Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000795.4
Sequence Length
2808 nt
GC Content
0.6175
AGUGCCGAACCGGCAGCCUCACGCGCGCACCGCGCCGCCUCCGCCCCGUCCCCGCGCUCCCUCCUGCCCGCCCGCCCCGCGCCCGGCCCCGCCCCGCCCCGCCCCGCCGCGGCCCGUCCACUGCUCCCCGCGGGCCAGAGCCGGCCGAGCUGCUGCCCGCCGGGGCUCUGAACGGCGCGGCGGGGCCGGGAGCCAGGGACCGGCCGAGGAGAGUGGCGGCCCCGGACGGCUGCCGGAGGGGCGGCCGCGCGUGGAUGCGGCGGGAGCUGGAAGCCUCAAGCAGCCGGCGCCGUCUCUGCCCCCGGGCGCCCUAUGGCUUGAAGAGCCUGGCCACCCAGUGGCUCCACCGCCCUGAUGGAUCCACUGAAUCUGUCCUGGUAUGAUGAUGAUCUGGAGAGGCAGAACUGGAGCCGGCCCUUCAACGGGUCAGACGGGAAGGCGGACAGACCCCACUACAACUACUAUGCCACACUGCUCACCCUGCUCAUCGCUGUCAUCGUCUUCGGCAACGUGCUGGUGUGCAUGGCUGUGUCCCGCGAGAAGGCGCUGCAGACCACCACCAACUACCUGAUCGUCAGCCUCGCAGUGGCCGACCUCCUCGUCGCCACACUGGUCAUGCCCUGGGUUGUCUACCUGGAGGUGGUAGGUGAGUGGAAAUUCAGCAGGAUUCACUGUGACAUCUUCGUCACUCUGGACGUCAUGAUGUGCACGGCGAGCAUCCUGAACUUGUGUGCCAUCAGCAUCGACAGGUACACAGCUGUGGCCAUGCCCAUGCUGUACAAUACGCGCUACAGCUCCAAGCGCCGGGUCACCGUCAUGAUCUCCAUCGUCUGGGUCCUGUCCUUCACCAUCUCCUGCCCACUCCUCUUCGGACUCAAUAACGCAGACCAGAACGAGUGCAUCAUUGCCAACCCGGCCUUCGUGGUCUACUCCUCCAUCGUCUCCUUCUACGUGCCCUUCAUUGUCACCCUGCUGGUCUACAUCAAGAUCUACAUUGUCCUCCGCAGACGCCGCAAGCGAGUCAACACCAAACGCAGCAGCCGAGCUUUCAGGGCCCACCUGAGGGCUCCACUAAAGGGCAACUGUACUCACCCCGAGGACAUGAAACUCUGCACCGUUAUCAUGAAGUCUAAUGGGAGUUUCCCAGUGAACAGGCGGAGAGUGGAGGCUGCCCGGCGAGCCCAGGAGCUGGAGAUGGAGAUGCUCUCCAGCACCAGCCCACCCGAGAGGACCCGGUACAGCCCCAUCCCACCCAGCCACCACCAGCUGACUCUCCCCGACCCGUCCCACCAUGGUCUCCACAGCACUCCCGACAGCCCCGCCAAACCAGAGAAGAAUGGGCAUGCCAAAGACCACCCCAAGAUUGCCAAGAUCUUUGAGAUCCAGACCAUGCCCAAUGGCAAAACCCGGACCUCCCUCAAGACCAUGAGCCGUAGGAAGCUCUCCCAGCAGAAGGAGAAGAAAGCCACUCAGAUGCUCGCCAUUGUUCUCGGCGUGUUCAUCAUCUGCUGGCUGCCCUUCUUCAUCACACACAUCCUGAACAUACACUGUGACUGCAACAUCCCGCCUGUCCUGUACAGCGCCUUCACGUGGCUGGGCUAUGUCAACAGCGCCGUGAACCCCAUCAUCUACACCACCUUCAACAUUGAGUUCCGCAAGGCCUUCCUGAAGAUCCUCCACUGCUGACUCUGCUGCCUGCCCGCACAGCAGCCUGCUUCCCACCUCCCUGCCCAGGCCGGCCAGCCUCACCCUUGCGAACCGUGAGCAGGAAGGCCUGGGUGGAUCGGCCUCCUCUUCACCCCGGCAGGCCCUGCAGUGUUCGCUUGGCUCCAUGCUCCUCACUGCCCGCACACCCUCACUCUGCCAGGGCAGUGCUAGUGAGCUGGGCAUGGUACCAGCCCUGGGGCUGGGCCCCCCAGCUCAGGGGCAGCUCAUAGAGUCCCCCCUCCCACCUCCAGUCCCCCUAUCCUUGGCACCAAAGAUGCAGCCGCCUUCCUUGACCUUCCUCUGGGGCUCUAGGGUUGCUGGAGCCUGAGUCAGGGCCCAGAGGCUGAGUUUUCUCUUUGUGGGGCUUGGCGUGGAGCAGGCGGUGGGGAGAGAUGGACAGUUCACACCCUGCAAGGCCCACAGGAGGCAAGCAAGCUCUCUUGCCGAGGAGCCAGGCAACUUCAGUCCUGGGAGACCCAUGUAAAUACCAGACUGCAGGUUGGACCCCAGAGAUUCCCAAGCCAAAAACCUUAGCUCCCUCCCGCACCCCGAUGUGGACCUCUACUUUCCAGGCUAGUCCGGACCCACCUCACCCCGUUACAGCUCCCCAAGUGGUUUCCACAUGCUCUGAGAAGAGGAGCCCUCAUCUUGAAGGGCCCAGGAGGGUCUAUGGGGAGAGGAACUCCUUGGCCUAGCCCACCCUGCUGCCUUCUGACGGCCCUGCAAUGUAUCCCUUCUCACAGCACAUGCUGGCCAGCCUGGGGCCUGGCAGGGAGGUCAGGCCCUGGAACUCUAUCUGGGCCUGGGCUAGGGGACAUCAGAGGUUCUUUGAGGGACUGCCUCUGCCACACUCUGACGCAAAACCACUUUCCUUUUCUAUUCCUUCUGGCCUUUCCUCUCUCCUGUUUCCCUUCCCUUCCACUGCCUCUGCCUUAGAGGAGCCCACGGCUAAGAGGCUGCUGAAAACCAUCUGGCCUGGCCUGGCCCUGCCCUGAGGAAGGAGGGGAAGCUGCAGCUUGGGAGAGCCCCUGGGGCCUAGACUCUGUAACAUCACUAUCCAUGCACCAAACUAAUAAAACUUUGACGAGUCACCUUCCAGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1105.58 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1154.