Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_000699.4

Sequence Length

1584 nt

GC Content

0.4104

AACUUCAAAGCAAAAUGAAGUUCUUUCUGUUGCUUUUCACCAUUGGGUUCUGCUGGGCUCAGUAUUCCCCAAAUACACAACAAGGACGGACAUCUAUUGUUCAUCUGUUUGAAUGGCGAUGGGUUGAUAUUGCUCUUGAAUGUGAGCGAUAUUUAGCUCCGAAGGGAUUUGGAGGGGUUCAGGUCUCUCCACCAAAUGAAAAUGUUGCAAUUUACAACCCUUUCAGACCUUGGUGGGAAAGAUACCAACCAGUUAGCUAUAAAUUAUGCACAAGAUCUGGAAAUGAAGAUGAAUUUAGAAACAUGGUGACUAGAUGUAACAAUGUUGGGGUUCGUAUUUAUGUGGAUGCUGUAAUUAAUCAUAUGUGUGGUAACGCUGUGAGUGCAGGAACAAGCAGUACCUGUGGAAGUUACUUCAACCCUGGAAGUAGGGACUUUCCAGCAGUCCCAUAUUCUGGAUGGGAUUUCAAUGAUGGUAAAUGUAAAACUGGAAGUGGAGAUAUCGAGAACUACAAUGAUGCUACUCAGGUCAGAGAUUGUCGUCUGACUGGUCUUCUUGAUCUUGCACUGGAGAAGGAUUACGUGCGUUCUAAGAUUGCCGAAUAUAUGAACCAUCUCAUUGACAUUGGUGUUGCAGGGUUCAGACUUGAUGCUUCCAAGCACAUGUGGCCUGGAGACAUAAAGGCAAUUUUGGACAAACUGCAUAAUCUAAACAGUAACUGGUUCCCUGCAGGAAGUAAACCUUUCAUUUACCAGGAGGUAAUUGAUCUGGGUGGUGAGCCAAUUAAAAGCAGUGACUACUUUGGUAAUGGCCGGGUGACAGAAUUCAAGUAUGGUGCAAAACUCGGCACAGUUAUUCGCAAGUGGAAUGGAGAGAAGAUGUCUUACUUAAAGAACUGGGGAGAAGGUUGGGGUUUCGUACCUUCUGACAGAGCGCUUGUCUUUGUGGAUAACCAUGACAAUCAACGAGGACAUGGGGCUGGAGGAGCCUCUAUUCUUACCUUCUGGGAUGCUAGGCUGUACAAAAUGGCAGUUGGAUUUAUGCUUGCUCAUCCUUACGGAUUUACACGAGUAAUGUCAAGCUACCGUUGGCCAAGACAGUUUCAAAAUGGAAACGAUGUUAAUGAUUGGGUUGGGCCACCAAAUAAUAAUGGAGUAAUUAAAGAAGUUACUAUUAAUCCAGACACUACUUGUGGCAAUGACUGGGUCUGUGAACAUCGAUGGCGCCAAAUAAGGAACAUGGUUAUUUUCCGCAAUGUAGUGGAUGGCCAGCCUUUUACAAAUUGGUAUGAUAAUGGGAGCAACCAAGUGGCUUUUGGGAGAGGAAACAGAGGAUUCAUUGUUUUCAACAAUGAUGACUGGUCAUUUUCUUUAACUUUGCAAACUGGUCUUCCUGCUGGCACAUACUGUGAUGUCAUUUCUGGAGAUAAAAUUAAUGGCAAUUGCACAGGCAUUAAAAUUUACGUUUCUGAUGAUGGCAAAGCUCAUUUUUCUAUUAGUAACUCUGCUGAAGAUCCAUUUAUUGCAAUUCAUGCUGAAUCUAAAUUGUAAAAUUUAAAAUUAAAUGCAUGUCCUCAAAACAAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-439.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -472.88

