Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001001935.3
Sequence Length
5834 nt
GC Content
0.4535
CAUUUUGUCCCAGUCAGUCCGGAGGCUGCGGCUGCAGAAGUACCGCCUGCGGAGUAACUGCAAAGAUGCUGUCCGUGCGCGUUGCUGCGGCCGUGGUCCGCGCCCUUCCUCGGCGGGCCGGACUGGUCUCCAGAAAUGCUUUGGGUUCAUCUUUCAUUGCUGCAAGGAACUUCCAUGCCUCUAACACUCAUCUUCAAAAGACUGGUAAGUUAUUAUUUCUCAGUCUACGCCGCACUUACUAGAUGAAGAUAUAAAUUACAUACAUCGUAUAACUGUGGGACUGCUGAGAUGUCCUCUAUUCUUGAAGAGCGUAUUCUUGGAGCUGAUACCUCUGUUGAUCUUGAAGAAACUGGGCGUGUCUUAAGUAUUGGUGAUGGUAUUGCCCGCGUACAUGGGCUGAGGAAUGUUCAAGCAGAAGAAAUGGUAGAGUUUUCUUCAGGCUUAAAGGGUAUGUCCUUGAACUUGGAACCUGACAAUGUUGGUGUUGUCGUGUUUGGAAAUGAUAAACUAAUUAAGGAAGGAGAUAUAGUGAAGAGGACAGGAGCCAUUGUGGACGUUCCAGUUGGUGAGGAGCUGUUGGGUCGUGUAGUUGAUGCCCUUGGUAAUGCUAUUGAUGGAAAGGGUCCAAUUGGUUCCAAGACGCGUAGGCGAGUUGGUCUGAAAGCCCCCGGUAUCAUUCCUCGAAUUUCAGUGCGGGAACCAAUGCAGACUGGCAUUAAGGCUGUGGAUAGCUUGGUGCCAAUUGGUCGUGGUCAGCGUGAACUGAUUAUUGGUGACCGACAGACUGGGAAAACCUCAAUUGCUAUUGACACAAUCAUUAACCAGAAACGUUUCAAUGAUGGAUCUGAUGAAAAGAAGAAGCUGUACUGUAUUUAUGUUGCUAUUGGUCAAAAGAGAUCCACUGUUGCCCAGUUGGUGAAGAGACUUACAGAUGCAGAUGCCAUGAAGUACACCAUUGUGGUGUCGGCUACGGCCUCGGAUGCUGCCCCACUUCAGUACCUGGCUCCUUACUCUGGCUGUUCCAUGGGAGAGUAUUUUAGAGACAAUGGCAAACAUGCUUUGAUCAUCUAUGACGACUUAUCCAAACAGGCUGUUGCUUACCGUCAGAUGUCUCUGUUGCUCCGCCGACCCCCUGGUCGUGAGGCCUAUCCUGGUGAUGUGUUCUACCUACACUCCCGGUUGCUGGAGAGAGCAGCCAAAAUGAACGAUGCUUUUGGUGGUGGCUCCUUGACUGCUUUGCCAGUCAUAGAAACACAGGCUGGUGAUGUGUCUGCUUACAUUCCAACAAAUGUCAUUUCCAUCACUGACGGACAGAUCUUCUUGGAAACAGAAUUGUUCUACAAAGGUAUCCGCCCUGCAAUUAACGUUGGUCUGUCUGUAUCUCGUGUCGGAUCCGCUGCCCAAACCAGGGCUAUGAAGCAGGUAGCAGGUACCAUGAAGCUGGAAUUGGCUCAGUAUCGUGAGGUUGCUGCUUUUGCCCAGUUCGGUUCUGACCUCGAUGCUGCCACUCAACAACUUUUGAGUCGUGGCGUGCGUCUAACUGAGUUGCUGAAGCAAGGACAGUAUUCUCCCAUGGCUAUUGAAGAACAAGUGGCUGUUAUCUAUGCGGGUGUAAGGGGAUAUCUUGAUAAACUGGAGCCCAGCAAGAUUACAAAGUUUGAGAAUGCUUUCUUGUCUCAUGUCGUCAGCCAGCACCAAGCCUUGUUGGGCACUAUCAGGGCUGAUGGAAAGAUCUCAGAACAAUCAGAUGCAAAGCUGAAAGAGAUUGUAACAAAUUUCUUGGCUGGAUUUGAAGCUUAAACUCCUGUGGAUUCACAUCAAAUACCAGUUCAGUUUUGUCAUUGUUCUAGUAAAUUAGUUCCAUUUGUAAAAGGGUUACUCUCAUACUCCUUAUGUACAGAAAUCACAUGAAAAAUAAAGGUUCCAUAAUGCAUAGUUGUUUUCUGUCAUUUGUGUUAUUCUUUAAAACCAAGAUCAAAUUGAGAAAUUGGUAAGCAAAUGCUUCUUGAUCUAUUUUACUUGAAUAUUGGUACAGUCAACUGGGCUAGAUAAUUCAAGGCUGAGCUCUUUGUAAGUUUUUUUUUUGUUUUUUUUUUUGAGACUGAUUCUCACUCUGUCACUGAGGCUGGAGUGCAGUGGCACCCUGUCGGCCCACUGCAACCUCCGUCUCCGGGUUCAAGCAAUUCUCUUGCCUCAGCCUCCCACGUAGCUGGGAUUACAGGUGCCCACCACCACGCCUGGCUAGUUUUUUAGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCCGGUCACGAACUCCUGACCUCAGGUGAUCCACCUGCCUUGGCCUACCUACCACAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACCGCACCCGGCUGCUCUUUGUAAGUUUCUAGAGUACUUUGUGUUUAAGAGAAAUUCCUAAACUGGAUAUAUGUGGCAGGCUGACAAUACUGAAGAGCAUAGCUGGCUUCUCUGCCCAGAGGAUGUACCUGCAUAAAGAGGUACUGUAGGCAGGAAAAUAAUAGGACAGUUAAAAUUCUCAGGGAAAUGAAAAAAUUGCUGGAACAAAAGCUGAGAAGAUAGAAUGCAUAGGAUUAUGAAAACUUGUCAAUAUCUCUUUUGUUUGUUUUGUGACAGGGUCUCCAUCUCUCUCACCCAGGCUGGAGUACAGUGGUGUGAUCUCAGCUCACUGCAGCUUCUGCCACCUGGGUUCAAUUGAUUCUUCCACCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGGUUACAGGCACAUACCACCACGCCCAGCCAAUUUUUCUACUUUUUGUAGAGGGAGGGUCUUGCCAUGUUGUCCAGGCUGAUGAUGAACUCCUUGGCUCAAGUGAUCCUCCUGCCUUGGUCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAACUACCAUGCCCGGCCAUCUUUUAAUAUUUUCACAGCUACUUUAUUUCCUCUGUUACUAGCUUUUCAUAGCCUUUGCUCAUUCUUACUGCAUUAAAUUUUUUUUACUGAUUUAUUUAUUUUUUUGAGACAGAGUCUUGCUCUGUCACCUAGGCUGGAGAGCAGUGGCGUAAUCUCAGCUCACUGCACCUUUCACCUCCUGGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUUAGCCUCCCAAUUAGCUGGGACCACAGGCCCAUGCCACCACACCCGGCUAACAUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAAGGUUUCACCAUGUUGGCCAUGCUGCUCUUGAGCUCCUGACCUCGUGGUCUGCCCGCCUCAGCUUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACCACGCCCAGCCUACUGAUUUAUUUAUUUACUUUUAAUUUUUCAUAGCCUUUGCUCAUUCUUAAUGUGUUACCUUUUUUUUUACUUAGUUAUUUAUUUAUUUGAGAUGGAGUCUCCGUCGUCCAGGCUGGAGUGCAGUGACCUGAUCUUGGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCAGGUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGAAGCUGGAACUACAGGCACCCACCACCAUGCCCUGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGGCGGGGUUUCACCAUAUUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUUGUGAUCUGCCUGCCUUGGCCUCCCACAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACCACACCUGGCCUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUCUCACUGUCUCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCGAUGUCGGCUCACUGCAAGCUCUGCCCCCUGGGUUUGCGCCGUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAUUAGCUGGUACUACAGGCGCCUGCCAUCACGCCCAGCUAAUUUUUUUUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUCGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCCUGACCUCAUGAUCCACUUACCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCUUGAGCCACCGCGCCCGGCCUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUACUGAUAUAUAAAGGCUUUUGUCUGUAAGGGUCAUACAUGGUCAUGUUCUAAAAUAUUUUUCCUAGGGUUCCCCCUUCCUUGCCAUUUUAUUUUGUUGAUGGGGAUUUGCUGUACCGAAACUUCAUUCUUAUCCAUCUCUCUGUCUCCAGUAAGUCAAAAUAUAUUUACAUAUGUGGGCUCCAAUAUCUUUGGUAGGAAAAGGAGAGUUCUUAAAGUACUCAUAAGUCCUUUUCAGUACUUAGAGGAACACUAAACUUGAUAGCAGUUGGUCAUUUCUGAUCAACUCUUGCUUUCUAGCUACUUGAGAAAUAACUUCUAGAUCUGAUUUUCCUUUUCUGAAAUAAGGAAGUUACUUUUAGUUAGAAGGUUCUGCACAUUUCGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGUUUUUUUUUUUUGAGAGUUUUGCUCUUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGCACGAUCUCGGCUCACCACAACCACCGCCUCCUGGGGUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGGCUCCUGAGUAGCUGGGAUUACAGGCAUGCACCACCACGCCUGGCUAAUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCUCCAUGUUGGUCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGACCUUAGGUGGUCCACCGGCCUCCCAAAGUACUGGGAUUACAGGGGUGAGCCACUGCGCCCGGCUUGUUGGAGCAUUUUAUACCUAGUGUCAGUGGUGAUUACUACUUUGGAGAAAAAUACUUUGGCUAAUGGAUUGGAAUUAAUUUAUUACUGGGAGUAUGUAUUGUUUGUUUGUUGACUGGAUCUCGUAGCCCACUCCUGGCACGUAAAUGCUCAAUAAACUUCUCAAAUGAAGACAACCAUGUUUGUCCAUUAUAAAUCAAAUUCCAAAUGUUAACUACUGGUCUGGUCUGAUGAGAUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUUUUGUUUUUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGCGCGAU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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1910.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2016.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 1859.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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