Basic Information

Symbol
CLEC12B
RNA class
mRNA
Alias
C-Type Lectin Domain Family 12 Member B Macrophage Antigen H Testis Secretory Sperm-Binding Protein Li 205a C-Type Lectin Domain Family 12, Member B UNQ5782
Location (GRCh38)
12:10010627-10018796
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001129998.3
Sequence length
1279.0 nt
GC content
0.4089

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-346.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -372.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 288.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001129998.3 NCBI
GGGGCAGUAGAGUGUGUCUGGGUCAGCUGAGUGACUACAUCAAAGCUCC… 1279 nt 0.4089
NM_001319241.1 NCBI
GGGGCAGUAGAGUGUGUCUGGGUCAGCUGAGUGACUACAUCAAAGCUCC… 1275 nt 0.4078
NM_001319242.1 NCBI
GGGGCAGUAGAGUGUGUCUGGGUCAGCUGAGUGACUACAUCAAAGCUCC… 3041 nt 0.3571
NM_001387138.1 NCBI
GGGGCAGUAGAGUGUGUCUGGGUCAGCUGAGUGACUACAUCAAAGCUCC… 1192 nt 0.4161
NM_205852.3 NCBI
GGGGCAGUAGAGUGUGUCUGGGUCAGCUGAGUGACUACAUCAAAGCUCC… 3049 nt 0.3572
Summary

Enables protein phosphatase binding activity and signaling receptor inhibitor activity. Involved in several processes, including melanocyte proliferation; natural killer cell inhibitory signaling pathway; and regulation of signal transduction. Located in external side of plasma membrane. Part of protein-containing complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the CLEC12B as a hub gene within the cyan module of the platelet transcriptome in patients with non-ST-segment elevation myocardial infarction (NSTEMI), where it was associated with functions related to the extracellular space and calcium binding [Zhang et al. DOI:PMC8129354].