Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000088.4
Sequence Length
5914 nt
GC Content
0.6155
GCAGACGGGAGUUUCUCCUCGGGGUCGGAGCAGGAGGCACGCGGAGUGUGAGGCCACGCAUGAGCGGACGCUAACCCCCUCCCCAGCCACAAAGAGUCUACAUGUCUAGGGUCUAGACAUGUUCAGCUUUGUGGACCUCCGGCUCCUGCUCCUCUUAGCGGCCACCGCCCUCCUGACGCACGGCCAAGAGGAAGGCCAAGUCGAGGGCCAAGACGAAGACAUCCCACCAAUCACCUGCGUACAGAACGGCCUCAGGUACCAUGACCGAGACGUGUGGAAACCCGAGCCCUGCCGGAUCUGCGUCUGCGACAACGGCAAGGUGUUGUGCGAUGACGUGAUCUGUGACGAGACCAAGAACUGCCCCGGCGCCGAAGUCCCCGAGGGCGAGUGCUGUCCCGUCUGCCCCGACGGCUCAGAGUCACCCACCGACCAAGAAACCACCGGCGUCGAGGGACCCAAGGGAGACACUGGCCCCCGAGGCCCAAGGGGACCCGCAGGCCCCCCUGGCCGAGAUGGCAUCCCUGGACAGCCUGGACUUCCCGGACCCCCCGGACCCCCCGGACCUCCCGGACCCCCUGGCCUCGGAGGAAACUUUGCUCCCCAGCUGUCUUAUGGCUAUGAUGAGAAAUCAACCGGAGGAAUUUCCGUGCCUGGCCCCAUGGGUCCCUCUGGUCCUCGUGGUCUCCCUGGCCCCCCUGGUGCACCUGGUCCCCAAGGCUUCCAAGGUCCCCCUGGUGAGCCUGGCGAGCCUGGAGCUUCAGGUCCCAUGGGUCCCCGAGGUCCCCCAGGUCCCCCUGGAAAGAAUGGAGAUGAUGGGGAAGCUGGAAAACCUGGUCGUCCUGGUGAGCGUGGGCCUCCUGGGCCUCAGGGUGCUCGAGGAUUGCCCGGAACAGCUGGCCUCCCUGGAAUGAAGGGACACAGAGGUUUCAGUGGUUUGGAUGGUGCCAAGGGAGAUGCUGGUCCUGCUGGUCCUAAGGGUGAGCCUGGCAGCCCUGGUGAAAAUGGAGCUCCUGGUCAGAUGGGCCCCCGUGGCCUGCCUGGUGAGAGAGGUCGCCCUGGAGCCCCUGGCCCUGCUGGUGCUCGUGGAAAUGAUGGUGCUACUGGUGCUGCCGGGCCCCCUGGUCCCACCGGCCCCGCUGGUCCUCCUGGCUUCCCUGGUGCUGUUGGUGCUAAGGGUGAAGCUGGUCCCCAAGGGCCCCGAGGCUCUGAAGGUCCCCAGGGUGUGCGUGGUGAGCCUGGCCCCCCUGGCCCUGCUGGUGCUGCUGGCCCUGCUGGAAACCCUGGUGCUGAUGGACAGCCUGGUGCUAAAGGUGCCAAUGGUGCUCCUGGUAUUGCUGGUGCUCCUGGCUUCCCUGGUGCCCGAGGCCCCUCUGGACCCCAGGGCCCCGGCGGCCCUCCUGGUCCCAAGGGUAACAGCGGUGAACCUGGUGCUCCUGGCAGCAAAGGAGACACUGGUGCUAAGGGAGAGCCUGGCCCUGUUGGUGUUCAAGGACCCCCUGGCCCUGCUGGAGAGGAAGGAAAGCGAGGAGCUCGAGGUGAACCCGGACCCACUGGCCUGCCCGGACCCCCUGGCGAGCGUGGUGGACCUGGUAGCCGUGGUUUCCCUGGCGCAGAUGGUGUUGCUGGUCCCAAGGGUCCCGCUGGUGAACGUGGUUCUCCUGGCCCUGCUGGCCCCAAAGGAUCUCCUGGUGAAGCUGGUCGUCCCGGUGAAGCUGGUCUGCCUGGUGCCAAGGGUCUGACUGGAAGCCCUGGCAGCCCUGGUCCUGAUGGCAAAACUGGCCCCCCUGGUCCCGCCGGUCAAGAUGGUCGCCCCGGACCCCCAGGCCCACCUGGUGCCCGUGGUCAGGCUGGUGUGAUGGGAUUCCCUGGACCUAAAGGUGCUGCUGGAGAGCCCGGCAAGGCUGGAGAGCGAGGUGUUCCCGGACCCCCUGGCGCUGUCGGUCCUGCUGGCAAAGAUGGAGAGGCUGGAGCUCAGGGACCCCCUGGCCCUGCUGGUCCCGCUGGCGAGAGAGGUGAACAAGGCCCUGCUGGCUCCCCCGGAUUCCAGGGUCUCCCUGGUCCUGCUGGUCCUCCAGGUGAAGCAGGCAAACCUGGUGAACAGGGUGUUCCUGGAGACCUUGGCGCCCCUGGCCCCUCUGGAGCAAGAGGCGAGAGAGGUUUCCCUGGCGAGCGUGGUGUGCAAGGUCCCCCUGGUCCUGCUGGUCCCCGAGGGGCCAACGGUGCUCCCGGCAACGAUGGUGCUAAGGGUGAUGCUGGUGCCCCUGGAGCUCCCGGUAGCCAGGGCGCCCCUGGCCUUCAGGGAAUGCCUGGUGAACGUGGUGCAGCUGGUCUUCCAGGGCCUAAGGGUGACAGAGGUGAUGCUGGUCCCAAAGGUGCUGAUGGCUCUCCUGGCAAAGAUGGCGUCCGUGGUCUGACUGGCCCCAUUGGUCCUCCUGGCCCUGCUGGUGCCCCUGGUGACAAGGGUGAAAGUGGUCCCAGCGGCCCUGCUGGUCCCACUGGAGCUCGUGGUGCCCCCGGAGACCGUGGUGAGCCUGGUCCCCCCGGCCCUGCUGGCUUUGCUGGCCCCCCUGGUGCUGACGGCCAACCUGGUGCUAAAGGCGAACCUGGUGAUGCUGGUGCUAAAGGCGAUGCUGGUCCCCCUGGCCCUGCCGGACCCGCUGGACCCCCUGGCCCCAUUGGUAAUGUUGGUGCUCCUGGAGCCAAAGGUGCUCGCGGCAGCGCUGGUCCCCCUGGUGCUACUGGUUUCCCUGGUGCUGCUGGCCGAGUCGGUCCUCCUGGCCCCUCUGGAAAUGCUGGACCCCCUGGCCCUCCUGGUCCUGCUGGCAAAGAAGGCGGCAAAGGUCCCCGUGGUGAGACUGGCCCUGCUGGACGUCCUGGUGAAGUUGGUCCCCCUGGUCCCCCUGGCCCUGCUGGCGAGAAAGGAUCCCCUGGUGCUGAUGGUCCUGCUGGUGCUCCUGGUACUCCCGGGCCUCAAGGUAUUGCUGGACAGCGUGGUGUGGUCGGCCUGCCUGGUCAGAGAGGAGAGAGAGGCUUCCCUGGUCUUCCUGGCCCCUCUGGUGAACCUGGCAAACAAGGUCCCUCUGGAGCAAGUGGUGAACGUGGUCCCCCUGGUCCCAUGGGCCCCCCUGGAUUGGCUGGACCCCCUGGUGAAUCUGGACGUGAGGGGGCUCCUGGUGCCGAAGGUUCCCCUGGACGAGACGGUUCUCCUGGCGCCAAGGGUGACCGUGGUGAGACCGGCCCCGCUGGACCCCCUGGUGCUCCUGGUGCUCCUGGUGCCCCUGGCCCCGUUGGCCCUGCUGGCAAGAGUGGUGAUCGUGGUGAGACUGGUCCUGCUGGUCCCGCCGGUCCUGUCGGCCCUGUUGGCGCCCGUGGCCCCGCCGGACCCCAAGGCCCCCGUGGUGACAAGGGUGAGACAGGCGAACAGGGCGACAGAGGCAUAAAGGGUCACCGUGGCUUCUCUGGCCUCCAGGGUCCCCCUGGCCCUCCUGGCUCUCCUGGUGAACAAGGUCCCUCUGGAGCCUCUGGUCCUGCUGGUCCCCGAGGUCCCCCUGGCUCUGCUGGUGCUCCUGGCAAAGAUGGACUCAACGGUCUCCCUGGCCCCAUUGGGCCCCCUGGUCCUCGCGGUCGCACUGGUGAUGCUGGUCCUGUUGGUCCCCCCGGCCCUCCUGGACCUCCUGGUCCCCCUGGUCCUCCCAGCGCUGGUUUCGACUUCAGCUUCCUGCCCCAGCCACCUCAAGAGAAGGCUCACGAUGGUGGCCGCUACUACCGGGCUGAUGAUGCCAAUGUGGUUCGUGACCGUGACCUCGAGGUGGACACCACCCUCAAGAGCCUGAGCCAGCAGAUCGAGAACAUCCGGAGCCCAGAGGGCAGCCGCAAGAACCCCGCCCGCACCUGCCGUGACCUCAAGAUGUGCCACUCUGACUGGAAGAGUGGAGAGUACUGGAUUGACCCCAACCAAGGCUGCAACCUGGAUGCCAUCAAAGUCUUCUGCAACAUGGAGACUGGUGAGACCUGCGUGUACCCCACUCAGCCCAGUGUGGCCCAGAAGAACUGGUACAUCAGCAAGAACCCCAAGGACAAGAGGCAUGUCUGGUUCGGCGAGAGCAUGACCGAUGGAUUCCAGUUCGAGUAUGGCGGCCAGGGCUCCGACCCUGCCGAUGUGGCCAUCCAGCUGACCUUCCUGCGCCUGAUGUCCACCGAGGCCUCCCAGAACAUCACCUACCACUGCAAGAACAGCGUGGCCUACAUGGACCAGCAGACUGGCAACCUCAAGAAGGCCCUGCUCCUCCAGGGCUCCAACGAGAUCGAGAUCCGCGCCGAGGGCAACAGCCGCUUCACCUACAGCGUCACUGUCGAUGGCUGCACGAGUCACACCGGAGCCUGGGGCAAGACAGUGAUUGAAUACAAAACCACCAAGACCUCCCGCCUGCCCAUCAUCGAUGUGGCCCCCUUGGACGUUGGUGCCCCAGACCAGGAAUUCGGCUUCGACGUUGGCCCUGUCUGCUUCCUGUAAACUCCCUCCAUCCCAACCUGGCUCCCUCCCACCCAACCAACUUUCCCCCCAACCCGGAAACAGACAAGCAACCCAAACUGAACCCCCUCAAAAGCCAAAAAAUGGGAGACAAUUUCACAUGGACUUUGGAAAAUAUUUUUUUCCUUUGCAUUCAUCUCUCAAACUUAGUUUUUAUCUUUGACCAACCGAACAUGACCAAAAACCAAAAGUGCAUUCAACCUUACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAUAAAUAAAUAACUUUUUAAAAAAGGAAGCUUGGUCCACUUGCUUGAAGACCCAUGCGGGGGUAAGUCCCUUUCUGCCCGUUGGGCUUAUGAAACCCCAAUGCUGCCCUUUCUGCUCCUUUCUCCACACCCCCCUUGGGGCCUCCCCUCCACUCCUUCCCAAAUCUGUCUCCCCAGAAGACACAGGAAACAAUGUAUUGUCUGCCCAGCAAUCAAAGGCAAUGCUCAAACACCCAAGUGGC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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2402.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2496.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 1910.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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