Basic Information

Symbol
CEACAM5
RNA class
mRNA
Alias
CEA Cell Adhesion Molecule 5 CD66e CEA Carcinoembryonic Antigen-Related Cell Adhesion Molecule 5 Carcinoembryonic Antigen Related Cell Adhesion Molecule 5 Cell Adhesion Molecule CEACAM5 Meconium Antigen 100 Carcinoembryonic Antigen CD66e Antigen
Location (GRCh38)
19:41708585-41730519
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004363.6
Sequence length
3501.0 nt
GC content
0.4847

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1049.35 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1105.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 705.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001291484.3 NCBI
AGAGGGAGGAAGGACAGCAGACCAGACAGUCACAGCAGCCUUGACAAAA… 3475 nt 0.4858
NM_001308398.2 NCBI
AGAGGGAGGAAGGACAGCAGACCAGACAGUCACAGCAGCCUUGACAAAA… 2248 nt 0.5227
NM_004363.6 NCBI
AGAGGGAGGAAGGACAGCAGACCAGACAGUCACAGCAGCCUUGACAAAA… 3501 nt 0.4847
Summary

This gene encodes a cell surface glycoprotein that represents the founding member of the carcinoembryonic antigen (CEA) family of proteins. The encoded protein is used as a clinical biomarker for gastrointestinal cancers and may promote tumor development through its role as a cell adhesion molecule. Additionally, the encoded protein may regulate differentiation, apoptosis, and cell polarity. This gene is present in a CEA family gene cluster on chromosome 19. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2015]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.