Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_024593.4

Sequence Length

2104 nt

GC Content

0.4159

AGUAACUGAGACCUCACCGCGUUGACCCAGCACCAGGGCUCGCGGGGGUCCCGCGAGGGUCUCGGUAGCCGCGCGCCCAGAGACCCCCGCCGCGGCCCGAUUCUCUGAGCGCCAGACAUGAACCGCAAGAAACUGCAGAAGCUGACGGACACCUUAACCAAAAAUUGCAAGCAUUUUAAUAAAUUUGAAGUGAACUGUCUUAUAAAGCUUUUUUAUGACUUGGUGGGAGGAGUAGAGAGGCAAGGUCUGGUUGUUGGACUGGAUCGUAAUGCAUUUCGAAACAUCCUGCAUGUGACAUUUGGAAUGACAGAUGACAUGAUUAUGGACAGAGUAUUCCGAGGUUUUGAUAAAGAUAAUGAUGGCUGUGUAAAUGUAUUGGAGUGGAUUCAUGGAUUAUCACUGUUUCUUCGAGGAUCUUUGGAAGAAAAAAUGAAAUAUUGCUUUGAAGUGUUUGAUUUGAAUGGUGACGGAUUCAUUUCAAAGGAGGAAAUGUUUCACAUGUUGAAGAACAGCCUUCUCAAACAGCCAUCUGAGGAAGACCCUGAUGAAGGAAUUAAAGAUUUGGUUGAAAUAACACUGAAGAAAAUGGAUCAUGACCAUGAUGGGAAGCUGUCUUUUGCAGACUAUGAACUGGCUGUGAGAGAAGAGACUCUUCUACUGGAGGCCUUUGGGCCAUGUCUUCCUGAUCCAAAGAGCCAGAUGGAAUUUGAAGCUCAAGUAUUCAAAGAUCCAAAUGAAUUCAAUGAUAUGUGAAUAACUAAAUGUCUAUAUUGUCUCAAGUGAGUAAAAAAGGAGGCACACACAUAUUGCUUAUUUUUUCUACUUAGUUCAGAAAAAUGAUGUUGAAUUGUGUGUUUCAGGGUGAAGAUGAGGUUCACUUACAUAUAUCAUUUAACAUCAGUGUAAGAUGCAAUUAAAAUAGAUGGAAGACAAGAAGUCCCUUAUUAGAUGAUGGGUUUGGCAAGACAGUUAACUUUUCUACAGAUGUUUUAUCACAUAGACUAUCUGUCGAAGCACAUAACUGGCAUAAAACCUUUGGGUUCAUUAAAUGAAUAGAGAGAUUACAUAAUUAUGAAUUGUUAAUACAAAUAUUCUGCAUGUCAAAAAGAAGCUGGGUGUACACUGAAAAAUCAUUGAAACUACUGGAUUUCCUUUGAAACAAAUAAUGAAGAUGGCAUCAAAAGAAUAAGAGUAUUCUAUUGAGCAUUGAAACGCCUUUCUGGUAGGCAUUGAGGGAGAUCUAGAGAGAUGAAAGAUACAUGGAAAUCAUAUUAUAUUGAAAUAUAAUAUGAUUUGCAUUAUUGUUUGAGGCUUUGGCUAAAUAACGUUACUGAUUGUAAGCACCUGAAGGCAAGGGUUUUAUCCACCACAUCUUUGUCUGCCAUAGCAUUUAGUCCUCUGCAUACAAUGGGCUGUCCAUAAUUACUGUAGAUUGGACUGAAAAUCAAAAAGUACCACAAGAUAAAUGCAAACUCUUGGUGAGCAGAGGGAGAACAUGUACUGAGUUUCUUAGGUUUCAUGGCUAAUGCAUUGGCACAGCUUUCAGUGUAUCCCUGCAGUCCUUCCAGAUAGUCCCUGCCCCAUGCAUUGCAGAUGGUUGCCAAAGCCCCCCUCUGUCCUGGCACCCAGUGUUCCUCCAUCCUGACUCCACGUAUUGCCCCCUUGCCACUGCCUGAGUGCACCAUAGUGUCCCCAUCCCCCCACUGCCUGGAGUUCCCCUUGUGUACCCCCUUAUCAGGGCACGACCUAACUGUGCCCUGCUGGCUGUGACCUCCUGAAGACAGACCUGGCUUCUCCCUGCAUCCAGUUCCCCAGUAUGUGCUGUGGGCAUCCUGAGAAGCCUGAAAAAGACAGGGCCAGGUUAGGCUUGGGUGAGCUGCUUUCUGCCUUCUUGGUACACACAGUAAGCAGUGGAGAGGCGUGUUACACCGUAUCUGUUCUAUCCUCAUCUAAAUACUGAGAGGCUAGUUGGGAUAGUAAAUCUUUCUUACUACAUAUGCAUUAAGUUUAAGUAAAAUAGAAUAUUGUGUGAAAAAAUGCACUGUUACUAAUAAAUGGAAUAAACAGAUCCAUGAAAUAAAAGAAAACAUAUUUUACUGUCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-587.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -626.30

