Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000123.4
Sequence Length
3888 nt
GC Content
0.4570
CUUCCGGGAGGCGGUGACAGCUGCUGAGACGUGUUGCAGCCAGAGUCUCUCCGCUUUAAUGCGCUCCCAUUAGUGCCGUCCCCCACUGGAAAACCGUGGCUUCUGUAUUAUUUGCCAUCUUUGUUGUGUAGGAGCAGGGAGGGCUUCCUCCCGGGGUCCUAGGCGGCGGUGCAGUCCGUCGUAGAAGAAUUAGAGUAGAAGUUGUCGGGGUCCGCUCUUAGGACGCAGCCGCCUCAUGGGGGUCCAGGGGCUCUGGAAGCUGCUGGAGUGCUCCGGGCGGCAGGUCAGCCCCGAAGCGCUGGAAGGGAAGAUCCUGGCUGUUGAUAUUAGCAUUUGGUUAAACCAAGCACUUAAAGGAGUCCGGGAUCGCCAUGGGAACUCAAUAGAAAAUCCUCAUCUUCUCACUUUGUUUCAUCGGCUCUGCAAACUCUUAUUUUUUCGAAUUCGUCCUAUUUUUGUGUUUGAUGGGGAUGCUCCACUAUUGAAGAAACAGACUUUGGUGAAGAGAAGGCAGAGAAAGGACUUAGCGUCCAGUGACUCCAGGAAAACGACAGAGAAGCUUCUGAAAACAUUUUUGAAAAGACAAGCCAUCAAAACUGCCUUCAGAAGCAAAAGAGAUGAAGCACUACCCAGUCUUACCCAAGUUCGAAGAGAAAACGACCUCUAUGUUUUGCCUCCUUUACAAGAGGAAGAAAAACACAGUUCAGAAGAGGAAGAUGAAAAAGAAUGGCAAGAAAGAAUGAAUCAAAAACAAGCAUUACAGGAAGAGUUCUUUCAUAAUCCUCAAGCGAUAGAUAUUGAGUCUGAGGACUUCAGCAGCCUGCCCCCUGAAGUAAAGCAUGAAAUCUUGACUGAUAUGAAAGAGUUCACCAAGCGCAGAAGAACAUUAUUUGAAGCAAUGCCAGAGGAGUCUGAUGACUUUUCACAGUACCAACUCAAAGGCUUGCUUAAAAAGAACUAUCUGAACCAGCAUAUAGAACAUGUCCAAAAGGAAAUGAAUCAGCAACAUUCAGGACACAUCCGAAGGCAGUAUGAAGAUGAAGGGGGCUUUCUGAAGGAGGUAGAGUCAAGGAGAGUGGUCUCUGAAGACACUUCACAUUACAUCUUGAUAAAAGGUAUUCAAGCUAAGACAGUUGCAGAAGUGGAUUCAGAGUCUCUUCCUUCUUCCAGCAAAAUGCACGGCAUGUCUUUUGACGUGAAGUCAUCUCCAUGUGAAAAACUGAAGACAGAGAAAGAGCCUGAUGCUACCCCUCCUUCUCCAAGAACUUUACUAGCUAUGCAAGCUGCCCUGCUGGGAAGUAGCUCAGAAGAGGAGCUGGAGAGUGAAAAUCGAAGGCAGGCCCGUGGGAGGAACGCACCUGCUGCUGUAGACGAAGGCUCCAUAUCACCCCGGACUCUUUCAGCCAUUAAGAGAGCUCUUGACGAUGACGAAGAUGUAAAAGUGUGUGCUGGGGAUGAUGUGCAGACGGGAGGGCCAGGAGCAGAAGAAAUGCGUAUAAACAGCUCCACCGAGAACAGUGAUGAAGGACUUAAAGUGAGAGAUGGAAAAGGAAUACCGUUUACUGCAACACUUGCGUCAUCUAGUGUGAACUCUGCAGAGGAGCACGUAGCCAGCACUAAUGAGGGGAGAGAGCCCACAGACUCAGUUCCAAAAGAACAAAUGUCACUUGUUCACGUGGGGACUGAAGCCUUUCCGAUAAGUGAUGAGUCUAUGAUUAAGGACAGAAAAGAUCGGCUGCCUCUGGAGAGUGCAGUGGUUAGACAUAGUGACGCACCUGGGCUCCCGAAUGGAAGGGAACUGACACCGGCAUCUCCAACUUGUACAAAUUCUGUGUCAAAGAAUGAAACACAUGCUGAAGUGCUUGAGCAGCAGAACGAACUUUGCCCAUAUGAGAGUAAAUUCGAUUCUUCUCUUCUUUCAAGUGAUGAUGAAACAAAAUGUAAACCGAAUUCUGCUUCUGAAGUCAUUGGCCCUGUCAGUUUGCAAGAAACAAGUAGCAUAGUAAGUGUCCCUUCAGAGGCAGUAGAUAAUGUGGAAAAUGUGGUGUCAUUUAAUGCUAAAGAGCAUGAGAAUUUUCUGGAAACCAUCCAAGAACAGCAGACCACUGAAUCUGCAGGCCAGGAUUUAAUUUCCAUUCCAAAGGCCGUGGAACCAAUGGAAAUUGACUCGGAAGAAAGUGAAUCUGAUGGAAGUUUCAUUGAAGUGCAAAGUGUGAUUAGUGAUGAGGAACUUCAAGCAGAAUUCCCUGAAACUUCCAAACCUCCCUCAGAACAAGGCGAAGAGGAACUGGUAGGAACUAGGGAGGGAGAAGCCCCUGCUGAGUCCGAGAGCCUCCUGAGGGACAACUCUGAGAGGGACGACGUGGAUGGUGAGCCACAGGAAGCUGAGAAAGAUGCGGAAGAUUCGCUCCAUGAAUGGCAAGAUAUUAAUUUGGAGGAGUUGGAAACUCUGGAGAGCAACCUCUUAGCACAGCAGAAUUCACUGAAAGCUCAAAAACAGCAGCAAGAACGGAUCGCUGCUACUGUCACCGGACAGAUGUUCCUGGAAAGCCAGGAACUCCUGCGCCUGUUCGGCAUUCCCUACAUCCAGGCUCCCAUGGAAGCAGAGGCGCAGUGCGCCAUCCUGGACCUGACUGAUCAGACUUCCGGAACCAUCACUGAUGACAGUGAUAUCUGGCUGUUUGGAGCGCGGCAUGUCUAUAGAAACUUUUUUAAUAAAAACAAGUUUGUAGAAUAUUAUCAAUAUGUGGACUUUCACAAUCAAUUGGGAUUGGACCGGAAUAAGUUAAUAAAUUUGGCUUAUUUGCUUGGAAGUGAUUAUACCGAAGGAAUACCAACUGUGGGUUGUGUAACCGCCAUGGAAAUUCUCAAUGAAUUCCCUGGGCAUGGCCUGGAACCUCUCCUAAAAUUCUCAGAAUGGUGGCAUGAAGCUCAAAAAAAUCCAAAGAUAAGACCUAAUCCUCAUGACACCAAAGUGAAAAAAAAAUUACGGACAUUGCAACUCACCCCUGGCUUUCCUAACCCAGCUGUUGCCGAGGCCUACCUCAAACCCGUGGUGGAUGACUCGAAGGGAUCCUUUCUGUGGGGGAAACCUGAUCUCGACAAAAUUAGAGAAUUUUGUCAGCGGUAUUUCGGCUGGAACAGAACGAAGACAGAUGAAUCUCUGUUUCCUGUAUUAAAGCAACUCGAUGCCCAGCAGACACAGCUCCGAAUUGAUUCCUUCUUUAGAUUAGCACAACAGGAGAAAGAAGAUGCUAAACGUAUUAAGAGCCAGAGACUAAACAGAGCUGUGACAUGUAUGCUAAGGAAAGAGAAAGAAGCAGCAGCCAGCGAAAUAGAAGCAGUUUCUGUUGCCAUGGAGAAAGAAUUUGAGCUACUUGAUAAGGCAAAAGGAAAAACCCAGAAGAGAGGCAUAACAAAUACCUUAGAAGAGUCAUCAAGCCUGAAAAGAAAGAGGCUUUCAGAUUCUAAAGGAAAGAAUACAUGCGGUGGAUUUUUGGGGGAGACCUGCCUCUCAGAAUCAUCUGAUGGAUCUUCAAGUGAAGAUGCUGAAAGUUCAUCUUUAAUGAAUGUACAAAGGAGAACAGCUGCGAAAGAGCCAAAAACCAGUGCUUCAGAUUCGCAGAACUCAGUGAAGGAAGCUCCCGUGAAGAAUGGAGGUGCGACCACCAGCAGCUCUAGUGAUAGUGAUGACGAUGGAGGGAAAGAGAAGAUGGUCCUCGUGACCGCCAGAUCUGUGUUUGGGAAGAAAAGAAGGAAACUAAGACGUGCGAGGGGAAGAAAAAGGAAAACCUAAUUAAAAAAUAUGUAUCCUCUAUAAUUAGUUAUGACAGCCAUUUGUAAUGAAUUUGUCGCAAAGACGUAAUAAAAUUAACUGGUGGCACGGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1150.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1225.12
Frequency: 0.0000
Diversity: 1010.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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