Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001127444.2
Sequence Length
1987 nt
GC Content
0.3749
AUGACAUUAUUAGUUCUGCCACUGGUAGGCAUUAGAAGCAAGAAAAGGGAGACGGACCGAGGAAGCCACUUUGGUGAAACAAAAAGAAAAGCAUUUGUUUAUUUAGAACGGGCAAAAUGAUACGUUUCAGUGGGUGUUUUCUUUGUACUUUGAUCUUUUUGUACUGAUAUUUAAGCUUCUGUUUUAUGAUCUCUUUCUAAUGAUAGAACCAGAGCUUGUAGAAACCACUUUAAUCAUAUCCAGGAGUUUGCAAGAAACAGGUGCUUAACACUAAUUCACCUCCUGAACAAGAAAAAUGGGCUGUGACCGGAACUGUGGGCUCAUCGCUGGGGCUGUCAUUGGUGCUGUCCUGGCUGUGUUUGGAGGUAUUCUAAUGCCAGUUGGAGACCUGCUUAUCCAGAAGACAAUUAAAAAGCAAGUUGUCCUCGAAGAAGGUACAAUUGCUUUUAAAAAUUGGGUUAAAACAGGCACAGAAGUUUACAGACAGUUUUGGAUCUUUGAUGUGCAAAAUCCACAGGAAGUGAUGAUGAACAGCAGCAACAUUCAAGUUAAGCAAAGAGGUCCUUAUACGUACAGAGUUCGUUUUCUAGCCAAGGAAAAUGUAACCCAGGACGCUGAGGACAACACAGUCUCUUUCCUGCAGCCCAAUGGUGCCAUCUUCGAACCUUCACUAUCAGUUGGAACAGAGGCUGACAACUUCACAGUUCUCAAUCUGGCUGUGGCAGCUGCAUCCCAUAUCUAUCAAAAUCAAUUUGUUCAAAUGAUCCUCAAUUCACUUAUUAACAAGUCAAAAUCUUCUAUGUUCCAAGUCAGAACUUUGAGAGAACUGUUAUGGGGCUAUAGGGAUCCAUUUUUGAGUUUGGUUCCGUACCCUGUUACUACCACAGUUGGUCUGUUUUAUCCUUACAACAAUACUGCAGAUGGAGUUUAUAAAGUUUUCAAUGGAAAAGAUAACAUAAGUAAAGUUGCCAUAAUCGACACAUAUAAAGGUAAAAGGAAUCUGUCCUAUUGGGAAAGUCACUGCGACAUGAUUAAUGGUACAGAUGCAGCCUCAUUUCCACCUUUUGUUGAGAAAAGCCAGGUAUUGCAGUUCUUUUCUUCUGAUAUUUGCAGGUCAAUCUAUGCUGUAUUUGAAUCCGACGUUAAUCUGAAAGGAAUCCCUGUGUAUAGAUUUGUUCUUCCAUCCAAGGCCUUUGCCUCUCCAGUUGAAAACCCAGACAACUAUUGUUUCUGCACAGAAAAAAUUAUCUCAAAAAAUUGUACAUCAUAUGGUGUGCUAGACAUCAGCAAAUGCAAAGAAGGGAGACCUGUGUACAUUUCACUUCCUCAUUUUCUGUAUGCAAGUCCUGAUGUUUCAGAACCUAUUGAUGGAUUAAACCCAAAUGAAGAAGAACAUAGGACAUACUUGGAUAUUGAACCUAUAACUGGAUUCACUUUACAAUUUGCAAAACGGCUGCAGGUCAACCUAUUGGUCAAGCCAUCAGAAAAAAUUCAAGUAUUAAAGAAUCUGAAGAGGAACUAUAUUGUGCCUAUUCUUUGGCUUAAUGAGACUGGGACCAUUGGUGAUGAGAAGGCAAACAUGUUCAGAAGUCAAGUAACUGGAAAAAUAAACCUCCUUGGCCUGAUAGAAAUGAUCUUACUCAGUGUUGGUGUGGUGAUGUUUGUUGCUUUUAUGAUUUCAUAUUGUGCAUGCAGAUCGAAAACAAUAAAAUAAGUAAGUAUGUACCAAAAAAUAUUGCUUCAAUAAUAUUAGCUUAUAUAUUACUUGUUUUCACUUUAUCAAAGAGAAGUUACAUAUUAGGCCAUAUAUAUUUCUAGACAUGUCUAGCCACUGAUCAUUUUUAAAUAUAGGUAAAUAAACCUAUAAAUAUUAUCACGCAGAUCACUAAAGUAUAUCUUUAAUUCUGGGAGAAAUGAGAUAAAAGAUGUACUUGUGACCAUUGUAACAAUAGCACAAAUAAAGCACUUGUGCCAAAGUUGUCCAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-484.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -524.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 463.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((....((((((((((...)))))).))))...(((.(((...((((((....((((((((.(((((...((((((..........((..((((((.....))))))))..........))))))..))))).)))))))).........(((((((((((((.......(((.((((((.((.(((.((((((((((((((..((((..((((((((..((................))..))))))))....(((((.(((....)))..))))).((.....))....((((((.....(((......)))))))))..))))..))))))))...((((((((..(((((((((.((((.(((((((....))))))))))).(((......))).(((((.((((((((.(((((((......))).))))))))))))...)))))........))))))))).))......))))))..(((((.((((.....))))))))).)))))).))).)))))))).))).....)).)))...))))))))(((((((..(((...(.(((((((((((......)))))))).))).)...))).)))))))......))))))))).)))...((((((((.(((((((.((.((((((.((..((.(((((..(((((((.........(((........)))..((((((((((((......(((((..........(((((((.((.(((........))).))...)))))))..............(((((....(((((((((...(((((((.((((((...((.(((.