Basic Information

Symbol
ADAM11
RNA class
mRNA
Alias
ADAM Metallopeptidase Domain 11 MDC Metalloproteinase-Like, Disintegrin-Like, And Cysteine-Rich Protein Disintegrin And Metalloproteinase Domain-Containing Protein 11 ADAM 11 Metalloproteinase-Like, Disintegrin-Like, Cysteine-Rich Protein A Disintegrin And Metalloproteinase Domain 11
Location (GRCh38)
17:44758988-44781846
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002390.6
Sequence length
4614.0 nt
GC content
0.6248

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2104.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2173.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1315.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001318933.2 NCBI
AACCCGGCCCCGCCGCCCCGCCGGGAUGGCCGCGGCCGGAGCGCGCUGA… 4610 nt 0.6247
NM_002390.6 NCBI
AACCCGGCCCCGCCGCCCCGCCGGGAUGGCCGCGGCCGGAGCGCGCUGA… 4614 nt 0.6248
Summary

This gene encodes a member of the ADAM (a disintegrin and metalloprotease) protein family. Members of this family are membrane-anchored proteins structurally related to snake venom disintegrins, and have been implicated in a variety of biological processes involving cell-cell and cell-matrix interactions, including fertilization, muscle development, and neurogenesis. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature protease. This gene represents a candidate tumor suppressor gene for human breast cancer based on its location within a minimal region of chromosome 17q21 previously defined by tumor deletion mapping. Alternative splicing results in multiple transcript variants, at least one of which encodes an isoform that is proteolytically processed. [provided by RefSeq, Jan 2016]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.