Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000024.6
Sequence Length
2013 nt
GC Content
0.5057
GCACUGCGAAGCGGCUUCUUCAGAGCACGGGCUGGAACUGGCAGGCACCGCGAGCCCCUAGCACCCGACAAGCUGAGUGUGCAGGACGAGUCCCCACCACACCCACACCACAGCCGCUGAAUGAGGCUUCCAGGCGUCCGCUCGCGGCCCGCAGAGCCCCGCCGUGGGUCCGCCCGCUGAGGCGCCCCCAGCCAGUGCGCUCACCUGCCAGACUGCGCGCCAUGGGGCAACCCGGGAACGGCAGCGCCUUCUUGCUGGCACCCAAUGGAAGCCAUGCGCCGGACCACGACGUCACGCAGGAAAGGGACGAGGUGUGGGUGGUGGGCAUGGGCAUCGUCAUGUCUCUCAUCGUCCUGGCCAUCGUGUUUGGCAAUGUGCUGGUCAUCACAGCCAUUGCCAAGUUCGAGCGUCUGCAGACGGUCACCAACUACUUCAUCACUUCACUGGCCUGUGCUGAUCUGGUCAUGGGCCUGGCAGUGGUGCCCUUUGGGGCCGCCCAUAUUCUUAUGAAAAUGUGGACUUUUGGCAACUUCUGGUGCGAGUUUUGGACUUCCAUUGAUGUGCUGUGCGUCACGGCCAGCAUUGAGACCCUGUGCGUGAUCGCAGUGGAUCGCUACUUUGCCAUUACUUCACCUUUCAAGUACCAGAGCCUGCUGACCAAGAAUAAGGCCCGGGUGAUCAUUCUGAUGGUGUGGAUUGUGUCAGGCCUUACCUCCUUCUUGCCCAUUCAGAUGCACUGGUACCGGGCCACCCACCAGGAAGCCAUCAACUGCUAUGCCAAUGAGACCUGCUGUGACUUCUUCACGAACCAAGCCUAUGCCAUUGCCUCUUCCAUCGUGUCCUUCUACGUUCCCCUGGUGAUCAUGGUCUUCGUCUACUCCAGGGUCUUUCAGGAGGCCAAAAGGCAGCUCCAGAAGAUUGACAAAUCUGAGGGCCGCUUCCAUGUCCAGAACCUUAGCCAGGUGGAGCAGGAUGGGCGGACGGGGCAUGGACUCCGCAGAUCUUCCAAGUUCUGCUUGAAGGAGCACAAAGCCCUCAAGACGUUAGGCAUCAUCAUGGGCACUUUCACCCUCUGCUGGCUGCCCUUCUUCAUCGUUAACAUUGUGCAUGUGAUCCAGGAUAACCUCAUCCGUAAGGAAGUUUACAUCCUCCUAAAUUGGAUAGGCUAUGUCAAUUCUGGUUUCAAUCCCCUUAUCUACUGCCGGAGCCCAGAUUUCAGGAUUGCCUUCCAGGAGCUUCUGUGCCUGCGCAGGUCUUCUUUGAAGGCCUAUGGGAAUGGCUACUCCAGCAACGGCAACACAGGGGAGCAGAGUGGAUAUCACGUGGAACAGGAGAAAGAAAAUAAACUGCUGUGUGAAGACCUCCCAGGCACGGAAGACUUUGUGGGCCAUCAAGGUACUGUGCCUAGCGAUAACAUUGAUUCACAAGGGAGGAAUUGUAGUACAAAUGACUCACUGCUGUAAAGCAGUUUUUCUACUUUUAAAGACCCCCCCCCCCAACAGAACACUAAACAGACUAUUUAACUUGAGGGUAAUAAACUUAGAAUAAAAUUGUAAAAUUGUAUAGAGAUAUGCAGAAGGAAGGGCAUCCUUCUGCCUUUUUUAUUUUUUUAAGCUGUAAAAAGAGAGAAAACUUAUUUGAGUGAUUAUUUGUUAUUUGUACAGUUCAGUUCCUCUUUGCAUGGAAUUUGUAAGUUUAUGUCUAAAGAGCUUUAGUCCUAGAGGACCUGAGUCUGCUAUAUUUUCAUGACUUUUCCAUGUAUCUACCUCACUAUUCAAGUAUUAGGGGUAAUAUAUUGCUGCUGGUAAUUUGUAUCUGAAGGAGAUUUUCCUUCCUACACCCUUGGACUUGAGGAUUUUGAGUAUCUCGGACCUUUCAGCUGUGAACAUGGACUCUUCCCCCACUCCUCUUAUUUGCUCACACGGGGUAUUUUAGGCAGGGAUUUGAGGAGCAGCUUCAGUUGUUUUCCCGAGCAAAGUCUAAAGUUUACAGUAAAUAAAUUGUUUGACCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-666.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -703.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 595.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((.(((((((...((((....((((.((.....(((..((...))..))).....)))))).....))))(((((..((........))..))))).........)))))))......((((((((((((...(((((((...))).))))..)))).(((((..(((.((.((((((((((((....((((((..............))))))..)))))....(((....)))..)))))))...)).)))))))).))))))))..(((.((.....)).)))..)))))((((((..(((((((.(((((((((.(((((((...(((((((.((((((.....((((..(((..((((((((((.((((.......))))))))))))))..)))(((((((....(((((.((((......(((((((.(.(.((((((((((.....)).)))))))).)).)))))))....))))))))).(((((((........)))))))....((((((..(((((((((((((..(((........((((.(((((((.((((((..(((..........)))..))))))))))))).))))........)))..))))..........)))))))))..)))))).(((((((((((((....((((((.(((........))).)).))))))))))).....))))))......))))))).(((((...(((...))))))))..(((........)))..))))))))))...)).)))))(((.....)))....))))))))))))))))..((((.((((....(((((((((((((((((((.(((.