Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001033886.2
Sequence Length
524 nt
GC Content
0.5573
GCCGCACUUUCACUCUCCGUCAGCCGCAUUGCCCGCUCGGCGUCCGGCCCCCGACCCGCGCUCGUCCGCCCGCCCGCCCGCCCGCCCGCGCCAUGAACGCCAAGGUCGUGGUCGUGCUGGUCCUCGUGCUGACCGCGCUCUGCCUCAGCGACGGGAAGCCCGUCAGCCUGAGCUACAGAUGCCCAUGCCGAUUCUUCGAAAGCCAUGUUGCCAGAGCCAACGUCAAGCAUCUCAAAAUUCUCAACACUCCAAACUGUGCCCUUCAGAUUGUAGCCCGGCUGAAGAACAACAACAGACAAGUGUGCAUUGACCCGAAGCUAAAGUGGAUUCAGGAGUACCUGGAGAAAGCUUUAAACAAGGGGCGCAGAGAAGAAAAAGUGGGGAAAAAAGAAAAGAUAGGAAAAAAGAAGCGACAGAAGAAGAGAAAGGCUGCCCAGAAAAGGAAAAACUAGUUAUCUGCCACCUCGAGAUGGACCACAGUUCACUUGCUCUCGGCGCUUUGUAAAUUUGCUCGAUCCUCCUCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-146.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -155.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 120.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((.((((((..(((((.((..(((.(.(((.....(((((((..(((.........((((..(((.((.((...(((.((.((.(((((((.((.....)).)).))))).)).)).)))...)).)).))).))))((((.((((((((((((...)))))).).)))))...)))).))).)))))))..(((((........(((((....).))))(((((((((((............(((........)))..((((((.(((.....)))))))))..............)).)))).))))).))))).((((((...((((((....))))))....))))))..)))).))))).))).))..)))))).))..............((((.....((.((((............(((((.(((.(((.((((((.......((((((.........)))))).......))).)))..))).))))))))......)))))).....))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((.((((((..(((((.((..(((,{.,{(,,.{,{{((|{{.|((|...||,,..((({..(((.((.((...(((.((.((.(((((((.((.....}}.)).))))).)).)).)))...)).)).))).))))((((.((((((((((((...)))))).),}))))...)))).||..,,||(({....)))...|{.{{(((({....)},)))||,,,||,,.............{((({.....,{((|..((((((.(((.....)))))))))..,....,}},...}))))}}.}}))}||,,.},((((((...((((((....))))))....))))))..,,,)}))))).)))},)..)))))).))..............((((.....(,,((((............(((((.(((.(((.(((({{...,,.{((((((.........)))))),}...,,))}.)))..))).)))))))).....,)))))).....))))..
Back