Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001114122.3
Sequence Length
4128 nt
GC Content
0.4157
UUUGGCUCUCCCCGCCUGUUCUUUGCACAUUAAAAAUGAAAAAGUUUGUAGAACUAAGCUAAGCAGAUGGUCUUCCUGCAAAAAGACCGGGCUGAAGUAAAGCAUUGUUUUGGAGCUGGUUCACAGAAAAAAGGCAAAACUGGUUAUCCUGACUUCAAGCUCCAACAUAAACUGCUCGCUUUCUCCGGGAAACUUGCCCCGCCACACACACUUGACUGCGUGGCCAGUUCUUUCGAAGCCUCUCGCUCCCAACACGGAGUUCCUCCCAUUUCUUCACAGUCGGCUCUCAGCAGCUGCUGCUGGUUUCUCGGCUCCAGCACCACGAGUACCGCACUCUGAGGUUUACAAAGCACUCUGCUUCACCGACUGUGAUCCUCACAGUCCUGUCCGGUGGCCUCACGCAGGUGGCGGUGCAGCCUUUCAGGCCCAGAGCGGCCAGGAGCGAAGCCCGCAGCCCCGCCUGGAAGCGCAGCGCGGUCGGUCGCGCGCCCCUGAGGCUUGGAGGCCUGGGCUUCCCCCAGCAGCGCUCGAGCACCGCCCAGUCGAGCCUCACACCGGAUGCCACUUCAUAUUUGGGCCCAGAGCUCAAUUCGCGCCGAUGCGGUCCGCCGUCCUUAAAUCUCUUCAGCCAGGAUCUCUCCCCGACUGCAAAGCAGCCCUGGGCGGGAGCGGCAACAUCUCCACGUCACCCUUUUGGAGCCGCCGACAUUCAGAGGGGCAGGACACGGGAACGCGCGCUGUCUUGCUUUACGGCGCGGGUGCGCGAGUUUGCGGCAGCGUGACGCCCUCAAGUUUUGGCGGGAAAAGCGCUGCAUUUGGAUUCCUGCAGUGGUGGGCAAAGGACAGUCCGCCGAGGUGCUCGGUGGAGUCAUGGCAGUGCCCUUUGUGGAAGACUGGGACUUGGUGCAAACCCUGGGAGAAGGUGCCUAUGGAGAAGUUCAACUUGCUGUGAAUAGAGUAACUGAAGAAGCAGUCGCAGUGAAGAUUGUAGAUAUGAAGCGUGCCGUAGACUGUCCAGAAAAUAUUAAGAAAGAGAUCUGUAUCAAUAAAAUGCUAAAUCAUGAAAAUGUAGUAAAAUUCUAUGGUCACAGGAGAGAAGGCAAUAUCCAAUAUUUAUUUCUGGAGUACUGUAGUGGAGGAGAGCUUUUUGACAGAAUAGAGCCAGACAUAGGCAUGCCUGAACCAGAUGCUCAGAGAUUCUUCCAUCAACUCAUGGCAGGGGUGGUUUAUCUGCAUGGUAUUGGAAUAACUCACAGGGAUAUUAAACCAGAAAAUCUUCUGUUGGAUGAAAGGGAUAACCUCAAAAUCUCAGACUUUGGCUUGGCAACAGUAUUUCGGUAUAAUAAUCGUGAGCGUUUGUUGAACAAGAUGUGUGGUACUUUACCAUAUGUUGCUCCAGAACUUCUGAAGAGAAGAGAAUUUCAUGCAGAACCAGUUGAUGUUUGGUCCUGUGGAAUAGUACUUACUGCAAUGCUCGCUGGAGAAUUGCCAUGGGACCAACCCAGUGACAGCUGUCAGGAGUAUUCUGACUGGAAAGAAAAAAAAACAUACCUCAACCCUUGGAAAAAAAUCGAUUCUGCUCCUCUAGCUCUGCUGCAUAAAAUCUUAGUUGAGAAUCCAUCAGCAAGAAUUACCAUUCCAGACAUCAAAAAAGAUAGAUGGUACAACAAACCCCUCAAGAAAGGGGCAAAAAGGCCCCGAGUCACUUCAGGUGGUGUGUCAGAGUCUCCCAGUGGAUUUUCUAAGCACAUUCAAUCCAAUUUGGACUUCUCUCCAGUAAACAGUGCUUCUAGUGAAGAAAAUGUGAAGUACUCCAGUUCUCAGCCAGAACCCCGCACAGGUCUUUCCUUAUGGGAUACCAGCCCCUCAUACAUUGAUAAAUUGGUACAAGGGAUCAGCUUUUCCCAGCCCACAUGUCCUGAUCAUAUGCUUUUGAAUAGUCAGUUACUUGGCACCCCAGGAUCCUCACAGAACCCCUGGCAGCGGUUGGUCAAAAGAAUGACACGAUUCUUUACCAAAUUGGAUGCAGACAAAUCUUAUCAAUGCCUGAAAGAGACUUGUGAGAAGUUGGGCUAUCAAUGGAAGAAAAGUUGUAUGAAUCAGGUUACUAUAUCAACAACUGAUAGGAGAAACAAUAAACUCAUUUUCAAAGUGAAUUUGUUAGAAAUGGAUGAUAAAAUAUUGGUUGACUUCCGGCUUUCUAAGGGUGAUGGAUUGGAGUUCAAGAGACACUUCCUGAAGAUUAAAGGGAAGCUGAUUGAUAUUGUGAGCAGCCAGAAGAUUUGGCUUCCUGCCACAUGAUCGGACCAUCGGCUCUGGGGAAUCCUGGUGAAUAUAGUGCUGCUAUGUUGACAUUAUUCUUCCUAGAGAAGAUUAUCCUGUCCUGCAAACUGCAAAUAGUAGUUCCUGAAGUGUUCACUUCCCUGUUUAUCCAAACAUCUUCCAAUUUAUUUUGUUUGUUCGGCAUACAAAUAAUACCUAUAUCUUAAUUGUAAGCAAAACUUUGGGGAAAGGAUGAAUAGAAUUCAUUUGAUUAUUUCUUCAUGUGUGUUUAGUAUCUGAAUUUGAAACUCAUCUGGUGGAAACCAAGUUUCAGGGGACAUGAGUUUUCCAGCUUUUAUACACACGUAUCUCAUUUUUAUCAAAACAUUUUGUUUAAUUCAAAAAGUACAUAUUCCAUGUUGAUUUAAUUCUAAGAUGAACCAAUAAAGACAUAAUUCUUGUGACUUUUGGACAGUAGAUUUAUCAGUCUGUGAAGCGAAGCCAGCUUCAAAACAUAUCCCCAAGAUUUGUACUUAUAUUUUCAAAAGGGCCUGGCCAGUUAUAUAAACCUGUUUUUGAAUUAUAAUGAUUAAUUAAAAUUGCAAGUAGGUGUUUUUUCCAGUGUAGUUAGUAAAAUACUUGUAUUUUACAGUGUUGCAUAAACUCUAGUGCUUAACUAACUUUACUCUAAAAAUUACUGUUGAACAUCUUAAAUAUUUUUCUAUAUUUUCUACUUUCAUAGCCAUAUUUUAACCUUUUCAACUUACUGGUGACCAAGCUUUUAGGUGAUAAAGAAUAAAAGAGGGAAGGGAAGAGUAAGGAAGCUAUAAGAAAAAUAGAUCUGAUUCUUUGUUCCUUUACCUGUUAGACUUACAAAAAGUUUGUUUUUCUAAUAAAAUUUGUAUCAACUUUGGGGCAUAUUAGGUUGAGGCCUUGGCUCCUGCCUGUAGUCCCAGCUACUUAGGAGGCUGAGAGAGGAGGAUCGCGUGAACCUGGAAGUUUGAGGCUGUAGUGAGCUAUGAUUGCACCAGUGCACUCCAGCUUGGAUGACAGAGUAAGACCCUACCUCUAAUAAAAAUUUUUAAAAUUGUAAAACAUUAUAAAAUUAAUCAGUUAUUUUAAUCUGAAGCCAAGAACAUGUAGAAUGUUAUGAUUAGAGUUUAUCACAUAUUAAUGUAUACUGGCAAAUUGUGUUACUGGAGUAUACCCAUAGGAGGAAUAAAUUCAAACCUGUUUUAUUUAUUUGAACCUAUUUACGGUAUGCUUAAGAAUUGAAUCAGUAUAAAUUCUCAAAUAUGGGAGAAAUUUUGUUCUUGAGAAUUAUCUGAGUCAUUAAUAUUUUUCAAAAACAGCUCUCACUGACUUGAACCUCUUCUGUAAGCUCUAACCUUUUACCUGCUUUACAUUUCCACUUGAAUGUCUAGUAGGCAUCUCUUGACCAAAAACAGCUUUUGAUUCCUGUUCUCCAACCUGUUCCUCUCCUAGUUUUCUCCAUCUCAGAAAUGUUACUUCCUCUGCAAAGUCUUUCCCUGACUUAUCUAAAAUAAUAACCUCCUCUGUUUGCUGUGGGAAUUUGUAUAGAAUGGUGGGAAAAUUUCAAGUUUCAUAUUUGGAUUAGCUCUGACAUUUAUUUAUCUGAACACUGGUAAUUGCCUCAGUAAAGACACUGAUAAUAAGUACCUUUUAGAGUUAUUUUAAUCUUUAAUGCUUUAAUGUGUAGGAAGAGUAUAGUGUCCUGUUUUGCACAGAAAGGCAUUCUGUAAAUAAUAAGUUGCCUUAAUUUUCCUGUAAUGUUCAUUAUAUUGUUGUGGGAAGGUAUUUACUCCUAUUAUUAAAAAUAAAAAUGUGUAAAAUUUACUACCUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1151.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1234.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 883.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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