Basic Information

Symbol
CETN2
RNA class
mRNA
Alias
Centrin 2 CEN2 CALT Centrin, EF-Hand Protein, 2 Centrin-2 Caltractin (20kD Calcium-Binding Protein) Caltractin Isoform 1
Location (GRCh38)
X:152826994-152830782
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004344.3
Sequence length
1413.0 nt
GC content
0.4105

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-365.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -393.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 367.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004344.3 NCBI
AGUGUACACGUCGGUUGCCUAACAACCGGCAGCGGACUCCUUUGGCUAU… 1413 nt 0.4105
Summary

Caltractin belongs to a family of calcium-binding proteins and is a structural component of the centrosome. The high level of conservation from algae to humans and its association with the centrosome suggested that caltractin plays a fundamental role in the structure and function of the microtubule-organizing center, possibly required for the proper duplication and segregation of the centrosome. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the CETN2 gene was downregulated in lung tissue as part of the inhibited cilium assembly and cell cycle pathways in sepsis patients compared to uninfected controls [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].