.(((((.((.........))...)))))))).).)))))....))))))))))))))))..))))))........)))))))))(((..((((((...........))))))..)))...))))))))))..))))))....))).)))))......................(((((((((.((.....))..)))).)))))......))))))).))))))((((.....))))(((((((((((((((((((((((((.(((((((((.....))))))).(((((((((((((.((((.((((((((..((((((((.............((((..(((((.(((.(((((.((.(((((((((.......(((((((...))))))).....)).)))))))(((((((((((((......((((....))))......(((((.(.(.((((((((........)))))))).).)))))).))))))))).))))....)).))))).))).)).)))..)))))))))))).((((....)))))))))))).)))).))))))...)))))))....)))))))).)))).))))..............(((((......))))).)))))))))))......((((..(((((.(..(.(((((.........(((((((((((((.....((....))...))))))))))).)).))))).)))))))..)))))))..))))))((((((((((((....))))))))))))))))))..)))))))))).))..))))....(((((....)))))..)))))).)))))).........).))))))))...((((((.(((..(....)..))).)))))).((((.(((..(...((((((.((((.((............)).)))).)))))).)..)))..))))...)))))).)))..))))))...))))))))((..(((((((((.((((.....(((.((((((((......))))...(((.((((.(((.....(((.(((((((((((((.(((((.(((((..........(((((.((((.......((((((.(((..((.((.(((((.(((((....((((((((.(((((....((((((((.......(((((((......)))))))))).)))))..((((((((......((((((((.((((((((.((((((((((..((((((..((((((....)))))).)))))).((((....))))..))).))...))))))))))))).(((((.(..(((.((((((......................)))))).)))..)))))).((((..((((((..((((((((((.....)))))))))))))))).)))).((.((((((((..((....))..))))))))..)).(((((....))).))(((((...)))))..............))))))))))))))))........................(((((((...(((.((.....((((((.(((......(((....)))((((((....)))))).........))).)))))).....)))))...))))))))))))))))))))(((......))))))))...(((((.....)))))..))))).)).))))).))))))..)))).)))))....)))))))))))))))).........))))).)))))...))).)))).))).)))).)))....)))))))))))))..)).((((((...))))))(((((((((((.........)))))))))))..))))))))))))))).)))......(((.(((.((((((....)))))).))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{{.((((((((((((...)))))),...((((.(((((.,,.....,{{{{,{(({((.,{{||||||}}}}{{{{,,..}}}}.,,,,,||.{(((..{{{|,..,))}),,)))).}},}},(((((((({{.......))...))))))))...............,,...((((((((.,,((((((..(((.{((((,.{(((,.(((({............{(((((.(((((((((({...,,((((,,.,,||}}..,,.((((.((((((((.(...(((((..(((((.((((.(((((((((((.((((((((.({{,.....)).)))))))).)))...{.((((.(((((((....))))))))))){|,{((((((((..(((((,(((((((({(((((((......))).))))))))))))....{((((((((.((({(((.(((..(((((......(((((.(((((...((((((({..{{(...}}}.{|(((.(((((.(((((((((({{,.......,,...{..(((((((..(((.{.(.(((((((((((......)))))))).))).}.,.))).)))))))..}.(((((((...(((((((((..,,(((.,,........}}|,,{{.{{,,((.{((((.,(((((((.,,,,,...{||||.,,.,{{{|{{((((((((((,,......{{{{{..........(((((((.{{.(((........))).}}...)))))))......,,,....,(((({....{({{{{{{{,,,{{{{{{{.((((((.,,({,(((.(((..........))).))),)))))))).}}..{{{...,|,||{(((..,{...........,,}..)}}}}},})}}}}.}}}}}}}}|,..}}))},))))}......}}..})))))))),.{{{{{{.....,{{|||...,{{.((((((.(((((((....(((.....))).,..))))))).)))))).},})))}..)))))}))}}))})))....}}||||||{{,,,,|||||,|||{{||}}||{(((,{(((.,{{{{,{{{{{{{..{(({(((...{{{,...,,...||},||{.,{{||,}}}}|,{{{{{{(({(({..((((....))))....,{(({......,{{{}|||,...}|||||}...|||,.......,,,.........(((((((....))))))).{((((((((....((((.(((((((((....(((.......)))...))).))))))...))))..,.))))))))}.,,...,...,))}}|}....,,}}},}}}.}))))))}}.}}}}}))))}}))}}..|{{{{{..,,,,,)),))))...},,,,,||}}},...)))))))))...(((....))).{{((({.,{{{.....{{|,,|,......,,}}}}}}|.(((.{(......)).))).,}},.))))))...)))))))|.((({,,|,{{,((((({{{({....{{,{(((..((((((.....{{.........}}..))))))))))}}....)).)))),)))).}},}}}}}}}}}))))}}}))))))))))).)}}.),,.})))))))..))))).))))).......)))))))))))..,(((((({....})))))))))).)))))))))))))).,))))))))))}...{{{....}},((((......))))...........))))).))))))).))))).))))}(((((({(((({......{((({,.{(.((((((((((.((((((...{{,,.(((({...(((((....(((((.....))))){(((.{{{{{,,{{{,,,,}}}..|}}|}.}}||,,,,{((,{{(((,,,...|||||((((((.(.....).))))))...........}))))))},.}},))),,,))))))))))))).,,{{|}}}..}}},...((((((..{{{,,.,....{{{(((,{({{{{,.....{({{{.{{{,,..,{{{||.(((((((((((...............))))))))))){(.......||{,,((((((({..((((((.....))))))..|||||||{{{.{{{.,(((((.(((((((((((,{{..((((.(((((...))))).)))),})))),})))))),)))))((((((((((...........(((((((({.....{({......}}}...((((((....(((((((.(((((((.{,......(((((((((((((((...,......,{{,.....))}}.))))))))}..{|,.......,}|..............((((((((((,{{...