Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001267.3
Sequence Length
1705 nt
GC Content
0.6041
AGGACUCGCCGCUGCCCGCGCCCCGCCGCCGCUGCUGCCCCCAGCCCCGGCCCCAGGCGUCCCAGCCAUGGUCCGCCCAAUGCUCUUGCUCAGCCUCGGCCUCCUGGCUGGUCUGCUGCCGGCGCUGGCCGCCUGCCCCCAGAACUGCCACUGCCACAGCGACCUGCAGCACGUCAUCUGCGACAAGGUGGGGCUGCAGAAGAUCCCCAAGGUGUCAGAGAAGACCAAGCUGCUCAACCUACAGCGCAACAACUUCCCGGUGCUGGCUGCCAAUUCGUUCCGGGCCAUGCCGAACCUCGUGUCAUUGCACCUGCAGCACUGCCAGAUCCGCGAGGUGGCCGCCGGUGCCUUCCGCGGCCUCAAGCAACUUAUCUACUUGUACCUGUCCCAUAACGACAUCCGCGUGCUGCGCGCAGGUGCCUUCGACGACCUGACCGAGCUGACCUACCUCUACCUGGACCACAACAAGGUCACUGAGCUGCCCCGGGGGUUGCUCUCCCCGCUGGUCAACCUCUUCAUCUUGCAGCUCAACAACAACAAGAUCCGUGAGCUGCGCGCAGGCGCCUUCCAGGGAGCCAAGGACCUGCGCUGGCUCUACCUGUCGGAAAACGCGUUGAGCUCCCUGCAGCCCGGGGCCCUGGACGACGUGGAGAACCUCGCCAAAUUCCACGUGGACAGGAACCAGCUGUCCAGCUACCCCUCAGCUGCCCUGAGCAAGCUACGGGUGGUGGAGGAGCUGAAGCUGUCCCACAACCCCCUGAAAAGCAUCCCGGACAAUGCCUUCCAGUCCUUUGGCAGAUACCUGGAGACCCUCUGGCUGGACAACACCAACCUGGAGAAGUUCUCAGAUGGUGCCUUCCUGGGUGUAACCACGCUGAAACACGUCCAUUUGGAGAACAACCGCUUGAACCAGCUACCCUCCAACUUCCCCUUCGACAGCCUGGAGACCCUCGCCCUUACCAAUAACCCCUGGAAGUGUACCUGCCAGCUCCGGGGCCUUCGGCGGUGGCUGGAAGCCAAGGCCUCCCGCCCAGAUGCCACCUGUGCCUCACCUGCCAAGUUCAAGGGCCAGCACAUCCGUGACACGGACGCCUUCCGCAGCUGCAAGUUCCCCACCAAGAGGUCCAAGAAAGCUGGCCGCCAUUAAACAGGUUCUGACCCAGCCAGUCCUGGUGACUGGCCUCUGCCUUCCACCGGAGAGACUACUGACCUUCUCACCUCCACCCAUACCUUCUCCCCACAGCCUCUGCUGAUGCACAGAGCUGCCUACACCUAGACACGUCCUGGCAGGGGGCCUCGGGCACUCCACUACCAACCCAGCUCCACCCAGCAGUGUCCUGGGGAGAAGGAAGGCUGAGCCUCUCCCCAGCCUUCAUGCCUUCCCCACCCUCCAGCUCCUCUUGGAGAAGCUGUUGCUGAGACCCCCCCCCCAAGUCAAUCAGAACCACAACAGGUUGGUCAUCAGGAUGGCCACCCUCCCAGGAUCAUCCUUCCUCUGUUCCUCUUUCCCUGCCACGUGGAAACAAUCAUCAGAUCCUUGCCCCACCCCUUGCUUCCAGAAAGGGUUUUAAAGCCCAUGCCCCAACUCUGCCAGCCCCCACCUGCCAGGACGUUCUAGCAGGACAUCGGUGCUUUGCUGUCCAUCUUCCCAUGCUGCAAUUUCUUCCUGAGAUUUCUAUAAAUAUAAAUGUAUGUAUGUAUUAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-594.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -622.99
Frequency: 0.0000
Diversity: 557.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.((.(((((..((..((.((((((((((..(((((((((..(((...((((((((...(.(((((((((...((((...(((..(((((..((((....))))((((.((((..((((.((((...(((....)))....)))).)))).)))))))).(((((..(((.(((..((((...(((((((.....))..)))))...))))..))).)))...))))).........(((((............)))))))))).)))..)))).))))))))).)..((((((((...(((.....(((....))))))...))))))))((((((.((......))))))))...................((((((((.(((..(((.(....))))..)).).))))))))....)))).)))).))).))))...............((((.......))))..((((((((...((((((((.((........)).)))))))).......))))))))...............(.((((((...(((((.(((((((((((......((....(((..(((((((.((((((((.....((((.((..(((((.....)))))..)).))))((((((((............))))))))((((((.......))))))((((....(((((.....)))))..))))..(((.