Basic Information

Symbol
CFP
RNA class
mRNA
Alias
Complement Factor Properdin PFC Properdin P Factor, Complement Complement Factor P PROPERDIN Properdin BFD PFD
Location (GRCh38)
X:47621537-47630305
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001145252.3
Sequence length
2489.0 nt
GC content
0.6083

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1040.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1083.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 538.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145252.3 NCBI
CUCUUUCCCUGCUGAUUCCAGGAGCCUAUCAACCCAGAUAAAGCGGGAC… 2489 nt 0.6083
NM_002621.2 NCBI
GAGCACCGCACACUCACUUCACCCUGGUUCAACACCCCCACGAGGUUGA… 1785 nt 0.5994
Summary

This gene encodes a plasma glycoprotein that positively regulates the alternative complement pathway of the innate immune system. This protein binds to many microbial surfaces and apoptotic cells and stabilizes the C3- and C5-convertase enzyme complexes in a feedback loop that ultimately leads to formation of the membrane attack complex and lysis of the target cell. Mutations in this gene result in two forms of properdin deficiency, which results in high susceptibility to meningococcal infections. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified.[provided by RefSeq, Feb 2009]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.