Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_000107.3

Sequence Length

1815 nt

GC Content

0.5399

GGUUUGAACAAGCCCUGGGCAUGUUUGGCGGGAAGUUGGCUUAGCUCGGCUACCUGUGGCCCCGCAGUUUUGUAGUCCCCGCCUUGUUUCUCCCCAGAGGCCUCUCAAUCCUCCCUCCAUGAUCUUCGCAUAGAGCACAGUACCCCUUCACACGGAGGACGCGAUGGCUCCCAAGAAACGCCCAGAAACCCAGAAGACCUCCGAGAUUGUAUUACGCCCCAGGAACAAGAGGAGCAGGAGUCCCCUGGAGCUGGAGCCCGAGGCCAAGAAGCUCUGUGCGAAGGGCUCCGGUCCUAGCAGAAGAUGUGACUCAGACUGCCUCUGGGUGGGGCUGGCUGGCCCACAGAUCCUGCCACCAUGCCGCAGCAUCGUCAGGACCCUCCACCAGCAUAAGCUGGGCAGAGCUUCCUGGCCAUCUGUCCAGCAGGGGCUCCAGCAGUCCUUUUUGCACACUCUGGAUUCUUACCGGAUAUUACAAAAGGCUGCCCCCUUUGACAGGAGGGCUACAUCCUUGGCGUGGCACCCAACUCACCCCAGCACCGUGGCUGUGGGUUCCAAAGGGGGAGAUAUCAUGCUCUGGAAUUUUGGCAUCAAGGACAAACCCACCUUCAUCAAAGGGAUUGGAGCUGGAGGGAGCAUCACUGGGCUGAAGUUUAACCCUCUCAAUACCAACCAGUUUUACGCCUCCUCAAUGGAGGGAACAACUAGGCUGCAAGACUUUAAAGGCAACAUUCUACGAGUUUUUGCCAGCUCAGACACCAUCAACAUCUGGUUUUGUAGCCUGGAUGUGUCUGCUAGUAGCCGAAUGGUGGUCACAGGAGACAACGUGGGGAACGUGAUCCUGCUGAACAUGGACGGCAAAGAGCUUUGGAAUCUCAGAAUGCACAAAAAGAAAGUGACGCAUGUGGCCCUGAACCCAUGCUGUGAUUGGUUCCUGGCCACAGCCUCCGUAGAUCAAACAGUGAAAAUUUGGGACCUGCGCCAGGUUAGAGGGAAAGCCAGCUUCCUCUACUCGCUGCCGCACAGGCAUCCUGUCAACGCAGCUUGUUUCAGUCCCGAUGGAGCCCGGCUCCUGACCACGGACCAGAAGAGCGAGAUCCGAGUUUACUCUGCUUCCCAGUGGGACUGCCCCCUGGGCCUGAUCCCGCACCCUCACCGUCACUUCCAGCACCUCACACCCAUCAAGGCAGCCUGGCAUCCUCGCUACAACCUCAUUGUUGUGGGCCGAUACCCAGAUCCUAAUUUCAAAAGUUGUACCCCUUAUGAAUUGAGGACGAUCGACGUGUUCGAUGGAAACUCAGGGAAGAUGAUGUGUCAGCUCUAUGACCCAGAAUCUUCUGGCAUCAGUUCGCUUAAUGAAUUCAAUCCCAUGGGGGACACGCUGGCCUCUGCAAUGGGUUACCACAUUCUCAUCUGGAGCCAGGAGGAAGCCAGGACACGGAAGUGAGAGACACUAAAGAAGGUGUGGGCCAGACAAGGCCUUGGAGCCCACACAUGGGAUCAAGUCCUGCAAGCAGAGGUGGCGAUUUGUUAAAGGGCCAAAAGUAUCCAAGGUUAGGGUUGGAGCAGGGGUGCUGGGACCUGGGGCACUGUGGGACUGGGACACUUUUAUGUUAAUGCUCUGGACUUGCCUCCAGAGACUGCUCCAGAGUUGGUGACACAGCUGUCCCAAGGGCCCCUCUGUAUCUAGCCUGGAACCAAGGUUAUCUUGGAACUAAAUGACUUUUCUCCUCUCAGUGGGUGGUAGCAGAGGGAUCAAGCAGUUAUUUGAUUUGUGCUCACUUUUGAUAUGGCCAAUAAAACCAUACCGACUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-657.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -689.77

