Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001127184.4
Sequence Length
1284 nt
GC Content
0.4712
ACACAAGCCAUAGCAGGAAACAGCGAGCUUGCAGCCUCACCGACGAGUCUCAACUAAAAGGGACUCCCGGAGCUAGGGGUGGGGACUCGGCCUCACACAGUGAGUGCCGGCUAUUGGACUUUUGUCCAGUGACAGCUGAGACAACAAGGACCACGGGAGGAGGUGUAGGAGAGAAGCGCCGCGAACAGCGAUCGCCCAGCACCAAGUCCGCUUCCAGGCUUUCGGUUUCUUUGCCUCCAUCUUGGGUGCGCCUUCCCGGCGUCUAGGGGAGCGAAGGCUGAGGUGGCAGCGGCAGGAGAGUCCGGCCGCGACAGGACGAACUCCCCCACUGGAAAGGAUUCUGAAAGAAAUGAAGUCAGCCCUCAGAAAUGAAGUUGACUGCCUGCUGGCUUUCUGUUGACUGGCCCGGAGCUGUACUGCAAGACCCUUGUGAGCUUCCCUAGUCUAAGAGUAGGAUGUCUGCUGAAGUCAUCCAUCAGGUUGAAGAAGCACUUGAUACAGAUGAGAAGGAGAUGCUGCUCUUUUUGUGCCGGGAUGUUGCUAUAGAUGUGGUUCCACCUAAUGUCAGGGACCUUCUGGAUAUUUUACGGGAAAGAGGUAAGCUGUCUGUCGGGGACUUGGCUGAACUGCUCUACAGAGUGAGGCGAUUUGACCUGCUCAAACGUAUCUUGAAGAUGGACAGAAAAGCUGUGGAGACCCACCUGCUCAGGAACCCUCACCUUGUUUCGGACUAUAGAGUGCUGAUGGCAGAGAUUGGUGAGGAUUUGGAUAAAUCUGAUGUGUCCUCAUUAAUUUUCCUCAUGAAGGAUUACAUGGGCCGAGGCAAGAUAAGCAAGGAGAAGAGUUUCUUGGACCUUGUGGUUGAGUUGGAGAAACUAAAUCUGGUUGCCCCAGAUCAACUGGAUUUAUUAGAAAAAUGCCUAAAGAACAUCCACAGAAUAGACCUGAAGACAAAAAUCCAGAAGUACAAGCAGUCUGUUCAAGGAGCAGGGACAAGUUACAGGAAUGUUCUCCAAGCAGCAAUCCAAAAGAGUCUCAAGGAUCCUUCAAAUAACUUCAGGAUGAUAACACCCUAUGCCCAUUGUCCUGAUCUGAAAAUUCUUGGAAAUUGUUCCAUGUGAUUAACAUGGAACUGCCUCUACUUAAUCAUUCUGAAUGAUUAAAUCGUUUCAUUUUCUAAAUGUGUUAUAAUGUGUUUAGCCCUUUCUUGUUGCUGUAUGUUUAGAUGCUUUCCAAUCUUUUGUUACUACUAAUAAUGCUAUAAAAUAAAUAUCCUUGUACUUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-410.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -434.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 284.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((..(((((((((((((..((((.((((((((((((...(((((((........)))))))((.......)))))))))...(((((((((...))))).))))((((((((((....)))))))...))).....(((((((((.((((..((.(.((.(((((((((((((.(((.....)))...((((((((((.((((((...(.(((.....(((((((.....(((((((((((((((...((((((((.((((((((((....((.((((.(......((((.(.((((((((((((((((((.(((.(((.((...))...))))))............(((((((..(((....))).)))))))(((....))).)))))))).).)).))))).)).).))))....)))))))..)))))))))).).((((((((...((((.((....(((((.(((((((.(......))))))))...)))))..)).)))).)))))))).....)))))))........((((.(((((((........((((((..(((..((((((.(((((.........))))).))))))..)))..)))))).)))))))))))..((((.(((........)))))))...)))))))..))))))))......(((.((((....))))..))).)))))))....))).)...))))))...).))))))..))).((((((((((((((((((((....)))))...))))))))))))))).((((((........))))))..((((((.......((((((((((.(.((((((((((((.((((((..((((((((.....((((((.....))))))...((((((((.((((........))))......((..(((.......)))..))...))))))))..(((.......(((((((...))))))).......))).......))))))))....))).))).))).))).)))))).)))))........((((((((((..............))))))))))........))))))......(((((((((.....)))))))))))))))...(((((((((...)))))))))..)))))).))))))).)).).))....)))).........)))))))))))))).))))...)).)))))......((((((....))))))))))))............))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{((((..((((((((((({(,{((((.(((((({{(((({..(((((((........))))))){{,|.,...|||||||||,{{(((((((((...))))).))))|,((((((((....)))))))},,{}|||,{.(((({{(,(((.((((((((((({.(((((.((((,(((,.{{..,{{{..|,,...,,.....},,)})}}},.)))))))..})))),|)))))).)))))))}{|{.,.((((((((.((((((((((....((.((((.{.,.,..((((.,.((((((((((((((((((.{{,.(((.(,...))...))}|||,....,,.....(((((((..(((....))).)))))))(((....))).)))))))).,,)))))))).)).}.))))....)))))))..)))))))))).).((((((((.,,{(((.((....(((((.(((((({,(......))))))))...)))))..)).)))).)))))))).....))))))).),))),.||||}||(((((|,......{{{{||,,||(,{{(({{{.,{{{|.,,,..,,,))))),))))}}..))),,)}}||||||||,||||,,.,||||(((((((((((.(((((((.....{{(({.,.}}}}||,,.,...,((,((((....)))},,}}},{{{...}}}...((((((((((.((((..(((.((.((((..((((((((((((((((((((....)))))...)))))))))))))))..))))..)).)))..)))).))))))))))....((((((..((({...))))...)))))){(((((.{(((.(.{((((....))))}.}.)))}.)))))}((((((.((((........)))).}),.})))...((((((({{((...{{............}}.....)}))))))))...)))))))..}}}}},...(((.((((||...,}.)))).)))...,,,,{{,(((((((..((((.......((((((((((..,,.....,,...))))))))))..)))).)))))))),....(((((((((.....))))))))).}})))...{((((((({...})))))))),,}}}}}}}}}},,,||||||,,.....,,,)))))))},,,}))))},)))))).))))...)).)))))......{(((((....)))))}))))))............))))).....
Back