Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001025195.2
Sequence Length
1946 nt
GC Content
0.5298
ACAGAGACCUCGCAGGCCCCGAGAACUGUCGCCCUUCCACGAUGUGGCUCCGUGCCUUUAUCCUGGCCACUCUCUCUGCUUCCGCGGCUUGGGCAGGGCAUCCGUCCUCGCCACCUGUGGUGGACACCGUGCAUGGCAAAGUGCUGGGGAAGUUCGUCAGCUUAGAAGGAUUUGCACAGCCUGUGGCCAUUUUCCUGGGAAUCCCUUUUGCCAAGCCGCCUCUUGGACCCCUGAGGUUUACUCCACCGCAGCCUGCAGAACCAUGGAGCUUUGUGAAGAAUGCCACCUCGUACCCUCCUAUGUGCACCCAAGAUCCCAAGGCGGGGCAGUUACUCUCAGAGCUAUUUACAAACCGAAAGGAGAACAUUCCUCUCAAGCUUUCUGAAGACUGUCUUUACCUCAAUAUUUACACUCCUGCUGACUUGACCAAGAAAAACAGGCUGCCGGUGAUGGUGUGGAUCCACGGAGGGGGGCUGAUGGUGGGUGCGGCAUCAACCUAUGAUGGGCUGGCCCUUGCUGCCCAUGAAAACGUGGUGGUGGUGACCAUUCAAUAUCGCCUGGGCAUCUGGGGAUUCUUCAGCACAGGGGAUGAACACAGCCGGGGGAACUGGGGUCACCUGGACCAGGUGGCUGCCCUGCGCUGGGUCCAGGACAACAUUGCCAGCUUUGGAGGGAACCCAGGCUCUGUGACCAUCUUUGGAGAGUCAGCGGGAGGAGAAAGUGUCUCUGUUCUUGUUUUGUCUCCAUUGGCCAAGAACCUCUUCCACCGGGCCAUUUCUGAGAGUGGCGUGGCCCUCACUUCUGUUCUGGUGAAGAAAGGUGAUGUCAAGCCCUUGGCUGAGCAAAUUGCUAUCACUGCUGGGUGCAAAACCACCACCUCUGCUGUCAUGGUUCACUGCCUGCGACAGAAGACGGAAGAGGAGCUCUUGGAGACGACAUUGAAAAUGAAAUUCUUAUCUCUGGACUUACAGGGAGACCCCAGAGAGAGUCAACCCCUUCUGGGCACUGUGAUUGAUGGGAUGCUGCUGCUGAAAACACCUGAAGAGCUUCAAGCUGAAAGGAAUUUCCACACUGUCCCCUACAUGGUCGGAAUUAACAAGCAGGAGUUUGGCUGGUUGAUUCCAAUGCAGUUGAUGAGCUAUCCACUCUCCGAAGGGCAACUGGACCAGAAGACAGCCAUGUCACUCCUGUGGAAGUCCUAUCCCCUUGUUUGCAUUGCUAAGGAACUGAUUCCAGAAGCCACUGAGAAAUACUUAGGAGGAACAGACGACACUGUCAAAAAGAAAGACCUGUUCCUGGACUUGAUAGCAGAUGUGAUGUUUGGUGUCCCAUCUGUGAUUGUGGCCCGGAACCACAGAGAUGCUGGAGCACCCACCUACAUGUAUGAGUUUCAGUACCGUCCAAGCUUCUCAUCAGACAUGAAACCCAAGACGGUGAUAGGAGACCACGGGGAUGAGCUCUUCUCCGUCUUUGGGGCCCCAUUUUUAAAAGAGGGUGCCUCAGAAGAGGAGAUCAGACUUAGCAAGAUGGUGAUGAAAUUCUGGGCCAACUUUGCUCGCAAUGGAAACCCCAAUGGGGAAGGGCUGCCCCACUGGCCAGAGUACAACCAGAAGGAAGGGUAUCUGCAGAUUGGUGCCAACACCCAGGCGGCCCAGAAGCUGAAGGACAAAGAAGUAGCUUUCUGGACCAACCUCUUUGCCAAGAAGGCAGUGGAGAAGCCACCCCAGACAGAACACAUAGAGCUGUGAAUGAAGAUCCAGCCGGCCUUGGGAGCCUGGAGGAGCAAAGACUGGGGUCUUUUGCGAAAGGGAUUGCAGGUUCAGAAGGCAUCUUACCAUGGCUGGGGAAUUGUCUGGUGGUGGGGGGCAGGGGACAGAGGCCAUGAAGGAGCAAGUUUUGUAUUUGUGACCUCAGCUUUGGGAAUAAAGGAUCUUUUGAAGGCCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-689.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -727.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 631.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((...(((((((.....((((((...(((((((...((((.(((.....)))..)))).(((((.((.(((((((((((((((((((((((.((..((((.((.((.....)).))))))..)).)))(((((..((.((((.(.((((((.((......)).)))))).).))))))...)))))......(((...))).....)))))))))....((((((.....))))))(.(((((((((.((.(((..((((((.(((((.((((...(((..(((((((((((.((.(((.(..(((.(.((((((((((((((((((..((..((((((...........((.((((......)))).)).))))))..)).))))))))).......((((((.(.(((((((((((((..((((((...(((((((((.(((((((.((((((((((((.((((.((((((((.((....)).))))......(.((((((.(((....))))))))).)..((.((((...(((((((......((((.((((.((...(((((...))))))).)))).)))).......((((.....)))))))))))...)))).)))))).)))).)).)))))))...))).))))))).))..(((.(....))))))).)))).....)).)))).)))))))))))))..).)))))).(((((...((((((((((....((((..((((((.(((((..(((.....(((((..(((((.(((((((((((((.(.(((....))).).))))).(((..((((...))))