Basic Information

Symbol
CHAD
RNA class
mRNA
Alias
Chondroadherin SLRR4A Cartilage Leucine-Rich Protein Chondroadherin Proteoglycan
Location (GRCh38)
17:50464496-50468976
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001267.3
Sequence length
1705.0 nt
GC content
0.6041

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-594.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -622.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 557.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001267.3 NCBI
AGGACUCGCCGCUGCCCGCGCCCCGCCGCCGCUGCUGCCCCCAGCCCCG… 1705 nt 0.6041
Summary

Chondroadherin is a cartilage matrix protein thought to mediate adhesion of isolated chondrocytes. The protein contains 11 leucine-rich repeats flanked by cysteine-rich regions. The chondroadherin messenger RNA is present in chondrocytes at all ages. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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