Basic Information

Symbol
CLXN
RNA class
mRNA
Alias
Calaxin ODAD5 EFCAB1 EF-Hand Calcium-Binding Domain-Containing Protein 1 Outer Dynein Arm Docking Complex Subunit 5 EF-Hand Calcium Binding Domain 1 FLJ11767 CILD53
Location (GRCh38)
8:48710789-48735311
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024593.4
Sequence length
2104.0 nt
GC content
0.4159

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-587.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -626.30 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 700.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001142857.2 NCBI
AGUAACUGAGACCUCACCGCGUUGACCCAGCACCAGGGCUCGCGGGGGU… 2237 nt 0.4877
NM_001363973.3 NCBI
AGUAACUGAGACCUCACCGCGUUGACCCAGCACCAGGGCUCGCGGGGGU… 1867 nt 0.4221
NM_001363974.2 NCBI
AGUAACUGAGACCUCACCGCGUUGACCCAGCACCAGGGCUCGCGGGGGU… 1948 nt 0.4179
NM_024593.4 NCBI
AGUAACUGAGACCUCACCGCGUUGACCCAGCACCAGGGCUCGCGGGGGU… 2104 nt 0.4159
Summary

Predicted to enable calcium ion binding activity. Predicted to be involved in several processes, including cilium movement; outer dynein arm assembly; and regulation of flagellated sperm motility. Located in sperm flagellum. Implicated in primary ciliary dyskinesia. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CLXN was up-regulated following γ-ray exposure, as part of an investigation into radiation-induced gene expression changes in liver tissue using oligonucleotide microarray and real-time PCR validation [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078].