Basic Information

Symbol
CFLAR
RNA class
mRNA
Alias
CASP8 And FADD Like Apoptosis Regulator I-FLICE Casper C-FLIP CLARP CASH MRIT CASP8 And FADD-Like Apoptosis Regulator CASP8AP1 FLAME CFLIP FLIP Caspase-Like Apoptosis Regulatory Protein Cellular FLICE-Like Inhibitory Protein FADD-Like Antiapoptotic Molecule 1 MACH-Related Inducer Of Toxicity Caspase-Eight-Related Protein Inhibitor Of FLICE Caspase Homolog FLAME-1 Testis Secretory Sperm-Binding Protein Li 233m Caspase-Related Inducer Of Apoptosis Usurpin Beta C-FLIPL C-FLIPR C-FLIPS Usurpin FLAME1
Location (GRCh38)
2:201116154-201176687
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003879.7
Sequence length
14612.0 nt
GC content
0.4406

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-5113.43 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -5463.21 kcal/mol
Frequency: 3.37311e-247
Diversity: 1803.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
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AGAGGUUCUCGGACGCCCUCCGGCGAAGCCACCUGUUGAUGCUUUUGAC… 14480 nt 0.4390
NM_001127184.4 NCBI
ACACAAGCCAUAGCAGGAAACAGCGAGCUUGCAGCCUCACCGACGAGUC… 1284 nt 0.4712
NM_001202515.1 NCBI
ACCUUGGACUGAACCACUAUUGAAGAUUUAUUUGAUAAUAAUUUGUAAG… 9734 nt 0.4310
NM_001202516.3 NCBI
ACACAAGCCAUAGCAGGAAACAGCGAGCUUGCAGCCUCACCGACGAGUC… 14507 nt 0.4408
NM_001202517.3 NCBI
ACACAAGCCAUAGCAGGAAACAGCGAGCUUGCAGCCUCACCGACGAGUC… 14194 nt 0.4392
NM_001202518.2 NCBI
AGAAACUGUUAGUUGGCAAAGGAUGUACCAUCUCCUAUUAAACGGGCAA… 10960 nt 0.4329
NM_001202519.3 NCBI
ACACAAGCCAUAGCAGGAAACAGCGAGCUUGCAGCCUCACCGACGAGUC… 11030 nt 0.4379
NM_001308042.3 NCBI
AGAUGUUCCACUGAGAACAUCAGAAGCACUAAUGGCAAUUGCUGCCAUG… 11686 nt 0.4362
NM_001308043.2 NCBI
ACACAAGCCAUAGCAGGAAACAGCGAGCUUGCAGCCUCACCGACGAGUC… 4659 nt 0.5321
NM_001351590.2 NCBI
ACACAAGCCAUAGCAGGAAACAGCGAGCUUGCAGCCUCACCGACGAGUC… 11448 nt 0.4397
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Summary

The protein encoded by this gene is a regulator of apoptosis and is structurally similar to caspase-8. However, the encoded protein lacks caspase activity and appears to be itself cleaved into two peptides by caspase-8. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene, and partial evidence for several more variants exists. [provided by RefSeq, Feb 2011] CIViC Summary for CFLAR Gene

Forensic Context

A study in human cadavers demonstrated that the CFLAR was up-regulated (2.6944 fold) in decaying liver tissues compared to a 6-hour control as part of the apoptotic thanatotranscriptome, where pro-apoptotic genes like caspases were up-regulated and anti-apoptotic genes were down-regulated over a 48-hour postmortem interval [Javan et al. DOI:10.1007/S12024-015-9704-6].