Frequency: 0.0000

Diversity: 352.36

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.((((....((((((((.......((((((.(((((...))))).(((((((((((....)))))....)))))))))))).........))))).)))...)))).)).....................((((((((....(((((....)))))..((....))..((((((...(((((..(((..(((((...(((.((.((.(((...((((((((...(((((((((.((((.(((((...((((((....(((((((.((((((((((((..(((((....))))).)).((.(((((.(((((((.....)))))))(.((((((.((((...........))))))).))).).))))).)).(((...))).(((((....))))))))))))))).))))).))..))))))))))))))).))..)))))))(((.((((((((.......)))))........((((..(((((((.....))).)))).....))))...))))))..........(((((((((.(.((((((((((((((((..((((........))))....))))))...........)))))))(((((((...(((((((((((((((((((((.......((((.........((((((.....((((....((((((.(((((.....)))))..(((.((((((((((((((......(((((.((((...))))..)))))....((((...........)))))))))))))))))).)))((((((.....((((..(.(((.((((((((....((((.....))))..))))).))).))).).)))).....(((((((....)))))..))...........(.((.((.(((((((..(((((.((......)).)))))..))))))))).)))))))))......))))))..))))((((((...))))))))))))..)))).))))))))))...(((((...(((((...)))))....)))))..)))))))))))))))))).(((((.(((((((..(((((.....(((.(((((...(((..((((((((....((((((((((((...)))).((((((((....(((....((((((((....(((...........)))...((((((.(((((.........((((((..((((((.(((.((....((((...((((.(((........))).))))...))))(.(((((.....))))).)........(((((((..((.((((......)))).))..))))))))).))).)))))).))))))......((((....))))....(((((.((((..(((((..........))))).)))))))))))))).))))))....)))))))))))............((((((((....(((....)))..)))))))).))))))))))))))))))))))))..)))))))))))....)).........)))..))))))))))))))).).))))))))).))))))))...))).)))).)))..)))))..)))..))(((((((......))))))).....(((((.(((((..(((.((..((((...))))..)).)))..)))))))))).....)))..))))))...((((((((((((.(((.(((.((........)).))))))..))).)))))))))..))))))))....(((.(((((.........))))).)))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.((((....((((((((.......((((((.{{{{{,,.,}))).(((((((((((....)))))....)))))))))))).........))))).)))...)))).))........,,...........((((((({...{((((,...((((((.{....(((.{,....,.....,,..}....}}}...}.))))))....{((.,,,({{(({,.,....(((((((.(((((((..(((({((((((((((..(((((.((((((((((((..{((((....))))).)},{{.({(((.{((((((.....))))))){,((({{{.{||{.,.....,,,,|}}}}}|,||}.}.))))},)),|||...}}}.(((((....))))))))))))))).)))))..((((...))))))))))))|(((.((((((((.....(((((.......))))).....))))))))))|((((((((..,{|.({(((((.{(...}|.))))}.})|.....((((((((......)))).))))..))))))))|,....}}..))))}))..(((((((.{{...((((((((((((({((((...(((((((((((((((((((((.....,.((((.........((((((.....,,,,,,{,((((((.{{{{{,,.,,|||||..(((.((((((((((((((......(((((.((((...))))..)))))....((((...........)))))))))))))))))).))){{|,(((....((((..{.(((.{(((((((....((((.....))))..))))).))}.))).}.))))....}}}(((({....}))))..,|,{.........}}},,||.(((((((..(((((.((......)).)))))..)))))))}),))})),)).......))))))..))))((((((...))))))))))))..)))),))))))))))...(((((.,.(((((...)))))....)))))..)))))))))))))))|||,..,|||||,{....,|||,},}..|||}..}.,,}}.},,..(((((((({{{{(,(((,,,,{||,}})))}{((,,(((({{{{,((....((((((((....,,,.....{......))..,((((((.(((((.{{(((((......))))}||{,.,...,,,.,|,,......||...,{,{({.{((({{(((..{((((..(.(((((.....))))).)...)))),(((((((..((.((((......)))).))..)))))))((....{(((({.....}))))}....}})))))))))}},.(((({{((({..(((((..........))))).}))))))))))))).)))))).,..)))))))),,)........,,.)|||||||,}}}.,.{{{.{|||{.,||||,,,.}))),)))))})))},)))))))))))).).))))))...}})))))))...((({,(((((((..((.((.((((((.(((((((((((((((..{{{.......,,||,.....,,,,...,(((((((......)))))))..))))))))(((((......)))))))))),,).)))))))).)}))))))))))).(((((,...,)))))........)))))))))))))),..})))}),}}))})))))((((({......})))))}))))))).,..{{(.(((((.........))))).))}..,.