Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001011705.2

Sequence Length

1452 nt

GC Content

0.4738

AGGCGGGACCGUGCACCGUGUGUGCGCGCGGCGUUGAAAUGCCCUGCACGUCGGGGCAGCGGGACAGAUCCCAGGGUGCCCAGGGAGUCUCCAAGUGCCUCACUCCUCCCGCCGCAAACAUGACAGAGAACUCCGACAAAGUUCCCAUUGCCCUGGUGGGACCUGAUGACGUGGAAUUCUGCAGCCCCCCGGCGUACGCUACGCUGACGGUGAAGCCCUCCAGCCCCGCGCGGCUGCUCAAGGUGGGAGCCGUGGUCCUCAUUUCGGGAGCUGUGCUGCUGCUCUUUGGGGCCAUCGGGGCCUUCUACUUCUGGAAGGGGAGCGACAGUCACAUUUACAAUGUCCAUUACACCAUGAGUAUCAAUGGGAAAUUACAAGAUGGGUCAAUGGAAAUAGACGCUGGGAACAACUUGGAGACCUUUAAAAUGGGAAGUGGAGCUGAAGAAGCAAUUGCAGUUAAUGAUUUCCAGAAUGGCAUCACAGGAAUUCGUUUUGCUGGAGGAGAGAAGUGCUACAUUAAAGCGCAAGUGAAGGCUCGUAUUCCUGAGGUGGGCGCCGUGACCAAACAGAGCAUCUCCUCCAAACUGGAAGGCAAGAUCAUGCCAGUCAAAUAUGAAGAAAAUUCUCUUAUCUGGGUGGCUGUAGAUCAGCCUGUGAAGGACAACAGCUUCUUGAGUUCUAAGGUGUUAGAACUCUGCGGUGACCUUCCUAUUUUCUGGCUUAAACCAACCUAUCCAAAAGAAAUCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGUGGUAAGAAAAAUUGUUCCAACUACCACAAAAAGACCACACAGUGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCUGGAAGACUGAAUAAUGAAACCAGACCCAGUGUUCAAGAGGACUCACAAGCCUUCAAUCCUGAUAAUCCUUAUCAUCAGGAAGGGGAAAGCAUGACAUUCGACCCUAGACUGGAUCACGAAGGAAUCUGUUGUAUAGAAUGUAGGCGGAGCUACACCCACUGCCAGAAGAUCUGUGAACCCCUGGGGGGCUAUUACCCAUGGCCUUAUAAUUAUCAAGGCUGCCGUUCGGCCUGCAGAGUCAUCAUGCCAUGUAGCUGGUGGGUGGCCCGUAUCUUGGGCAUGGUGUGAAAUCACUUCAUAUAUCAUGUGCUGUAAAAUAAGAACUAGCUGAAGAGACAACCAAAGAAGCAUUAAGGCAGGUUGAUGCUGAUAGGACCACAAAAUAUUUUUACACUCAACCUGAGCGGUUAUUCUUGACACUCUUAACAGAAUUUUUUCAAUUGUUUUCCAGAACUUUAGUAUAUGCAAAUGUACUGAAAGGGUAGUUCAAGUCUAAAAUGCCAUAACCCCUUUAUUAUUUGUUAUUUUUUAUUUGCAUUGCUUUGCCAUAAGUCUUCCCUUGCUUGUAUCUUCCAAAGCUAUUUUGAAAUAAACAUGAAAAUUUACAGUUUGCCAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-446.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -474.07

Frequency: 0.0000

Diversity: 338.83

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((.(((((((.....))))))).(((((....)))))......((.((((((...(((....((((.((....)).))))...)))...))))))))...)))))))((((((.((.........((((.((.((.(((((((.....))))))).))..))...))))(((((((((.....(((((((...)))))))..((((((((((((((((((((...((((.(..(((((((.(((((.(.((((......)))).))).))).)))).))).).))))..))))))......(((((((.((((((((..(.(((((((((......((((((((.((((..(((............)))...)))))).))))))..............(((((..(((..((((((((((((((((.(..(((((((((((....((((..(((((.((((....((......)))))).)))))))))(((((((((...(((((.......)))))..((.(.(((.(.((((.....)))).).))).).))...........)))))))))..((...((((..((((..((((.(((.(((.((.((....)))).))).))).))))....)))).))))....)).......)))))))(((((((((....)))))))))..))))..)))))))))))).(((......)))...............((((((((((...(((.....(((.(........(((((((.....((((..............)))).....)))))))(((.((((((((....(((...........)))..))))))))...((((.((....))))))...(((((((..........))))))).)))...).)))....)))..))))...))))))...)))))..))))))))...)))))).))))..)))...))).)).))))))).............))))))))).)))))...((((((.........))))))(((....))))))))))))((((..((((......)))).))))(((((.....)))))...(((((((.....))))))).((((((..(((......((((.((((((((((.((((.(((.((((..(((.((((((((((.(.((.(((((...........)))))))))))))))(((..((((....)))).)))......(((....)))....((((....))))((((((((((....))))))))))((((((((.(((((..((((((.((................)).))))))..))))).))))))))))).)))..))))..))).)))).)))))...)))))))))...))).)))))).......))))))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((({.(((((((,,..,}}|||}|.(((((....))))),}}},,|,,|(((((.,|(({,.,,((((.((....)).)))),))))}...})))}),}..,}||||||(({{((,((.....,..,({{{.,,.{(.(((((((.....})))))).}},,||,,.}}},,{(((((((,{...(((((((...)))))))..((((((((((((((((((((.((((((.(({,...|})}))))}}({{((,{{....|||(((.,,,,.})}})}},,}))))))..)))))}......(((((((.{(((((((..(.((((((((({(({(,(((((({{.((((..{{{,,..,,......}}}...})))}}.}))))}....,.,.,{{{,..,,.{,,{(({.((,,,{((((((((((.(..(((((((((((....((((..(((((.((((.,..,,....,.,,)))).)))))})))(((((((((...(((((.......)))))..,{...{(({(.,,,,.....}|}}.},))}.|.,,....,..,}).)))))))))..{{...((((..((((,,((((.(((.(((.({{((....)))).))).))).)))).,,.)))).)))),{..,,....,..)))))))(((((((((....)))))))))..))))..)))))))))))).,||,},...))},,,,.||,....,..((((((((((...(((.....(((.{........{((((((.....((((..............)))).....))))))}(((.{(((((((....(((...........))).,)))))))}...((((.({....))}))),..(((((((.,,....,,.))))))).})),..}.)))..,.)))..))))...))))))..,,,,)),.,}}))))),..}))))).))))..)))...))).)}.)))))))......,.....,))))))))).)))))...((((((.........)))))){{{....))})))))))))||||,,|{||},,.,,,))))))})|((({.....))))){{{(((((({.....}))))}}.{||||{.,{{(,,,...{(({.((((((((((.((((.(((.((((..(((.((((((,((((((.(((((((..{{{{{.,,......,.{{{|...}|||.{((((..{{||||{|{|{,....(((....)))....({{{....}))},(((((((((....))))))))))|||||.||,||||...,,..,|,,|,,},,.........}}))}..,.))))))).))))))})))))).)))..))))..))).)))).)))))...)))))})))....,..}}})}}....,,,}})))))),.....