Basic Information

Symbol
ADAMTS2
RNA class
mRNA
Alias
ADAM Metallopeptidase With Thrombospondin Type 1 Motif 2 ADAM-TS2 PCINP Procollagen N-Endopeptidase Procollagen I N-Proteinase ADAMTS-3 NPI A Disintegrin-Like And Metalloprotease (Reprolysin Type) With Thrombospondin Type 1 Motif, 2 A Disintegrin And Metalloproteinase With Thrombospondin Motifs 2 Procollagen I/II Amino Propeptide-Processing Enzyme EC 3.4.24.14 ADAMTS-2 PC I-NP HPCPNI PCPNI PNPI ADAM-TS 2 EC 3.4.24 EDSDERMS PCI-NP
Location (GRCh38)
5:179110853-179345461
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014244.5
Sequence length
6783.0 nt
GC content
0.5751

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2677.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2796.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1834.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014244.5 NCBI
GCCUCCUCCGCCCCGCGCCCUGCGGUGCUGCAGCUGCGGGCGGCUCCAG… 6783 nt 0.5751
NM_021599.4 NCBI
GCCUCCUCCGCCCCGCGCCCUGCGGUGCUGCAGCUGCGGGCGGCUCCAG… 2288 nt 0.6359
Summary

This gene encodes a member of the ADAMTS (a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs) protein family. Members of the family share several distinct protein modules, including a propeptide region, a metalloproteinase domain, a disintegrin-like domain, and a thrombospondin type 1 (TS) motif. Individual members of this family differ in the number of C-terminal TS motifs, and some have unique C-terminal domains. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature procollagen N-proteinase. This proteinase excises the N-propeptide of the fibrillar procollagens types I-III and type V. Mutations in this gene cause Ehlers-Danlos syndrome type VIIC, a recessively inherited connective-tissue disorder. Alternative splicing results in multiple transcript variants, at least one of which encodes an isoform that is proteolytically processed. [provided by RefSeq, Feb 2016]

Forensic Context

A study in humans identified the ADAMTS2 as one of ten hub genes for predicting heart failure progression after myocardial infarction using a support vector machine recursive feature elimination algorithm [Xu et al. DOI:10.3389/fgene.2025.1592985].