((({...(((({{(({..,,...||..}})}..})))}...)))).,,,,((((((({..((({......)))).}))))))).,}.)))))..))))).......,,{{,.,,{(({{......)))))))}))}..(((((((((((((((((...))))))))})).)))))))..((((((....))))))....(((((.(.(((.(((((.{(,........))...)))))))).).)))))....}}))))))))))))))..))))))..}.....)))))))))(((..((((((...........))))))..)))...))))))))))..}}}}||{,,,|||.,,)))}},}}...,........,,,,{,{((..,,,.,|.,}}}))..,}))),))))}}}}}}))))))),))}}))||{|,....))))(((((((((((((((((((((({{{{({(((((((.....))))))).(((((((((((((.((((.((((((((..{(((((((.............((((..(((,.,,(({(((((.((.((((({(({,...,,.{{((({,...})))))}.,...}),))))))}((({(((((((((......((((....))))......{{{((.{.,.((((((((........)))))))).}.}))))).))))))))).)))}....)).))))}.))).,..)))..)))))))))))}.((((....)))))))))))).)))).})))))...)))))))....}))))))).)))).)))),,,,,.,,,..,,.{{{{|,.....))))).))))))))))),,,...(((({.(({((.{..(.(((({.........{{(((((((((((..,..({...,},.,.))))))))))).)).))))).)}))))).,))))}))}})))))}((((((((((((....))))))))))))))))))..)))))))))).)),}))},....(((((....)))))..)))))).)))))).........).))))))))...)))).},)}}},,,.,,)))))))..)))).)))))}.....,..((((((.((((.((............)).)))).))))))...}))))...,.)}))))))}.)))..)))))).,,)))))))){{..((((((((,{((((.....(((.(((({(({,.....}))}...(((.((((.(((.....(((.(((((((((((({,(((((.(((((..........(((((.(,,({{{{...((((((.(((..((.{{.(((((.(((((....((((((((((((((,...{{({{{({......{(((((((......)))))))),}.}}}}}..(((((({,....,{((((((((.((((((((,{((((((,((.,((((((..((((({....}))))).)))))),||||,}..||||,,||}.,}...}})}))))))))}.(((((.(..(((.((((((..,.................,.)))))).)))..)))))).((((..((((((..((((((((((.....)))))))))))))))).)))).((.((((((((.,{(....}}.}))))))))..)).{{(((....))).))(((((...)))))..............)))))))))))))))).,........,....||.....,,{((((((...(((.{{.....((((((.(((,...,,(({....}}}((((((....))))))..,,.....))).)))))).....}))))...))))))))))))))))))))(((......))))))))...(((((.....)))))..))))).}}.))))).)))))).,)))).)))))....)))))))))))))))}........,))))).))))).,,))).)))).))).)))).)))....)))))))))))))..}}.((((((...))))))(((((((((((.........)))))))))))}.)))))))))}))))).}},......(((.(((.((((({....}))))).))).))}..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001371077.1 NCBI
AACCAGAGUCUUCGGUGUUAAUUCCCUGGUCUUCCCAACUAGCAUUCUG… 4592 nt 0.3722
NM_001371078.1 NCBI
AACCAGAGUCUUCGGUGUUAAUUCCCUGGUCUUCCCAACUAGCAUUCUG… 1974 nt 0.3774
NM_001371079.1 NCBI
AGGACUGCAGUGUAGGACUUUCCUGCAGAAUACCAUUUGAUCCUAUUAA… 1878 nt 0.3738
NM_001371080.1 NCBI
AGAUGUCAGGAUAACCUUAAGGAUAGAUGAAGGGUUGAGAGCCUGUGCC… 1584 nt 0.3763
NM_001371081.1 NCBI
AGAUGUCAGGAUAACCUUAAGGAUAGAUGAAGGGUUGAGAGCCUGUGCC… 2065 nt 0.3821
Showing 11 to 15 of 15 entries
Summary

The protein encoded by this gene is the fourth major glycoprotein of the platelet surface and serves as a receptor for thrombospondin in platelets and various cell lines. Since thrombospondins are widely distributed proteins involved in a variety of adhesive processes, this protein may have important functions as a cell adhesion molecule. It binds to collagen, thrombospondin, anionic phospholipids and oxidized LDL. It directly mediates cytoadherence of Plasmodium falciparum parasitized erythrocytes and it binds long chain fatty acids and may function in the transport and/or as a regulator of fatty acid transport. Mutations in this gene cause platelet glycoprotein deficiency. Multiple alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2014]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CD36 is a marker for capillary endothelial cells involved in trans-endothelial lipid processing within brown adipose tissue [Behrens et al. DOI:10.1016/j.molmet.2025.102252]. In human skin, the CD36 was identified as a scavenger receptor marker expressed in an immune cell cluster within wound-edge tissues [Liu et al. DOI:10.1016/j.stem.2024.11.013]. A study in rats demonstrated that the CD36 was significantly down-regulated in liver tissue on day 2 following a 20% total body surface area burn injury, indicating its role in altered lipid catabolism during the metabolic response to trauma [Jayaraman et al. DOI:10.1016/j.jss.2007.05.025]. In a separate investigation in mice, the CD36 was identified as over-expressed in liver tissue following Kupffer cell-specific, endothelial cell-specific, and neutron exposures to radiation, as noted in comparative analyses with other hepatotoxicants [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078].