Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001102467.2

Sequence Length

1099 nt

GC Content

0.6588

GUCCCCUCAGGUGUCCUGCAGGCACAGCAUCUCGGGGGGCCCAGGCCGAUGGCAGGUCUUAACGUGUCCCUCUCCUUCUUCUUUGCCACCUUCACCCUCUGUGAGGCAGCCAGGCGGGCCUCCAAGGCCCUGCUCCCAGUGGGCGCCUAUGAAGUCUUCGCCCGGGAGGCGGUGGGCGCGGUGCAGCUCGGGGCCUGCUUCCUGGAGAUGAGGACGCUGGUCGAGCUCGGGCCCUGGGCUGGGGACUUUGGGCCUGACCUGCUGCUCACCCUGCUCUUCCUGCUCUUCCUGGCGCACGGGGUCACCUUGGACGGGGCCUCGGCCAACCCCACCGUGUCCCUGCAGGAGUUCCUCAUGGCCGAGGAGUCUCUGCCUGGCACGCUGCUGAAGCUGGCGGCACAGGGGCUGGGCAUGCAGGCCGCCUGCACCCUGACGCGCCUCUGCUGGGCCUGGGAGCUCAGUGACCUGCACCUGCUGCAGAGCCUCAUGGCCCAGAGCUGCAGCUCGGCCCUGCGCACAUCCGUGCCCCACGGGGCGCUUGUGGAGGCCGCCUGCGCCUUUUGUUUCCAUCUGACCCUCCUGCACCUGCGGCACAGUCCUCCCGCCUACAGCGGGCCCGCUGUGGCUCUGUUGGUCACCGUCACGGCCUACACGGCCGGGCCCUUCACGUCUGCCUUCUUCAACCCUGCCCUGGCCGCCUCUGUGACCUUUGCCUGCUCGGGACACACCUUACUGGAGUACGUGCAGGUGUACUGGCUGGGCCCUCUGACAGGGAUGGUCCUGGCUGUGCUGCUGCACCAGGGCCGCCUUCCCCACCUUUUCCAGAGGAACCUGUUCUACGGCCAGAAGAACAAGUACCGAGCACCCCGAGGGAAGCCGGCCCCGGCCUCAGGGGACACCCAGACCCCUGCAAAGGGGUCCAGUGUCCGGGAGCCUGGGCGCAGUGGUGUUGAGGGGCCACAUUCCAGCUGAGUGGCCUUGCUCUGUGUGAGCCCCGUGCGAGGGCCCUGCUUGUAGCUGGACCCUGGAACCUUCUGUAGCUAAGAGGGAAUCCUGGCCCCCUCCCCAGAAGCCAUUUGUCAAUAAACCAUUUCUAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-503.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -518.81

Frequency: 0.0000

Diversity: 404.88

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((.((((((..((....))..)))))).)))))))...(((.((((((.((.(.......).))..............((((....((((.....))))))))(((((((((((((...))))))..(((((...(((((.............))))))))))((((.(((((((((((((((((((((((((((......(((.((....)).)))))))..)))))))))))))(((....(((((..........)))))))).((.......))......((((...(((((((.((......)))))))))))))....)))))))))))))).((((((((((......)))))).)))))))))))..((((((......)))))).(((((((.(.(((((((((...))))))...)).).))))))))(((((((((((.((((.......((((.....)))))))))))).)))))))(((((((((..((((((.(((((....((((((....))))))...(.((.(((((.(((((((...((((((.(((((......((((...(((((((((((...((((((.(((.(((((((((((((((.....)))))).(((((((......(((((((((..........................)))).)))))...)))))))....((((((.((..((...((.....)).)).)).)))))).....))).)))))).)))...))).)))....)))))))))))))))((.((((((.((((((.............((.((.((((((.(.....).)))))).)).))...........)))))).)))))).))..)))))((((((...(((((((....)))))))..))))))))))))..)))))))))))).)).)((((((((((...(((.(((....))))))..))))).))))))))))))))))..)).)))))))((..((.(((.((((((.......))))))..))).))..))..........)))))).)))..................

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((.((({,,,,{{,,||{||{||,|||,|||||||{{{(((,({,((({{({....,}.}},}}.,,.,.........{(((....((((.....)))))))}(((((((((((((...})))))..(((((...(((((........,....))))))))))((((.(((((((((({{(({((((((({{{.{{{,{{,{{,.||||.{|.{||,||||{{||||||,||||||,{{.}|,,||||||||...,,.}}}}}}},.||...}}}}||}|,,|,.||{||.{(((({{.{|..|,..}))))))))))}.....)))))))))))))).((((((((((......)))))).)))))))))))..((((((,....,)))))).(((((((,{{(,.((((((...)))))),}}}}..,,))))}))(((((((((((.((({.,,,...{(({...,,}))))))))))).))))))){(({(((({..{(({{{.(((((....((((((....))))))...|,{|,{|{|||{|{||{{...((({{{..{{{{......((((,,.((({(((((({..{((((,,.{{|,|||{{{||||||{|......||||||.{{{{((({,....,((({((({......................,,,.)))}.)))))...),)))))}...(({((({({{{,,...,,...},})})),,),))))))}},..))),)))))),))).,,|||.,}}.,,,))))))))}})))))((.((((((.((((((..,{,,....,}}||.((.((((((.(.....).)))))).)).}|,........}.)))))).)))))).))},),)))||||{{...(((((((....)))))))..||||||||}}}},,))))))}|||||.}},|((((((({{{.,,(((,(((,,,,|||||},.}}}}).))}}})})))))))))..))}}})))))||,.,,.(((.((((((.......))))))..)))}))}})),,,..,}}}.))}}}}.}}}..................