(((((((((((((((((.((..................(..(((.((....((((............))))....)).)))..).((((((.(((......))).)).))))..((((((((((((.((.....(.(((((....))))).).....)))))))).)))))).)).))))....)))))..))))).))).))).))))))))..))))).))..))).....))......))))))))).)).)))))))))))))))))...)))))))))).))..)).(((((.((((((...((((....(((.((((...((....)).....)))))))..)))).)))....))).)))))..))))).)).)))))........(((((...((((.(((((..(((........)))......))))).((((((((((...(((....)))...))))))...)))).......)))).)))))...................((((((.(((....))).)).)))).......(((((.((((((((((((((((....(((((.......((((((((((((.(((......)))...(((((((...((((((((..........)))))))).....)))))))..((((((......)))))).)))))...(((((((...........)))..))))..........)))))))....(((((((((.........)).)))))))...((((......((((((......).))))).......))))....)))))........(((..((((..((((............))))....))))..))).))).))))))))))))))))))..(((((.(((....))).))))).......((((((((((((((.....)))))...............)))).))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((,.({.((((,..(((((..{,.((((..((((....))))..))))..,.))))}.,||||,,,|||||({{,.{{(,{,{{{{,.{{,...{|{,,|{||||}|(((.((((..((((.((((.,.(((....)))..,.)))).)))).)))))))}{((((,,.{{{..|||,|,{,{(((((((((({(({,{..,,.,,,{(,|||{{{{|.{||{,.{({(|........,|||{{.....,,,,.,{|||||(((,{{{{...,{{{,,{(||...})))}}}.,,((({,...(({{{{{{,|||,.||,||..,||||}||}((((({{((......)))))))).,.,{,...........,,||,,,((((.......}}}}...}))}}})),),))))))))....}}}},,.||{{{,{({{({{{{..........||,,,......})))),..((((.((({.,,||}}.}}}}.....)})))))){{|||{,...{{{((((((,..............{{(.((((((...(((((.(((((((((((.,....((....(((..(((((((.((((((((.....((((.((..(((((.....)))))..)).))))((((((({............})))))))((((((......,|}}}}}||(({{{{,,.(({{{{...,,)).})))..|||}|||(((((((((({((({({............,,....|,.{{{.((....((((............))))....}),))},...((((((.(((......))).)).))))..((((((((((((,(,.,,,..{{((({...,))})},}....,}.))))))}})))))....}}}}....)))))..)))))}.,,.,,,.))))))))..))))).))..))).....))......))))))))).)).))))))))))))))|({..,,{({({,((({{{..,},,.|))},,)})}}..||.))}..,(((((....{((..........})),...)}})}{((({...})))).||.....))))))))})),,,......}}||))}....||,.|||||},|||........||||{{||.,,.(((((((,,,,,|}}}|||{{{{}||...,,,}))}|||,.....|....}}}},.,...........{{{{{{{{{,((((((,(((....))).)),)))).......,,,(({((,,,((((,,{(((({...(((,.............}}}.}}}}}..}}))..))))).|||||||}}}((((((((.{......,.)))))))).....,,,,,,...({{(({......}))))).|||||,,||||{({{...........)))..))))}}},....}})}))))}},,.{{{{||||{.........)),))})))}...||||..,,,.{{{{{{.,....).))))}.......}})),...,},,,...,,,{,|{{..,||,.,|||{......}},,..}},,....)))),.)))})))})))))))))))))}))))}}))|||,,)).}}..,},.}}}}.......{{{{{{{{((((((.....))))),.........,,,..,))).))))).......
Back