Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000733.4
Sequence Length
1361 nt
GC Content
0.5209
AGAAACCCUCCUCCCCUCCCAGCCUCAGGUGCCUGCUUCAGAAAAUGAAGUAGUAAGUCUGCUGGCCUCCGCCAUCUUAGUAAAGUAACAGUCCCAUGAAACAAAGAUGCAGUCGGGCACUCACUGGAGAGUUCUGGGCCUCUGCCUCUUAUCAGUUGGCGUUUGGGGGCAAGAUGGUAAUGAAGAAAUGGGUGGUAUUACACAGACACCAUAUAAAGUCUCCAUCUCUGGAACCACAGUAAUAUUGACAUGCCCUCAGUAUCCUGGAUCUGAAAUACUAUGGCAACACAAUGAUAAAAACAUAGGCGGUGAUGAGGAUGAUAAAAACAUAGGCAGUGAUGAGGAUCACCUGUCACUGAAGGAAUUUUCAGAAUUGGAGCAAAGUGGUUAUUAUGUCUGCUACCCCAGAGGAAGCAAACCAGAAGAUGCGAACUUUUAUCUCUACCUGAGGGCAAGAGUGUGUGAGAACUGCAUGGAGAUGGAUGUGAUGUCGGUGGCCACAAUUGUCAUAGUGGACAUCUGCAUCACUGGGGGCUUGCUGCUGCUGGUUUACUACUGGAGCAAGAAUAGAAAGGCCAAGGCCAAGCCUGUGACACGAGGAGCGGGUGCUGGCGGCAGGCAAAGGGGACAAAACAAGGAGAGGCCACCACCUGUUCCCAACCCAGACUAUGAGCCCAUCCGGAAAGGCCAGCGGGACCUGUAUUCUGGCCUGAAUCAGAGACGCAUCUGACCCUCUGGAGAACACUGCCUCCCGCUGGCCCAGGUCUCCUCUCCAGUCCCCCUGCGACUCCCUGUUUCCUGGGCUAGUCUUGGACCCCACGAGAGAGAAUCGUUCCUCAGCCUCAUGGUGAACUCGCGCCCUCCAGCCUGAUCCCCCGCUCCCUCCUCCCUGCCUUCUCUGCUGGUACCCAGUCCUAAAAUAUUGCUGCUUCCUCUUCCUUUGAAGCAUCAUCAGUAGUCACACCCUCACAGCUGGCCUGCCCUCUUGCCAGGAUAUUUAUUUGUGCUAUUCACUCCCUUCCCUUUGGAUGUAACUUCUCCGUUCAGUUCCCUCCUUUUCUUGCAUGUAAGUUGUCCCCCAUCCCAAAGUAUUCCAUCUACUUUUCUAUCGCCGUCCCCUUUUGCAGCCCUCUCUGGGGAUGGACUGGGUAAAUGUUGACAGAGGCCCUGCCCCGUUCACAGAUCCUGGCCCUGAGCCAGCCCUGUGCUCCUCCCUCCCCCAACACUCCCUACCAACCCCCUAAUCCCCUACUCCCUCCACCCCCCCUCCACUGUAGGCCACUGGAUGGUCAUUUGCAUCUCCGUAAAUGUGCUCUGCUCCUCAGCUGAGAGAGAAAAAAAUAAACUGUAUUUGGCUGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-411.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -437.79
Frequency: 0.0000
Diversity: 360.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...................(((((..((((((((((((((.....)))))))).........((((....))))(((((((..((...(((..((((...((..((((((((..((((((((......))))...((((((((((..(...((((((((.(..(((((((((.......(((((((((.(((.((..(((((((..(..........(((...((..(((......)))..))...))).(((((((((((((((..(((.......(((((..................))))).....))).))))))...........(((((((((....)))).))))).((((((....))))))...(((((.(((((.((......((.((((.((.....)).)))).))........))..)))))...))))).))))))))).)..)))))))((((((.(((((((.(...(((((((.((((.((((..........)))).)))).))))))).(((((((((((.(.(.(((....)))).).))))))...(((..(((..((((((.((.(((((....((((..((((((((((((.(((((..(((((........((((.(((........(((((((.((.(((((...((((((...((((((((((((((((...((.((((..((.((.(((((......)))))...)).)))))).))....)))))))))))((((.....((..(((.....))).))...)))))))))))))))))))).)).......(((.(((........)))...))).))).))))....)))))))(((..........)))...)))))..)))))...))))))))))))..)))).....(((((((......((((....))))......))))))).......)))))))))))))))).)))....((.(((......))).)).....))))).(((....))).....).))))))).)))))))).))))))))).))).....))).)))))).))))(((((.......)))))........((((((((................)))))))))))))......)..).))))))))).)))).(..(((((...(((((.....)))))..)))))..).........................(((..(((....(((((.....................)))))....)))..)))...))))))))..))..))).)..)))...))..)))))))................)))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
...................(((((.(((((,,((((((((.....))))))))....}))).((((....)))){{(({{{..{{...(({..{{{{...{{..((((((((,.((((((((....,,)}}}...((((((((({,.,{{{((((({((.(..{((((((((..{,...(((((((((.(((.((..,{{({((.{(..........(((...{,..(((......)))..,,...))).(((((((((((((((.,,((.......(((((..................))))).....))).)))))}...........(((((((((....))))}})))).((((({....})))))...{((((.(((((.{{,.{,.,({.((((.((.....)).)))).}},}...,,})}..}))))...))))}.))))))))).}.})))))),((((((.(((((((.(...(((((((.((((.((((..........)))).)))).))))))).((((((,,(((((((..(({..{{{{{{|,|||||,...{({,{(((,.((((,..|}}|{{{,...{((((,,((({(({(((((.((((,..((((({.......(((({((,....,,{{({{{,....{{{{{{{...,{{(({...||{{,(((((((((((...((.((((..((.((.(((((......)))))...)).)))))).)).,..)))))))))))||||}..}}}}}}},|}}}}}.,|,||,..,||,||||,||||}}}}}},,})..,}}}.|||,{||....,{|{,||,,.|,..,)),)}}},,}}))),,)),}}}.}....}},)))},})),}}..})))),.,))|||||}}})),,)}}}......||||((((((..........))))),....)))))))...}}}.,,,)))),))),,))))))..,,,((,({{.....,))},)}....,|,,||.,,,....))}.,...}.))))))).)))))))),)),)))))).))).,,..))),))))}).}))|(((((.......))))),.......((((((((................))))))))}))}}}}}}..}..).))))))))).)))).{..(((((...(((((.....)))))..)))))..}......................,,,,{{.,,...,..(((((.....................))))).....)),,))},..||))})))..))..))).),,)}},{.}}..)}})))},,,...........,,}))))))))))...
Back