Basic Information

Symbol
CHIT1
RNA class
mRNA
Alias
Chitinase 1 CHIT CHI3 Chitinase 1 (Chitotriosidase) Chitotriosidase-1 EC 3.2.1.14 Plasma Methylumbelliferyl Tetra-N-Acetylchitotetraoside Hydrolase Chitotriosidase Chitinase-1 CHITD
Location (GRCh38)
1:203212827-203273641
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003465.3
Sequence length
2248.0 nt
GC content
0.5560

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-838.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -880.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 741.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256125.2 NCBI
GGUUUGUAUGGGCUGCAGCCUGCCGCUGAGCUGCAUCAUGGUGCGGUCU… 2191 nt 0.5568
NM_003465.3 NCBI
GGUUUGUAUGGGCUGCAGCCUGCCGCUGAGCUGCAUCAUGGUGCGGUCU… 2248 nt 0.5560
Summary

Chitotriosidase is secreted by activated human macrophages and is markedly elevated in plasma of Gaucher disease patients. The expression of chitotriosidase occurs only at a late stage of differentiation of monocytes to activated macrophages in culture. Human macrophages can synthesize a functional chitotriosidase, a highly conserved enzyme with a strongly regulated expression. This enzyme may play a role in the degradation of chitin-containing pathogens. Several alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2012]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the CHIT1 is a prognostic biomarker and potential therapeutic target for sepsis, with significantly higher expression in sepsis patients versus healthy controls and in non-survivors versus survivors, associated with 28-day mortality (HR 1.38) [Li et al. DOI:10.1038/s41598-025-99619-z]. A study in mice demonstrated that the murine homolog of the CHIT1, chitinase-like 3 (Chil3), is a potential histological marker for wound age estimation, with its protein expression peaking at 2 days post-injury and Chil3-positive neutrophils localized specifically in the scab and granulation tissue of 1–3-day-old wounds [Murase et al. DOI:10.1007/s00414-017-1658-7].