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 920.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((..(((.....((((((((...(.((((.(((((((.((((((((((((((((((..(((.((((.....((.((((((((((((.((((((((......))))...((.((..((.(((.((((((.((((((....).))).)))))))).)))))..)).)))))).)))))))))))).))..))).).))).)))).)))).))))....))))))..).))))))))))).))))))))((((((((((((((.((.(((.....(((((((((.(((..((((((.(((((((((....))).......)))))).....((((((.((((.(.....).)))).))))))....(.(((.(((((....)).))).))).)))))))..))).))))))........(((((...((......))....)))))..............)))......)))...)).)))).)))))).))))))))))))))..((((((.((.((((((((.....(((((.((((((((((.(((((((...........(((...)))((((((..(((((.(((......)))))))).((((((.(((..((((((........((((..((((((.((.(((.......((((((((((..(((((......)))))..((((.((((((((((((.(((((..............(((((((.((......))..)))))))(((((((((...((..((........))..))))))))))).....))))).).)).))))))))).)))).....))))))))))......))))).))))))..))))......)))))).....)))))))))..)))).))......(((.....)))....))))))).....(((.(((........(((((((((((..........((((.((...(((.............)))...))))))..((.((..(((.............))).)).)).(((((((((((.....))))))))))).....)))))))..)))).......))))))...(((((((....((((((..........))))))))))))).(((.((.(((((((.((((((.(((((..(((.(((....((.(((((...((((((...))))))...)))))))....(((((.....(((...)))..........((((........)))).)))))...((((...........)))).........)))))).))))))))).......((((((((.(((((.((((...........((((((.....)))))).(((.(((......((((....))))......))).))).((((......))))..((.((...((((((........)))).))....)))).(((((((.((((.........)))).).....)))))).))))))))))))))).))...((((...((......)).)))).........))))))))))))))..)))))))))).)))))...)))))))))).)))))).((((((.(((((.....................(((((..((((((.(((....)))..)))....))).))))).(((((.((......)))))))...(((((((((..((((((((.((((...((((((((((..((((((.....(((((...(((.(((((((..((...))..))))))).)))....)))))...))))))..))..(((((((((((((((...((((.((((.........))))..)))))))))))..)))))))).((((((((((((((((((...))))))..(((((..((((...))))..))))).....(((((((..(((((.....(((..((....))..)))(((..((..((......)).)))))..)))))..)))))))((((...)))).))))).))))).)).........)))))))))))).))).))))).))))))))).)))))...))))))..((((..((((((.((((.(((..(((((....))))).((((((((((((((((((((((.(((................)))))))).))))))...........(((((.((((...........((((((.(((..((((((((((((...((((((....((((.((.(((............)))..))))))....))))))..)))))))(((.(((((((.(((.....(((..((.(((((((((.(((((...((((..((((....))))..))))....))))).))).........)))))).)))))..)))))))))).)))....(((....))).)))))..))).))))))..(((((((.(((......)))))))))))))).)))))..((((((.......((((.....)))).......))))))............................))))))...)))))(((((((((((((((((.((((....((((((...))))))((((...))))...((((((((((......)).)))..)))))(((...)))....)))))))))))))))........))))))))))))))))))).