Frequency: 0.0000

Diversity: 273.02

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((........)))))))..(((((((..........(((((((((....)))))))))...(((((..........(((...((((((((.((.(((((((((((...((((...(((((((((((((((........)))))))).)))))))...(((((((((((....)))))))))))(((((((.(((((..((((.......))))..)))))....)))))))......((((.((((((((.((.((.((((((((....((((....(((((.((((((((...(((((.((.((.....)).)).))))).)))))))).)))))..))))(((((((((...((((.((((....))))))))(((((((((.((((.((.(((((.((((((((((((.......)))))...)))))))))(.((((((((.......)))))))).)..((((((((..((((...((.((.((....)).)).))...))))....))))).)))(((((((........)))))))))))).)))).))))))))).......))))))).))..((((((((((((.....((((.....((((.....(((..(((((...(((((((....))).))))...)))))..))).....))))))))..)))))))))))).....)))))))).))...))))))))))(((.....))).....((((.(((.(((((....))))).)))...)))))))).)))).....))))))...((((((.((((((((((((((..((..((......))..))....))))))).)).)))))...)))))).))))).)).))))))))..))).......)))))((((((((((....))).))))))))))))))...(((((...((((....))))))))).....((((((((((((((((.(.(((((.((((((........))))))..))))).)....(((((.((((.(((...((((((...((((....)))).....))))))..))).)))).)))))((((((..(((((.....((.(...).))......)))))..)).)))).(((........)))(((((((.....)))))))......(((..((((((((((((.((((((((((((..(((...)))..))).)).............)))))))..)))))).))))))..))))))))))(((((((.((((.......(((((.((((..((((((.((((.((((((....(((((((.((((((((...)))))))).(((((((....................))))))).)))).))).((((...)))).(((((((...((((((.(((((((((.(.........).)))))..))))..))))))...)))))))..(((.((......)).)))..)))).)).)))).)))))).))))..))))).......)))).)))))))(((((....))))).))))))))).........

Thermodynamic Ensemble Prediction

{((((((........))))))}...,,(((({,,,,,,...(((((((((....)))))))))..,(((((..........{((...((((((((.((.((((((((((({(.((((...(((((((((((((((........))))))))))}))),)}..(((((((((((....))))))))))|((((((,.(((((..((((.......))))..)))))....}))))))......,{{{{((((((({,{{.{{.((((((((....{(((,...(((((.((((((({...(((((.((.((.....)).)).))))).}))))))).))))).,}|||(((((((((..,((((.((((....))))))))(((((((((.((((.((.(((,{{((((((((((((.....,.)))))),.}))))))))|,{(((((((.......)))))))}....((((((((.,((((...((.((.((....)).)).))...)))).,..))))).)))(((((((........)))))))))))).)))).))))))))).......))))))).))||{(((((((((((.....,,{({{{(.,,,{,,,,.,..,}|}|||,,|||}}}}|..,,|,{((,{{{{{,||,|..,,})).))))).)))...)))))))))))),....)))))))).}}...}}))))))))|{{,,.,.)},.....{(({.(((.(((((....))))).)))...))))))}}.)))).)),.}}))))...(((((({((((((((((((((..,,..,,,,.....},,},....))))))).)},)))))}}.)))))).))))).)).))))))))..))).......)))))|(((((({({....,),.)))))))))})))),,.(((((...((((....))))))))).,...((((((((((((((((.{.(((((.((((((........))))))..))))).}....{((((.((((.(((...((((((...((((....)))).....))))))..))).}))).))))}(((({(..(((((,,...,{.|,,.).,}.,,...}))))..))})))).(((........)))(((((((.....)))))))......(((..((((((((((((.(((((((({(((,.{{,...,||..)}),}}......,,..,..)))))))..)))))).))))))..))))))))))(((((((.((((..,....(((((.((((..((((((.(((({(.((((....(((((((.((((((((...)))))))).(((((((,,.............,}...))))))).)))).))).((({...}))).(((((((.,.((((((.((,((((((.(.........).)))))}..)))..))))))},.)))))))..{{{.{{......,}.}}}..)))).))})))}.)))))).))))..))))).......)))).))))))){((({....})))}.))))))))).........