Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_000670.5

Sequence Length

2002 nt

GC Content

0.4056

ACGGAACUCCCUGGGUAGGAGUUUGAAGCUUUCUUAACUCAGAAAGAAACUUCCAACACAGUUUCCCAAAGAAAAAUGGGCACCAAGGGCAAAGUUAUUAAAUGCAAAGCAGCCAUCGCCUGGGAAGCAGGCAAGCCCCUUUGCAUUGAAGAGGUUGAAGUAGCUCCCCCCAAGGCUCAUGAAGUUCGCAUUCAGAUCAUUGCUACCUCUCUGUGCCAUACUGAUGCCACUGUUAUCGAUUCUAAAUUUGAGGGCCUAGCUUUCCCAGUGAUCGUUGGCCAUGAGGCUGCAGGUAUUGUGGAAAGUAUUGGGCCAGGAGUGACCAACGUCAAACCAGGUGACAAAGUAAUUCCACUUUAUGCACCUCUAUGUAGAAAAUGCAAGUUUUGUCUGAGUCCACUCACAAAUUUGUGUGGGAAAAUCAGUAAUCUCAAAAGUCCUGCUAGUGAUCAACAACUAAUGGAAGACAAAACCAGCAGGUUUACCUGCAAAGGAAAACCAGUUUACCAUUUCUUUGGAACCAGUACAUUCUCUCAGUACACUGUGGUGUCAGAUAUCAAUCUUGCCAAAAUAGAUGAUGAUGCAAAUUUAGAGAGAGUUUGUCUGCUUGGAUGUGGGUUUUCAACUGGCUAUGGGGCUGCAAUCAACAAUGCCAAGGUCACCCCUGGUUCGACUUGUGCUGUCUUUGGCCUAGGAGGUGUGGGUCUUUCUGCUGUAAUGGGUUGUAAAGCAGCAGGAGCUUCCAGAAUCAUAGGUAUUGACAUCAACAGUGAGAAGUUUGUGAAGGCUAAAGCCCUGGGAGCCACUGACUGCCUCAAUCCUAGAGACUUACAUAAACCGAUCCAGGAAGUUAUCAUUGAAUUGACCAAGGGAGGUGUGGAUUUUGCCCUUGACUGUGCAGGUGGAUCUGAAACCAUGAAAGCAGCCCUGGACUGUACAACCGCAGGCUGGGGAUCAUGUACUUUCAUUGGAGUAGCUGCUGGUAGCAAAGGAUUGACUAUUUUUCCAGAGGAGCUAAUAAUCGGCCGUACUAUAAAUGGAACAUUCUUUGGUGGUUGGAAAAGUGUAGAUUCUAUCCCAAAGCUGGUCACUGACUAUAAGAAUAAGAAAUUCAAUCUGGAUGCACUGGUGACCCAUACCCUGCCUUUUGACAAAAUCAGUGAGGCAUUUGACCUAAUGAACCAAGGAAAAAGCGUCCGAACAAUCCUCAUCUUUUGAAGAUGCCAGGAGCAAUUCAGAAUACUAUCUGAUUGAAUGUGAACCUGCCUGGUUAAUUUAUUACCUGAUUUGAUGAACCAAGGAAAGCCAUGAGUUUAAACAAAUAUUUACAUUUAAUAUGGGAACAUAAAAGAGCUUUAAAUAUUAUAGACUUUGUACCUGUUAUAUAUAUGAAUAUUCCCUAUGUUAAAUAAUAAUAAUAACUAGUGUUUAUGAAUAGAAUCAUAUCAUCUUUAGAAAUUGUUUAAAAUUAGUUCUGGGAAGUUGAAAGUGGGGAAUGAAGAGAUAAUAAAUAAAACUAGAUUGGCCAUAUGUUUAUAAUUUUUUUAGAUUGGGUAAUGAAUACAUGGAGUUUCAUUAUACUUUUCUCUCCACUUUUGUCUAUGUUGAAAAUUUUCUGGGAGCUAAAUGAUGAGAACACAUGGACACAUGAUGGGGAACAACACACACUGGGGCCUGUUGAGGGCAGGGAGUCGGCAGAGAGAGAGCAUCAGGAAGAAUAGCUAAUGGAUGCUGGGCUUCAUACCUGGGUGAUGAGAUGAUCUGUGCAGCAAAGCACCAUGGUACAUGUUUACCUAUGUAACAAACCUGCACAUCCUGCACAUGUACCCUGGAACUUAAUAAAAGUUGGAAAUUUUUAAAAAGAAUGAAUAAGACCUGGUAUUUGAUAGCACAACAGGGAGACUAUAGUCAACAGCAAUUUAAUUGUAUAUUUUAAUAUGACUAAAAGAGUAUAAUGGAUUGUUUGUAACACAAAUAAAUGCUUGAGGAGAUGGACACCCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-544.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -587.12

