Basic Information

Symbol
ACVR1B
RNA class
mRNA
Alias
Activin A Receptor Type 1B ALK4 SKR2 ACVRLK4 ActRIB Serine/Threonine-Protein Kinase Receptor R2 Activin Receptor-Like Kinase 4 Activin A Receptor, Type IB Activin Receptor Type-1B EC 2.7.11.30 Activin A Receptor, Type II-Like Kinase 4 Activin Receptor Type IB EC 2.7.11 ACTR-IB ALK-4
Location (GRCh38)
12:51951679-51997082
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004302.5
Sequence length
4531.0 nt
GC content
0.5257

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1661.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1747.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1059.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001412774.1 NCBI
GGGCGCUGCUGGGCUGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGUGGUUACUAUGG… 4651 nt 0.5248
NM_001412775.1 NCBI
GGGCGCUGCUGGGCUGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGUGGUUACUAUGG… 4528 nt 0.5256
NM_001412776.1 NCBI
GGGCGCUGCUGGGCUGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGUGGUUACUAUGG… 4390 nt 0.5253
NM_001412777.1 NCBI
GGGCGCUGCUGGGCUGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGUGGUUACUAUGG… 4300 nt 0.5267
NM_001412778.1 NCBI
GGGCGCUGCUGGGCUGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGUGGUUACUAUGG… 4740 nt 0.5249
NM_001412779.1 NCBI
GGGCGCUGCUGGGCUGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGUGGUUACUAUGG… 4608 nt 0.5252
NM_001412780.1 NCBI
GGGCGCUGCUGGGCUGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGUGGUUACUAUGG… 4663 nt 0.5254
NM_001412781.1 NCBI
GGGCGCUGCUGGGCUGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGUGGUUACUAUGG… 4894 nt 0.5249
NM_001412782.1 NCBI
GGGCGCUGCUGGGCUGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGUGGUUACUAUGG… 4249 nt 0.5300
NM_001412784.1 NCBI
GGGCGCUGCUGGGCUGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGUGGUUACUAUGG… 4132 nt 0.5269
Showing 1 to 10 of 14 entries
Summary

This gene encodes an activin A type IB receptor. Activins are dimeric growth and differentiation factors which belong to the transforming growth factor-beta (TGF-beta) superfamily of structurally related signaling proteins. Activins signal through a heteromeric complex of receptor serine kinases which include at least two type I and two type II receptors. This protein is a type I receptor which is essential for signaling. Mutations in this gene are associated with pituitary tumors. Alternate splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Jun 2010]

Forensic Context

A single-cell transcriptomic analysis in a rat model of radiation-induced lung injury identified the ACVR1B as an orthologous rat gene associated with inflammatory processes [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357].