Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001080414.4
Sequence Length
7519 nt
GC Content
0.5884
GCCUUUGUCUCCCGGGCGCGAGCCGCCGCAGCCCCGCGCCCGCUGCUCGCUGCGGAGCCGUUUUGUGCCGCGGCGCGGGGGAACGGGGACGCGGGGCGGGGGGCGCGGAGCCGGCGGGCGCAGCCUCAGCAUGGACGUGACAGUCUCGGAGCUCCUGGAGCUCUUCCUGCAGAGCCCGCUGGUGACCUGGGUGAAAACUUUUGGCCCGUUUGGAAGCGGCAGCCAGGACAACCUGACUAUGUACAUGGAUUUAGUGGACGGCAUCUUUUUGAACCAAAUUAUGCUGCAAAUAGAUCCCAGGCCCACAAAUCAACGCAUCAAUAAGCACGUCAACAAUGAUGUGAACCUUCGCAUUCAGAAUUUGACCAUCUUGGUGAGAAACAUUAAGACCUACUACCAGGAAGUUCUCCAGCAGCUGAUUGUAAUGAAUUUGCCCAAUGUUUUGAUGAUUGGCAGAGACCCACUGUCUGGGAAGAGCAUGGAGGAAAUCAAGAAGGUGCUGCUGCUGGUGCUGGGCUGUGCUGUCCAGUGUGAGAGGAAAGAGGAGUUCAUUGAAAGAAUCAAACAGCUGGACAUUGAGACCCAGGCUGGCAUCGUGGCCCAUAUCCAGGAGGUGACUCACAACCAAGAGAACGUGUUUGACCUGCAGUGGCUGGAGCUGCCCGACGUGGCUCCGGAGGAGCUGGAGGCCCUGUCGAGGAGCAUGGUGCUCCACCUGCGGAGGCUCAUCGACCAGCGGGACGAGUGCACCGAGCUGAUCGUGGACCUCACUCAGGAACGGGACUACCUGCAGGCACAGCAUCCACCCAGCCCCAUCAAGUCCUCCAGCGCCGACUCCACUCCCAGCCCCACCAGCAGCCUCUCUAGCGAAGACAAGCAGCACCUGGCCGUAGAGCUGGCCGACACCAAGGCCAGGCUGCGGCGCGUCAGGCAGGAGCUGGAGGAUAAGACAGAGCAGCUUGUGGACACCAGACAUGAGGUGGACCAGCUGGUGCUGGAACUGCAGAAAGUUAAGCAGGAGAACAUCCAGCUAGCGGCAGACGCCCGGUCUGCUCGUGCCUAUCGAGACGAGCUGGAUUCCCUGCGGGAGAAGGCGAACCGCGUGGAGAGGCUGGAGCUGGAGCUGACCCGCUGCAAGGAGAAGCUGCACGACGUGGACUUCUACAAGGCCCGCAUGGAGGAGCUGAGAGAAGAUAAUAUCAUUUUAAUUGAAACCAAGGCCAUGCUGGAGGAACAGCUGACUGCUGCUCGGGCCCGGGGCGAUAAAGUCCAUGAGCUGGAAAAGGAGAACCUGCAGCUGAAAUCCAAGCUUCACGACCUGGAAUUGGACCGGGACACAGAUAAGAAACGAAUUGAGGAGCUGCUGGAAGAAAACAUGGUCCUUGAGAUUGCACAGAAGCAGAGCAUGAACGAAUCUGCCCACCUUGGCUGGGAGCUGGAGCAGCUGUCCAAGAACGCAGACUUGUCAGACGCCUCCAGGAAGUCGUUUGUGUUUGAGCUGAACGAAUGUGCGUCCAGCCGCAUCCUGAAGCUGGAGAAGGAGAAUCAGAGCCUCCAGAGCACCAUCCAGGGGCUGCGGGACGCGUCCCUGGUGUUGGAGGAGAGCGGCCUCAAGUGCGGGGAGCUGGAGAAGGAGAACCACCAGCUCAGCAAGAAGAUUGAAAAGUUACAAACCCAGCUGGAGAGAGAAAAGCAGAGCAACCAAGAUCUGGAGACCCUCAGUGAGGAGCUGAUCAGAGAGAAGGAGCAGCUGCAGAGUGACAUGGAGACCCUGAAGGCUGACAAAGCCAGGCAGAUCAAGGACCUUGAGCAGGAAAAGGACCACCUCAACCGAGCCAUGUGGUCGCUGCGGGAGAGGUCGCAGGUCAGCAGUGAGGCCCGCAUGAAAGACGUGGAGAAGGAGAACAAAGCCCUCCACCAGACGGUGACGGAGGCCAAUGGCAAGCUCAGCCAGUUGGAGUUUGAGAAGCGGCAGCUGCACAGGGACUUGGAGCAGGCCAAGGAGAAGGGGGAGCGGGCAGAGAAGCUGGAGAGGGAGCUACAGCGACUCCAGGAGGAGAACGGGAGGCUGGCCAGGAAGGUGACCUCCCUGGAGACAGCCACCGAGAAAGUCGAGGCCCUGGAGCAUGAGAGCCAGGGCCUGCAGCUGGAGAACCGGACUCUGAGGAAGUCUCUGGACACCUUGCAGAACGUGUCCCUGCAGCUUGAGGGCCUGGAGCGUGACAACAAGCAGCUGGACGCAGAGAACCUGGAGCUGCGCAGGCUGGUGGAGACCAUGCGCUUCACCAGCACCAAGCUGGCACAGAUGGAGAGGGAGAACCAGCAGCUGGAGCGUGAGAAGGAGGAGCUGAGGAAGAACGUGGAUCUGCUCAAGGCGCUGGGCAAGAAGUCAGAGCGCCUGGAGCUCAGCUACCAGAGCGUGAGCGCUGAGAACCUCCGGCUGCAGCAGAGCCUGGAGAGCAGCAGCCACAAGACGCAGACCUUGGAGAGUGAGCUGGGCGAGCUGGAGGCUGAGCGCCAGGCGCUGCGGCGGGACCUGGAGGCCCUCCGGCUGGCCAAUGCACAGUUGGAGGGGGCCGAGAAGGACAGGAAGGCCCUGGAGCAGGAGGUGGCCCAGCUCGAGAAGGAUAAGAAGCUGCUGGAGAAGGAGGCCAAGCGGCUGUGGCAGCAGGUGGAGCUCAAGGAUGCAGUCUUGGACGAUAGCACUGCCAAACUGUCCGCCGUUGAGAAGGAGAGCCGCGCGCUGGACAAGGAGCUGGCCCGCUGCAGGGACGCAGCCGGCAAGCUGAAGGAGCUGGAGAAGGACAACCGGGACCUCACCAAGCAAGUCACCGUGCAUGCAAGGACACUGACAACUCUGAGGGAGGACCUGGUGCUCGAGAAGCUGAAGAGCCAGCAGCUCAGCAGUGAGCUGGACAAGCUGAGCCAGGAACUGGAGAAGGUCGGCCUCAACAGGGAGCUGCUGUUGCAGGAGGACGACAGCGGCAGUGACACAAAAUACAAGAUUUUGGAGGGCAGAAAUGAAUCAGCAUUAAAAACAACACUAGCCAUGAAAGAAGAAAAGAUUGUGCUCUUAGAAGCACAGAUGGAAGAGAAAGCGAGCCUAAAUCGCCAGUUAGAGAGUGAGCUGCAGAUGCUAAAGAAGGAGUGUGAGACCCUCAGGCAGAACCAGGGAGAGGGGCAGCACUUGCAGAACUCUUUCAAGCACCCUGCGGGGAAGACAGCCGCCAGUCACCAGGGGAAGGAGGCCUGGGGGCCCGGCCAUAAGGAAGCCACCAUGGAGCUUCUCCGAGUGAAGGACCGGGCCAUCGAGCUGGAGCGGAAUAAUGCAGCUCUGCAGGCUGAGAAGCAGCUGCUAAAGGAACAGCUGCAGCACCUGGAGACCCAGAACGUGACCUUCAGCAGCCAGAUCUUGACACUGCAGAAACAGAGCGCCUUCCUGCAGGAGCACAACACCACACUGCAGACCCAGACCGCCAAGCUGCAGGUGGAGAACUCCACGCUGAGUUCCCAGAGCGCAGCGCUCACCGCGCAGUACACGCUGCUGCAGAACCACCACACGGCCAAGGAGACGGAGAACGAAAGCCUGCAGAGGCAGCAGGAGCAACUUACAGCGGCCUACGAGGCCCUGCUGCAGGACCACGAGCACCUGGGCACGCUGCACGAGCGGCAAUCGGCCGAGUACGAGGCCCUCAUCCGCCAGCACAGCUGCCUAAAGACACUGCAUCGGAAUCUGGAGCUGGAGCACAAGGAGCUCGGGGAGAGGCACGGUGACAUGCUGAAGCGCAAGGCGGAGCUGGAGGAGCGGGAGAAGGUCUUGACCACUGAGCGAGAGGCGCUGCAGCAGGAGCAGAGGACAAACGCCCUCGCCAUGGGCGAGAACCAGAGGCUGCGGGGCGAGCUGGACAGGGUCAAUUUCCUGCACCACCAGCUGAAGGGGGAGUACGAGGAGCUGCACGCCCACACCAAGGAGCUGAAAACCUCACUGAACAACGCGCAGCUGGAGCUCAACCGCUGGCAGGCCCGCUUCGACGAGCUGAAGGAGCAGCACCAGACCAUGGACAUCUCGCUGACCAAGCUGGACAACCACUGUGAGCUGCUCUCCCGUCUCAAGGGGAACUUGGAGGAAGAAAAUCAUCACCUCCUGAGCCAGAUCCAGCUGUUGAGCCAGCAGAACCAGAUGCUUCUGGAGCAGAACAUGGAGAACAAGGAGCAGUACCAUGAGGAGCAGAAGCAGUACAUAGACAAAUUAAAUGCCUUACGAAGACAUAAGGAAAAGCUGGAAGAAAAAAUCAUGGAUCAAUACAAGUUCUAUGAUCCUCCUCCAAAGAAGAAGAACCACUGGAUUGGAGCCAAAGCCUUAGUCAAACUCAUCAAACCAAAGAAAGAGGGUUCGAGGGAACGCUUAAAAUCCACCGUGGACAGCCCUCCCUGGCAGCUGGAGUCCUCAGACCCCGCCUCGCCGGCGGCCUCUCAGCCGCUCAGAUCACAGGCCGAGAACCCCGACACCCCCGCACUGGGCUCCAACUGUGCAGAAGAGCGCGACGCCCACAACGGGUCUGUGGGGAAAGGCCCUGGGGAUCUAAAACCAAAGCGAGGCUCCCCACACAGAGGCAGCCUUGACCGCACAGAUGCCUCCACCGAUCUGGCCAUGAGGUCCUGGCCCUCGGAGCUGGGCUCCCGGACUUGCUCAACUUCAGCCACCACUACAGCCCCUUCCAACUCCACCCCCAUCGCCCGGCACCCAGGCCGCACCAAAGGCUAUAACUCAGAUGACAACCUCUGUGAGCCAUCCCUGGAGUUUGAGGUCCCCAACCACAGGCAGUACGUGUCGCGGCCAAGUAGCUUAGAGAGCAGUAGAAACACAUCCAGCAACAGCUCACCUCUUAACCUAAAAGGCUCCUCCGAGCAGCUCCAUGGCCGGUCUGAGAGCUUCAGCAGCGAAGACCUGAUCCCCAGCAGGGACCUGGCCACUUUGCCCCGGGAAGCCAGCACACCGG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-3025.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -3147.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 1799.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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