Frequency: 0.0000

Diversity: 505.23

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((((((.......)))))))((((.((((((........))))))))))...........((((........))))..((..(((((...(((((.(((((((((..((....(((((.....)))))..))..)))))))))......(((((.(((((((((((((.((((..(((((.((((((((((..((.....((((((((((((....((((((((((.((..((((........)))).(((((((((((((((((.(((...((((....))))...))))))).)))))))..)))))).((..((((....))))..))(((((.((((((......))))..)))))))............(((..(((((((((((((((.(.((((....)))).))))...........))).....(((...((((........))))..))))))))))))..)))(((((.(((....))).)))))......(((......))).....((((.........)))))).)))))))))).(((((.(((.........))))))))..)))....))))))).)).....)).))))))))))..)))))...)))).))))..(((.(((((..((((((.((((...(((((.(((..(((((..((((((((.....(((((((.(((..(((((((((..((.....))..)))))))))((((((((..(((((((..((..(((.....)))..)).))))))).(((....))))))))))).))).)).)))))....))))))))...)))))..))).))))).....((((((..(((..(((.....((((((((....((((....((((....((((........))))....))))((((((.((((......)))).))))))((((.((((((((....))).)).)))))))((((....((((.((((((((((...((.(((.....((.((((.(((..............((((((.(((.((((.........)))))))))))))..(((((((.............((..(((((...)))))...)))))))))....((((((((((.((((...((((((.((((((......))))..))..(((.......)))......((((((((...((((...((((((((((((.((((......)))))))).........)).))))))...)))).......(((((.(((((((.((....)).)).)))))..)))))......((((((((((((((((....((((((.(((...))).)).)))).....))))................))))))))))))..............(((((((((......(((((......((((((.....)))))).((((((((.(((((..(((((((((((..(((((((((((...........((....((((.(((((((.((((.........)))).))))))).))))....))))))).)))))))))))))))))..)).............))).))))))))))))).......)))))))))..))))))))........))))))....))))))))))))))))))))).)).....))).)).)))))))))).))))...)))))))))))))))))))..)))..))))))...(((......)))(((.(((((((((.......((((.......))))........))))))))).)))..(((..((((((((...))))))))..))).........))))))))))))))).))).....))))).))))..)))))(((((((((.((((((.(((((.......)))))..))))))))))))))).........))))).)))))..))...(((.....)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,{..{((({(({((,{{{(({{,,,,{(((((,.....})})))}}})}}),.,}.,}},,.((((........))))..{(..{((({...{{.{,.(((((((((..((....(((((.....)))))..))..)))))))))......(((((.(((((((((((((.((({,,(((((,((((((((((..{{..((,,{((((((((((....((((((((((.({..((((........)))).(((((((((((((((((.(((,.,((((....))))},.))))))).)))))))..)))))).((..((((....))))..))(((((.,(((((......)))),.},)))))......|.....{((..(((((((((,,.(((,(.((((....})))})))}.....,,....,,......{{{.,.((((........)))).,))))))))))))..))}(((((.(((....))).))))).{,,..(((......))),,,..((((.........))))}).)))))))))).{((({{(((.........)))))))),,)))....))))))),))..}}.}}.}))))))))),.)))))..,)))).))))|.(((.(((({.,(((((,,((((...(((((.(((..(((((..((((((((.....(((((((.(((..(((((((((..,{.....,,..)))))))}}((((((((..(((((({..((..({{.....))}.,,,.))))))).(((....))))))))))).})),)),)))))....))))))))...)))))..))).)))))..,,.,{({,,..,,|}}|({{{{{,{({,,,,|,,,.,|||}}}.((((((((((,{.{{{.,.,{{{{{,,{({{{((((((.((((......)))).))))))..,.,,{,||||},..})}}|}|}}}}||||((({.,,.((({.((((((((((.{,,,.(((.....((.((((.(((....|||...,,,,((((((.((||((({.........)))))))))))))..((((((({..,...,({,,.....,|}|..,}},,}},...})))))))....(((((((((({((((...((((((,{((.(({..{{{.........}}}..}},}}.}}}......{((((((({((((((((((.((((.,(((,(((((......)))))}}}..,,}...|}},||||||{,.,|||,,,....(((((.(((((((.((....)).)).)))))..)))))......(((((((((((((({{,...{{({{{.{{....,,|,|}.}}}}.....}))},,|,.,,,,.,,.}}})),)))))))))..,}}},.,}}}}}|,||,(((({......})}}}.))))))))))}....|||....((((((((.(((((.{(((((((((((..(((((((((((,,,,.,,,{{.......((((.(((((((.((({....,,,..}}}}.))))))).)))),)))).))))).))))))))))))))))).,{......,,..,.})))).)))))))).,}})},},.,,||||,,,.)}})})))))}........))))))....))))))))))))))))))))).)).....))).)).)))))))))).}}}}.,.))))}})))}},}}}}}|)}}|}}.}))),))}}||||}}....}},{((.(((((((({.{|,..,{|||.......})}),,,..,},))))))))).))),,(({..,{{|||||...,}||||}}..,}},,,......))))))))))))))).))).....))))).))))..))))){(((((((,{((((((.(((((.......)))))..))))))))))))))|{{{...,}}}},,,.)))))..)),}.,||....,)}.