Basic Information

Symbol
CHRNE
RNA class
mRNA
Alias
Cholinergic Receptor Nicotinic Epsilon Subunit ACHRE Acetylcholine Receptor, Nicotinic, Epsilon (Muscle) Cholinergic Receptor, Nicotinic, Epsilon (Muscle) Cholinergic Receptor, Nicotinic Epsilon Acetylcholine Receptor Subunit Epsilon Cholinergic Receptor, Nicotinic, Epsilon Polypeptide Cholinergic Receptor, Nicotinic, Epsilon Myasthenia Gravis, Familial Infantile, 1 AchR Epsilon Subunit CMS1A1 CMS1D CMS1E CMS2A CMS4A CMS4B CMS4C FCCMS FIMG1 SCCMS FIM1 FIMG MGI
Location (GRCh38)
17:4897771-4934438
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000080.4
Sequence length
2482.0 nt
GC content
0.5898

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-995.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1039.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 605.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000080.4 NCBI
AGAGCUCAGAAUAACCCUGAGAACCACGCAGCAGGAUGGCAAGGGCUCC… 2482 nt 0.5898
Summary

Acetylcholine receptors at mature mammalian neuromuscular junctions are pentameric protein complexes composed of four subunits in the ratio of two alpha subunits to one beta, one epsilon, and one delta subunit. The acetylcholine receptor changes subunit composition shortly after birth when the epsilon subunit replaces the gamma subunit seen in embryonic receptors. Mutations in the epsilon subunit are associated with congenital myasthenic syndrome. [provided by RefSeq, Sep 2009]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CHRNE gene, which encodes a nicotinic cholinergic receptor ε polypeptide, was specifically down-regulated following Kupffer cell-specific exposure to α-particles in liver tissue [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078].