Frequency: 0.0000

Diversity: 700.81

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((...(.((((.(((((((.((((((((((..(((((..((((((..((((((((..((((..((((((.((............))))))))))))......((((.((((.........(((......)))(((((((...(((((....................((((((((.....))))))))...))))).....))))))).........((((((.(((((((...((((((((((((((....)))))))..(((((((..(((((.((((((..(((((..((((((......))))))))))).....))(((.(((..((....(((((....)))))...))..))).)))..)))).)))))(((((.(((((((....(((((..((((...(((((...((((((.....(((((((((.((((((((((...((((((........)))))))))))))))).)....))))))))((.((.(((((....(((((((..(((((((((((.((((((((((.....)))((((((....)))))).........((.......((((.......)))).......))..))))))).))))........)))))))..)))))).)..))))).))))..((((....))))...)))))).))))).))))(((((.((((.((((((.........))))))..))))............(((((............))))).......(((.((.((((((((((((.(((((.........))))).)))))).)))))).)).)))....((((((((((((((((((....(((((((.......))))))))))))))..)))))))))))(((((.(..(((.......((..((((((((.......(((((((...)))).)))(((((((...((((((...((((.((((((((((........)))).)))))).))))....))))))......((((....))))........(((((.....((((.((((((...)))))))))).....)))))....))))))).....((.(((.(((((((((((...(((.((((((.(((((((((((((((.................((.((((.((((((....)))))).))))))........((((.......)))).)))))))))))))))((((((...((.((((((.((((((((((((((....))))))))))))))(((....)))..(((.(((((.((........((((.....))))........)).))))).)))...........(((((.((((((((....((((((((((((((....((((.....))))......))))))..))))))))...............(((((...........)))))))).))))).))))).))))))))..))))))..)))))))))(((..(((....))).))))))))))))))))).)).)).))))))..)).....)))..).))))).(((((.((..((....))..)).))))).)))))...)))))....))))...))).))))))))))))..))))))).)))).((.(.((((....)))).).))))).))))))..)))).)))))))))))).))))))....(((((((((.......)))))))))..((((((............)))).)).((((((((.(((....)))..(((((((....)))).)))......))))))))...........))))).)))...)).))))).)))(((((.(((((.....))......))).))))))))).)))))..)))))............(((.((((.((........)))))).)))...((((((((((..((((((..(((.((.((.....)).)).)))...(((((((.(((((......))))).)))).)))....(((((.........))))).......))))))......))))))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

..(((((,{(.((((.(((((..{.(((.......)))}.)))))((((({{(((.(((((((((..((...}}||)}.))))))).))).).)))))|,,,{{{{{,,{{{(({,{,,|,...(((......}}},({(({{,.,(({{,..,,...,,.....,,....((((((((.....))))))))..,}}}}}.....,||||||||||..{{{,,,,,|}|,,||||}}}|||,,{({{{(({{.,,{||}}|}}|},,,(({({{,,,,,..,.,,..|(({({{.((((((......))))))|))}|.....}}||||{{{,,||||||||||{,....||||...{{{({{{((|,..,,{{,{({{{{((((((({{(({{{.,{{(((,(((((,.,(({{{.,,{|||||...,,({(((((((.{{{{{{||||,}}{||||{.,,,,,,,})))))))))))))}|{||{..,}}|||||{,.{{,|{{{{....|||||{{..|||||||||((.{(((((((((.....))).........{{{{({{{......||||,,,....,{{{{{{,...||}},,}{{,...||))))))|,)))}........))))))).,)))))).}..))))).}}}}}.((((....))))...}}}})},)}))).)))}},)|}.|{{{,((((({..,,,,}}.))))}}}}))))..}}}}}}}|.,|{{{{||{.,|,.,...,}}}|,.,,||.(((.((.((((((,(((((,(((((.........))))).)))))).)))))).)).)))....((((((((((({((((((....(((((((.......))))))))))))))..))))))))))),(((,,.{|||,.......,,{{{(({.(((,....||}{{,,.,{{{{.|,.|{|{{{{{{{,..((((((...((((.((((((({((,,,...,,)))},)))))).))))....)))))).,...,|||||{|,}{(((({...}})}}}..,,.,,||.,{{..,.,,}},||{{....}},,.}}}}|||||}|}}}....,,.((.(((.((((((((({{..,{{,{{,,,((.(((((((((((((((.............,{,.((.((((.((((((....)))))).)))))),,,.....((((.......)))).)))))))))))))))||{|||,,.{(,((,(((.((((((((((((((....)))))))))))))).}}},.,|||||{,(((({({{(|........((((.....)))),|...,..{|{|,|||||,,.,..,.....,|||||,|{(((((,.,,.{(((((((((((({{{..((((,...,))))...,,.}))))}..))))))},..........,....(((((...........)))))))).))))),))}}}.||||,,||{{|,,,))}}),,,,))))(({|,|||..}})),.,}}))))))))))}})).)),||}.,,,|||,,.,,,.}))}...,})})}}))}},,||,|)))}}}})),..,}}}),...))})}}}},)}}}}.)))))),.,,,}})}.|},,,||,.|{{|.((((((({((.({(,(({{.,|||,.,.,,..,..|}}}}|.,||}{{{{{{(({{(({,.,,{{{,...,||||||||,{{{{{{{|,||||||{{((((((...,....}...)))).)).((((((((..(({..,|||,.({{{{{{....)))).))),}....))))))))......}}.))))))},))))))),..))).))))){|....,||,....}))).))).)))...))))))).)))),}}}))))}}.,,,}}}..,||{,||||.{{........)})))),)))}}}((((((((((..((({((,,({{.{{.{{.....)).}},)))...(((((((.(((((......))))).)))).))}....(((((.........))))).......})))},......))))))))))..