Basic Information
Symbol
CDK2
RNA class
mRNA
Alias
Cyclin Dependent Kinase 2
Cell Division Protein Kinase 2
Cyclin-Dependent Kinase 2
P33 Protein Kinase
EC 2.7.11.22
CDKN2
Cdc2-Related Protein Kinase
P33(CDK2)
EC 2.7.11
Location (GRCh38)
12:55966781-55972789
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
Cause of death analysis
MANE select
Transcript ID
NM_001798.5
Sequence length
2240.0 nt
GC content
0.4772
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-706.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-747.21 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
703.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AUUGUUUCAAGUUGGCCAAAUUGACAAGAGCGAGAGGUAUACUGCGUUC… | 2060 nt | 0.4743 | |
| AUUGUUUCAAGUUGGCCAAAUUGACAAGAGCGAGAGGUAUACUGCGUUC… | 2240 nt | 0.4772 | |
| AUUGUUUCAAGUUGGCCAAAUUGACAAGAGCGAGAGGUAUACUGCGUUC… | 2138 nt | 0.4743 |
Summary
This gene encodes a member of a family of serine/threonine protein kinases that participate in cell cycle regulation. The encoded protein is the catalytic subunit of the cyclin-dependent protein kinase complex, which regulates progression through the cell cycle. Activity of this protein is especially critical during the G1 to S phase transition. This protein associates with and regulated by other subunits of the complex including cyclin A or E, CDK inhibitor p21Cip1 (CDKN1A), and p27Kip1 (CDKN1B). Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2014] CIViC Summary for CDK2 Gene
Forensic Context
A study in rats demonstrated that the CDK2 was downregulated in left ventricular tissues from an ischemic cardiomyopathy model created via coronary artery ligation [Wang et al. DOI:10.1007/s12031-018-1066-6]. In human post-mortem tissue analysis, the CDK2 was downregulated in the lungs as part of the inhibited telomere maintenance pathway in septic shock [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].