Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000759.4
Sequence Length
1513 nt
GC Content
0.5942
AGCCCGGAGCCUGCAGCCCAGCCCCACCCAGACCCAUGGCUGGACCUGCCACCCAGAGCCCCAUGAAGCUGAUGGCCCUGCAGCUGCUGCUGUGGCACAGUGCACUCUGGACAGUGCAGGAAGCCACCCCCCUGGGCCCUGCCAGCUCCCUGCCCCAGAGCUUCCUGCUCAAGUGCUUAGAGCAAGUGAGGAAGAUCCAGGGCGAUGGCGCAGCGCUCCAGGAGAAGCUGGUGAGUGAGUGUGCCACCUACAAGCUGUGCCACCCCGAGGAGCUGGUGCUGCUCGGACACUCUCUGGGCAUCCCCUGGGCUCCCCUGAGCAGCUGCCCCAGCCAGGCCCUGCAGCUGGCAGGCUGCUUGAGCCAACUCCAUAGCGGCCUUUUCCUCUACCAGGGGCUCCUGCAGGCCCUGGAAGGGAUCUCCCCCGAGUUGGGUCCCACCUUGGACACACUGCAGCUGGACGUCGCCGACUUUGCCACCACCAUCUGGCAGCAGAUGGAAGAACUGGGAAUGGCCCCUGCCCUGCAGCCCACCCAGGGUGCCAUGCCGGCCUUCGCCUCUGCUUUCCAGCGCCGGGCAGGAGGGGUCCUGGUUGCCUCCCAUCUGCAGAGCUUCCUGGAGGUGUCGUACCGCGUUCUACGCCACCUUGCCCAGCCCUGAGCCAAGCCCUCCCCAUCCCAUGUAUUUAUCUCUAUUUAAUAUUUAUGUCUAUUUAAGCCUCAUAUUUAAAGACAGGGAAGAGCAGAACGGAGCCCCAGGCCUCUGUGUCCUUCCCUGCAUUUCUGAGUUUCAUUCUCCUGCCUGUAGCAGUGAGAAAAAGCUCCUGUCCUCCCAUCCCCUGGACUGGGAGGUAGAUAGGUAAAUACCAAGUAUUUAUUACUAUGACUGCUCCCCAGCCCUGGCUCUGCAAUGGGCACUGGGAUGAGCCGCUGUGAGCCCCUGGUCCUGAGGGUCCCCACCUGGGACCCUUGAGAGUAUCAGGUCUCCCACGUGGGAGACAAGAAAUCCCUGUUUAAUAUUUAAACAGCAGUGUUCCCCAUCUGGGUCCUUGCACCCCUCACUCUGGCCUCAGCCGACUGCACAGCGGCCCCUGCAUCCCCUUGGCUGUGAGGCCCCUGGACAAGCAGAGGUGGCCAGAGCUGGGAGGCAUGGCCCUGGGGUCCCACGAAUUUGCUGGGGAAUCUCGUUUUUCUUCUUAAGACUUUUGGGACAUGGUUUGACUCCCGAACAUCACCGACGCGUCUCCUGUUUUUCUGGGUGGCCUCGGGACACCUGCCCUGCCCCCACGAGGGUCAGGACUGUGACUCUUUUUAGGGCCAGGCAGGUGCCUGGACAUUUGCCUUGCUGGACGGGGACUGGGGAUGUGGGAGGGAGCAGACAGGAGGAAUCAUGUCAGGCCUGUGUGUGAAAGGAAGCUCCACUGUCACCCUCCACCUCUUCACCCCCCACUCACCAGUGUCCCCUCCACUGUCACAUUGUAACUGAACUUCAGGAUAAUAAAGUGUUUGCCUCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-628.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -652.25
Frequency: 0.0000
Diversity: 362.97
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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