(((.(((((.((((((((((((((.(((((((....)))..)))).))))...)))...)))).)))((((((((.(((((...((((.....))))))).)))))..)))))..(((((.((..(((((((((.((....)).))))).....))))..))..)))))..)))))..)))))).)))))(((........)))..((((((..(((.((((.(((..........(((((((((((((.((((......))))....)))...))))))..(((......))).((((........((((((...((((((....((((...((....))..))))....))))))....))))))........))))))))((((((((...))))))))))))))).)))....)))))).........)))))))))...)))))...))))))))((((.((............)).))))(((((....(((.((((((((...((((((........)))))).)))))))).).)).........)))))..(((((((((((..(((((((((((..((((((....))))))((((((.(((((...........(((.(((.........................))).))).........(((..(((((..((((((..(...........(((((((((......))))))))))..))))))..)))))..)))..))))))))))).((((....))))........)))))))))))....)))))))))))(((((((((.....(((((.(((.......(((((((((((....))).)))))...))).......))))))))))))))))).....((((...(((((((.((((((((.(((.((((((...)))))).)))....((((((.....))))))....))))))))))))))).....)))))))))))..)))))).(((((((((.((((((....((((.....................))))........((.((((......(((((((....)))))))))))..))..))))))..)))))))))....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,..,{.((((((((,.((((((((((,(,(((,((((((((((((...(,((|,,,({{((((....{{{{{||,{{(.,((((((((,..(((((({,{((((((((.,.,((.{{......((((((((((((...(((((((...))).))))..)))).(((((..(((.((.((((((((((((....((((((,,........},..))))))..)))))....(((....)))..)))))))...)).)))))))).)))))))).{(((.,|{{{.....,)}}.)))}....,}))..}.))))))))))))))).,,(({{,|..,,}))))}....}))))))),,)}}}}.))}||,{,,,|}||||}...,}.),))),})))))})}}),)}},|,}}}.|.(((((.((({......(((((((.{.{.((((((((((.....)).)))))))),)}.)))))))....})))))))),((((((({....}}.,))))))...{(((.((((((((((.((,..((((((.(((((..{{{.((((((.((......)))))))).(((((((((.{|({{{{}|||({{{||,||..,...}).}.,}},,..........(((((((.(({{{,((,.(((((((((((((.,{.((((((.(((,..,,.,}})).)}.}))}))))))).....))))))..}}.,))),.)).))))))).{(({{{..({{((((.(((........)))..|,{{{{(.|,...{{(((({.....})))}.....}}}...,,,)}}))||........((((......})))....}}}))))....)))})}..},,,.,..))))))))}}},)))))))))))..}.)).))))))).))).)))})))))))))))))))||{||,{,,.......(((..(((((((({{{((((.(((.((((...(((.((((((((.((....)).))))){((,,((.((.....)))))))),.((((((((({,,....(((({,,..{,.,,..}}.,)).))))}..,.,,{,.,,...,,,.,,|{||||||,{{{{(((,.{{{.{((({..{({{.{......,}})}}}....}))))}}),..}}}}..{{((((...({{(((....{{{{..,{{.,,,)},,)))}....))))}),,..}}}}||{((((((((((((.(.((((((((......,,|({{{{.||,,},|{{{((,.|{..{,........}.),,)).))))))..,}).))))).((((.((............)).))))..)))))))),})))))))))))){|||{{,},,.,..)}}))).,,)))))))))).......,{.{(((({,(((((((((((..(((((((((((..((((((....)))))),{((((.,{(((,.,,,,,,....{{.{{,..,......................,}).))),..,,,,,{||||{,,.,{{{.,,.,,,,.,{{{{{{{...(((((((((......))))))))).,||||}}|,,|||||..,,.}}))))))))))),{(({....))))........)))))))))))....))))))))))}|((((((((.....((({{{(((.....,,((((({{((((....)))).}))).,,})).......))))))))))))))))}....{((((...((((((({((((,((({{....||||}.}})))),..{(((...((((((,...,)))))).)))),,)))))),,))))}..{(((((...)))))}.....,...))))))},.))).))).,)))}..))).))))))))))).)))..)))|{(((((((...{.((((.((((((((....)))))..))))))))...)))))))}},.{((((......))))),,),,,,,,
Back