Basic Information

Symbol
CDC45
RNA class
mRNA
Alias
Cell Division Cycle 45 CDC45L2 CDC45L Cell Division Control Protein 45 Homolog Human CDC45 PORC-PI-1 CDC45 (Cell Division Cycle 45, S.Cerevisiae, Homolog)-Like CDC45 Cell Division Cycle 45-Like (S. Cerevisiae) Cell Division Cycle 45 Homolog (S. Cerevisiae) CDC45 Cell Division Cycle 45 Homolog CDC45 Cell Division Cycle 45-Like Cell Division Cycle 45 Homolog Cell Division Cycle 45-Like 2 CDC45-Related Protein MGORS7
Location (GRCh38)
22:19479457-19520612
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003504.5
Sequence length
1879.0 nt
GC content
0.5125

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-653.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -687.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 408.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001178010.2 NCBI
AAAGAAAGGAAGGCUGGGAACUAAGAAGCUAUUGGUUGGUGAUCCCUGG… 2094 nt 0.5143
NM_001178011.2 NCBI
AAAGAAAGGAAGGCUGGGAACUAAGAAGCUAUUGGUUGGUGAUCCCUGG… 1860 nt 0.5199
NM_001369291.1 NCBI
AGACUGCCUCUGCUUCAGCCAUCGAGGACUCGGGCGGAACUAAGCUACA… 1885 nt 0.5045
NM_003504.5 NCBI
GGGCUCUUGGUACCUCAGCGCGAGCGCCAGGCGUCCGGCCGCCGUGGCU… 1879 nt 0.5125
Summary

The protein encoded by this gene was identified by its strong similarity with Saccharomyces cerevisiae Cdc45, an essential protein required to the initiation of DNA replication. Cdc45 is a member of the highly conserved multiprotein complex including Cdc6/Cdc18, the minichromosome maintenance proteins (MCMs) and DNA polymerase, which is important for early steps of DNA replication in eukaryotes. This protein has been shown to interact with MCM7 and DNA polymerase alpha. Studies of the similar gene in Xenopus suggested that this protein play a pivotal role in the loading of DNA polymerase alpha onto chromatin. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2013]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CDC45 mRNA was down-regulated (0.31-fold) in bone marrow cells 6 hours after a 6.5 Gy whole-body ionizing radiation exposure [Dai et al. DOI:10.1080/09553000600857389].