(((((.((.....................................)))))))......)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((...))))).,(((.(((.((((((((({{((..(((((((.{{{,,({((,{(((((.({({((({{({((,({{((((((({((({{({({{(((((((((({,.((((.((..((.(((.((((({,((((({....,.))).)))))))).)))))..)).))))))))))))))))))).))..))).},))}}),)).}.)}))}))|,..))}.)),,))}))})))))))..)))))))).))))))),|}|(((((((,,{(((((.,,,((({((,..,,,,,,...,|}}|}|....,})}}}}.|,|||{(({,.,,((((((.((((.(,....).)))).)))))).,{{,|{{,.|||..{{{,|,,|}}.||{|,|||||}..,||{||,|||{{......|||||.,.{((({{((({(,,,...||,.............,{{{{..,{||,{{{{,,||},.,,{{{|,,..,,,,.,}))},..|{||{|}||.|||||||{,,|,.(((((.((((((((((.(((((((..........,{{{...,}}{(((((..(((({{(((......)))))))).((((((.(((..,({{{{{{{,....((((..((((((.({,(((.......((((((((((..(((((......)))))..((((.((((((((((({.(((((.............{(((((((.((......))..)))))))|((((((((...{{..,,{{.{,,...,..)})))))))),.....))))).}.)),})))))))).)))).....})))))))))...,..))))).))))))..)))).....})))||,.,,..)))))))))..}|||,|},,,,..(((.....)))....)))))})..,,.,,..,{({.......,{{{(((((((...,,.....((((.(({{,,,,...}}},,.....|||...},}}}}.,{(.{{..{{|.,...........}}),)).)}.(((((((((((.....))))))))))).....)))))))..}}}}.,,....,))))),},((((({{....{{|||{,,.,,..}..)}}}))))))})).{{(.(,,(((((((.({((((.(((((..(((.(((....((.(((((.,.((((((...)))))).,.)))))))....{{{{(|,...(({...)))...,,.....((((........)))).}))))...((((.({......,,))))......,..)))))).))))))))).......|,((((((.(((((.((((.,,........((((((.....)))))).|((.({{.{,.,,((((,,,,|||}......||}.}}}.{{{,......}|||,.{,.{{..,{(((((........))))|,,...|||,..|,{{{||,||||,,,,.....)))),).}}.,},))),.))))))))))))))).}|.,,{{,,...,{......,,.)))),..,.....,,))))))))))))..)))))))))).)))))..,))|},)))}..})})}),(((({{.,{{{{,,..................,||||,|,|{{,{|}||||}}},,}}.}}},,,{|||,|,,,}.((((,,{{......))))))}.,.{{{{{{{{{..(((((((({((({.{{,(((((((,,..{{{{{{.,|},||{||..,|||,||||||{..((,..|}..}}}}}}}.))},,,})}}))}},)}}})),,||,|{{{{{({|{{((((({{{(((,.,,,,.....}),.,)))}}))),,,}||||{{|||,,,||,.((((((,,,,|||||||}}.)))))))){((((..((((...))))..))))}.,,..||{{{{{,.{{{{,.,.,,||{..{{,,{{|},{|||{{({,((((((,......,,.(((((((((.....))))))))},})}))))),,,}).)))}|,|,...,}}...))))))))})))}))).))}))})))))|||}|||}}},..}}}}}}.,(((({.,{{{{,.{{((,(((.{({{.|,...}}})},||||{||}||||((((((((({{(((....,....,,.....)))))))).)))))|{.{{{{{{.{.{{{{{,{{{.......,,,,|}}||{||{,|,......(((((((...((((((....((((.({.(((............)))..}}))))....))))))..))))))){{(,({{{{|||((,{{{{{({...||.|||||{|,|}||||,,,,,((({,((((,..,||||{{||}}|,{.,||||{|||||||..|..||||,}{|}}||{.}},}}}}}}}.}}}},,))),})))..)},)))))},})))))),}}}(((((((.(((......))))))))))||||{||||{,.(((((({,.....((((.....))))....,,.)))))).}......................}}),})))))),}))))))}})},((((((((({{{((((....((((({...})))))|({(,,.||{{..,{(({{{.,{.....}.}),)))}}))})}|||,..)}}..,.))))))))))))))).,.,)}}}))))).}}}.})))))))..(((((,({..............,}...,,,...........,}}},,)))))..)))))))..
Back