Basic Information

Symbol
CD8A
RNA class
mRNA
Alias
CD8 Subunit Alpha T-Cell Surface Glycoprotein CD8 Alpha Chain CD8alpha P32 T-Lymphocyte Differentiation Antigen T8/Leu-2 CD8 Antigen, Alpha Polypeptide (P32) CD8a Molecule CD8 Leu2 T-Lymphocyte Antigen OKT8 T-Cell Antigen T-Cell Antigen Leu2 T Cell Co-Receptor T8 T-Cell Antigen CD8a Antigen IMD116 Leu2 MAL
Location (GRCh38)
2:86784610-86808396
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001768.7
Sequence length
2106.0 nt
GC content
0.5256

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-747.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -782.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 397.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145873.1 NCBI
CUCUGUAAAAUAAAUGCGCUGGGCCGGAUCUUUUCUGAGUUCUCUUCUC… 3177 nt 0.5345
NM_001382698.1 NCBI
GAUUUGCGCAGAAUGAGCGGCUGAGGAUGGAAGGGCUGCAAGAUCCACC… 3031 nt 0.5572
NM_001768.7 NCBI
AACUUUCCCCCCUCGGCGCCCCACCGGCUCCCGCGCGCCUCCCCUCGCG… 2106 nt 0.5256
NM_171827.4 NCBI
AACUUUCCCCCCUCGGCGCCCCACCGGCUCCCGCGCGCCUCCCCUCGCG… 1995 nt 0.5228
Summary

The CD8 antigen is a cell surface glycoprotein found on most cytotoxic T lymphocytes that mediates efficient cell-cell interactions within the immune system. The CD8 antigen acts as a coreceptor with the T-cell receptor on the T lymphocyte to recognize antigens displayed by an antigen presenting cell in the context of class I MHC molecules. The coreceptor functions as either a homodimer composed of two alpha chains or as a heterodimer composed of one alpha and one beta chain. Both alpha and beta chains share significant homology to immunoglobulin variable light chains. This gene encodes the CD8 alpha chain. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. The major protein isoforms of this gene differ by the presence or absence of a transmembrane domain and thus differ in being a membrane-anchored or secreted protein. [provided by RefSeq, May 2020]

Forensic Context

A study in humans identified the CD8A as a core immune-related differentially expressed gene significantly downregulated in patients with severe burns and blunt trauma [Chen et al. DOI:10.3389/fgene.2022.1038222]. Its downregulation was negatively correlated with upregulated NKT cells and was associated with a worse prognosis in burn patients, while receiver operating characteristic curve analysis indicated the CD8A has good diagnostic potential for both conditions. A study in human skin tissue demonstrated that the proportion of CD8+ T cells was significantly lower in burn tissue compared to non-burn skin [Labuz et al. DOI:10.7554/eLife.82626].