(((..........))).))).)))))))).)).........(.((((((....................)))))).)))))).)))))))))...))))).)))))......))..)))))))))).........................((((((.(((((((....(((.....)))....))))))).)))))).)))))))..))))).))..)).)))).....((((((((....(((((.(((((((..((((((..(((.(((((((((.......((.(((...............))).)).....)))))))))......((((((..((((....))))....(((((..........)))))....(((((....)))))..................(((((((....))))))).(((((((((....((((.(((((((((....(((.......)))...))).))))))...))))....)))))))))...........))))))....))))))))).)))))))...)))))))))))))....((((((.......)).))))(((((..(((((........(((..(((..(((....)))...)))..)))........)))))..))))).....(((.(((.((......)).))).)))...)).))...)))).))).))))))))((((.((..(((..(((((((.((((((.........(((..........))).((((((((((....(((.(((.(((....((((((.(((((.(((((((((...((((....))))....))).))))))...........((((((((((.((((((......(((((((......)))))))....))))))))))))))))))))).)))))).)))))))))..)))))))))).....)))))).)))))))...))).)).))))........(((((((......)))))))...........((((.((((..((((((((((((...(((.(......).)))..))))))))))))))))...)))).......((((((.........))))))......)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((...,{{((((((((...)))))).}}}},..(((.(({..,((((((,,{{((((((({.{((||||.((((((..........((.,{(((((.....}))}},))..........)))))).})))))}))))))}),.|......(((((((((((((.......(((.(((((((((.(((.((((((((((((((..((((.,{{(({{((..(({{.,,..,,,{{,,{{}}..||||,,}}....(((((.,{,....},}..))))).||.....}}....,||||,|}}}}..,,,...}))),})))},.))))..))))))))},.(((((({(,.(((((((((.((((.(((((((....))))))))))).,,...,,,.,,..(((((.(((((((({(((((((......))).))))))))))))...)))))..,,....))))))))).,}....,,))))))..(((((.((((.....))))))))).,))))).))).)))))))).))).....}),}))...))))))))(((((((..(((.{.{.(((((((((((......)))))))).))).}.,.))).)))))))......))))))))).)))...((((((((.(((((((.....,({((.{{..((.(((((..(((((((.,,.,....{{(|{..,..,|||{{((((((((((,,......{{{{{..........(((((((.{{.(((........))).}}...)))))))........,....,{(({{....{||{{{{{|.,,|{{|||{.((((((.,,({,(((.(((..........))),))),)))))))).}}..{{{...,|,|{{(((..,,,..........,,,..))})}},})})}}.}}}}}}}}|,..}}))},))))}......}}..})))))))},.,|,,,.........}}}....,,.((((((.(((((((....(((.....))).,..))))))).)))))),)))))))..))))).))..}),)))}..{{{((((((((.,.{(((((.{((((({{{(,,{(({{({,...,,,.|||,{{{..{(({(((,..{{{{...,,..,|||{{{{..{{|{||||,,.{(((({((,{({,,((((....)))}....{{{({......,{{{,|||,...}|||||}...|||,.......,,,.........(((((((....))))))).{((((((((....((((.(((((((((....(((.......)))...))).))))))...))))..,.))))))))},|,..,,..,}))}}|,......}}},,}}.,)))))))).}}},}}}})}}))}}..,|||||,,}}}},))))))},||||,,{{{{|||....,,{||,,||{..(((....)))...))),.})).....,}|)}}}},,,,,,}.})}.)))}}})}}}}.....))}))}......})))))...)))).))).))))))))((((.((..(((..(((((((.((((((.........(((..........))).((((((((((....(((.(((.(((....((((((.(((((.{((((((((,..((((....))))....))).)))))),.........,((((((((({{((((((......{((((((......)))))))....))))))))))))))))))))).)))))).))))))))}..)))))))))).....)))))).))))))).,.))).)).))))........(((((((......)))))))...........{{{{.((((..((((((((((((...(((.(......).)))..))))))))))))))))...}})).......((((((.........))))))....,,)))).....
Back