..)))...(.(((((((((((((((............(((((.(((((..(((.....)))...))))).))).))..((((((((..((((....((........((((((((.(((((((((((((.(.(((....)))...).)))))......((((((((((.((.((.(((((((((((..((..((((...(((....((((...))))...)))..))))..))(((((.......((((((((((((((.(((.........))).)))))))))....((((((..(((.......))).((....)))))))))))))...)))))..(((((((..((((..((((((.....((((((.......)).))))..(((....)))......(((((.....))))).((((((((........(((.........)))))))))))))))))....))))..)))))))..))))))))))).)).)).)).))))))))...)))))))).(((.....)))...........))))))))))....)))))))))))).(((....))).)))).)).))))))))).)..(((..(.((((((((..(((((.(((((((((((((.(((....))).))).))))))).))))))))..)).))))(((((.((((...((...))...)))).).)))))).)..)))...((((...)))).)))))))).)))))...))))).....)).)..)))))))).)))((.....((((....))))...))((.((((((((((.............)))).)))))).))...(((((((((.....))))).))))..))))....)))))))))).)))))((((.((.......))))))..))))))))).).)))..).))).))...))))).....))))..))....)))..)))).)))))......))))))))).))..))))..))))).))))))))))))..)).))))).))))).)).))))))...))))))).))).(((((.((((.........)))).)))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{{{...{{{,{(({,.,{(({{{{,,,(({{{((...{{{{.(((.....}||..||||.(((((.((.(((((((((((((((((((({(((((,.{{{({{{,,{{{,...,}))})))}..,,,||{((((..((.((((.(.((((((.{(......)}.)))))).).))))))...))))}......{||,..))),.,,}))))))))),,{.{((,{{.,.},))},,,{.(((((((({,((.(((..(((((({(((((.((((...(((..(((((((((((.((.(((,(.,(((.{.((((((((({((((((((..({,,((((((...........((.((((,....,)))).)).))))}),,)).)))))))},........,{{{{.{.(((((((((((((..((((((...(((((((({,(((({((.{,((((((((((.((((.((((((((.((....)).)))),.....{.((((((.(((....))))))))).}..((.((((...(((((((..,,..,{((.((((.{,..{(((((...))))))}.)))).)))).......((((.....)))))))))))...)))).))}))).)))).)).))))))))...)}.)))))}),)).,(((.(....))))))}.)))).....))))})).))))))))))))),,|,,,|||}|||{(({{,((((((((((,,,.((((..{({,{({(((((.,{({({{{{(({,,.,|||||}{|||{{{((((((.(.(((.,,,}}}.}.}}||},,({..((((...}}}}.{|}|..,{{((((({{((((((((,......,,,}.{{(((.(((((..(((.....)))...))))).})}.)},,((((((({,.{{{{||||,,{{,.....,|...,||,,,(((((((,{({.{.{{|,...})),},},})))}....,,{(((((((((.((.((.((((((((((({,{{{{{,{,...(((....{(({.,.}))}...|||..|||||,|,{((((..,....{(((((((((((((.{((,,.....,.})).)))))))))....((((((..{{{.......}}}.{{...})))))))))))))}..}}))),,|||||{{,,{{|{|||||(((|.||.{{{{{,..,{...||,}}||..{{{.,,,)||.,,|,.(((((.....))))).((((((((......,,,{{....,,...},,))))))))}}|}}}..,.))}},,}}}}}},..))))))))))).)).)).))||))))))}..,))}}}}||{{(({{{...,{,......},..|.}}})))}}|,||||},,}}}}}}|,{{|....})}.}}}}..).}))))))}},),,|||,}}}|.,|||||||(((((,{|(((((((((((.(((....})),))).)))))))}}))))})}..}}.)})}|||,|,||||,,,|,..,})},})))}.},}}}}}|.,..|}}...{{({...)))).})))))})}))}}),},))))).....})}),,))}))))}.}}}{{,,...((((,,..}}}}..}))((.((((((((((.............))))}}))))).))...(((({((((.....))))).))))..}}}}....)))))))))),},}}}||||,||.,.....}}}}})}.))))))))).|.))).,}.))).}}...)))))....,))),..)),...)))..)))).)))))......))))))))),))..}))},,))))),)))))))))))),.)).))))},|}}||.||{|||,,,..,))))),,}))),,{{{{}||||,,,,}}.,,})}},},)))}...
Back