Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001127617.2

Sequence Length

1630 nt

GC Content

0.5957

GAAGCACCGGUGAGUGGGCAGGGGCUCCCUCCCCAUCAAUAGGGCCGACCCAAGUCUUCCUCCCCCUUCCCCCAUGCCGGGCCCCACGAUAGUGUGAAUGUCAGGGGCUUCAGGUUUCCCUAAAUAUAGGUCCCUGCCAGAGGAUCCGUGGCGGGAAAAGGGCAGGGGUCAUUAGAGAAGAUCGGGGACACAUGUGGGGCGGGCAGGAGCUGCCUUAUAACCAGCCCGGGAACCCCUAGCUCACUCGCUGCUGACCAGGCUCUGCCGGCUCCUUCGGCCUCGCCGCAGGAACUUGCUACUACCAGCACCAUGCCCUACCAAUAUCCAGCACUGACCCCGGAGCAGAAGAAGGAGCUGUCUGACAUCGCUCACCGCAUCGUGGCACCUGGCAAGGGCAUCCUGGCUGCAGAUGAGUCCACUGGGAGCAUUGCCAAGCGGCUGCAGUCCAUUGGCACCGAGAACACCGAGGAGAACCGGCGCUUCUACCGCCAGCUGCUGCUGACAGCUGACGACCGCGUGAACCCCUGCAUUGGGGGUGUCAUCCUCUUCCAUGAGACACUCUACCAGAAGGCGGAUGAUGGGCGUCCCUUCCCCCAAGUUAUCAAAUCCAAGGGCGGUGUUGUGGGCAUCAAGGUAGACAAGGGCGUGGUCCCCCUGGCAGGGACAAAUGGCGAGACUACCACCCAAGGGUUGGAUGGGCUGUCUGAGCGCUGUGCCCAGUACAAGAAGGACGGAGCUGACUUCGCCAAGUGGCGUUGUGUGCUGAAGAUUGGGGAACACACCCCCUCAGCCCUCGCCAUCAUGGAAAAUGCCAAUGUUCUGGCCCGUUAUGCCAGUAUCUGCCAGCAGAAUGGCAUUGUGCCCAUCGUGGAGCCUGAGAUCCUCCCUGAUGGGGACCAUGACUUGAAGCGCUGCCAGUAUGUGACCGAGAAGGUGCUGGCUGCUGUCUACAAGGCUCUGAGUGACCACCACAUCUACCUGGAAGGCACCUUGCUGAAGCCCAACAUGGUCACCCCAGGCCAUGCUUGCACUCAGAAGUUUUCUCAUGAGGAGAUUGCCAUGGCGACCGUCACAGCGCUGCGCCGCACAGUGCCCCCCGCUGUCACUGGGAUCACCUUCCUGUCUGGAGGCCAGAGUGAGGAGGAGGCGUCCAUCAACCUCAAUGCCAUUAACAAGUGCCCCCUGCUGAAGCCCUGGGCCCUGACCUUCUCCUACGGCCGAGCCCUGCAGGCCUCUGCCCUGAAGGCCUGGGGCGGGAAGAAGGAGAACCUGAAGGCUGCGCAGGAGGAGUAUGUCAAGCGAGCCCUGGCCAACAGCCUUGCCUGUCAAGGAAAGUACACUCCGAGCGGUCAGGCUGGGGCUGCUGCCAGCGAGUCCCUCUUCGUCUCUAACCACGCCUAUUAAGCGGAGGUGUUCCCAGGCUGCCCCCAACACUCCAGGCCCUGCCCCCUCCCACUCUUGAAGAGGAGGCCGCCUCCUCGGGGCUCCAGGCUGGCUUGCCCGCGCUCUUUCUUCCCUCGUGACAGUGGUGUGUGGUGUCGUCUGUGAAUGCUAAGUCCAUCACCCUUUCCGGCACACUGCCAAAUAAACAGCUAUUUAAGGGGGAGUCGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-647.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -673.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 348.62

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....((.(((((((((((((((((.(((((((((.......(((....)))..((((((((.(((((.(((....((((((((((..((((.......)))).)))))))..)))...((((....))))..(((((((.........)))))))....))).))))).....)).)))))).)))))........((((((((((...))))))........)))))))).))))).)))))))))))).)).........(((((((((((((((.(((((((...(..(((((((......(.(((((((((((((....((((((((((.(((.(((...((.((((((((((((.......((.(((......)))))...((((((..((.((((((((.......))))....)))))).))))))...(((.(((((....((((....(((((.(((.(.....)))).).))))...))))))))).))))))))))((((.((......((((((.....))))))((((((((((((....(((...)))....))))).))))))).)))))))))))..........))...)))..))))))))))).)).......))).....)))))))))))....)))))))..)...))))))).)).(((((....)).)))...((((((.((.(((.((((((........((.((((..(((..((..((((....))))..))..(((((.....((((.......)))))))))..((((((...(((..(((((((.(.(.(((((....(((....)))...))))).).).)))))))((.(((((((.((((.........)))).))))))).)).....((((.(((((.((((((((.(........).)))))))).)).).)).))))..((((((((....(((........)))..(((..(.....)..)))((((((((((......))))))).)))))))))))((((((((....)))))))).)))))))))...((((((.((.((((((((((.......((((((((((.((.....)).(((.....)))((((..((.(((((((.(((((............))))).......((.((((...((....))...)))).))..)))))))))..))))..((((..((((((((......).)))))))))))((((((((((((..((....((((.(((..((........))..)))))))..))....((((((.(((..((..(((........)))))..))).))))))((((....(((((((((((((....(((........)))....(((((.(((((.(....((((..(((............)))))))..))))))....))))).(((((((...))))))))))))))...))))))..))))...))))))))))))..)))))))))))))))))))).))))))))..)))..)))).)).........)))))).))))).....))))))......))))))))))))).................

Thermodynamic Ensemble Prediction

...,({.(((((((((((((((((.((((,{(((.......|||....|||..(((((((({(((((.(((....((({((((((..((((.......)))).))))))}..)))...((((....)))),,(({((((..,....,.))))))),...))).))))).....,)})))))).}))),.....,,,((((((((((...))))))........)))))))).))))).)))))))))))).)}.........((((((((((((({{.(((((((...(..(((((((......{.(((((((((((((.,,.((((((((((.(((.(((,,.({.({{(((((((({.......|{||{(,{{...|||||...((((((..((.(((((({(.,.....}),)},,,)))))).)))))).|{(((.(((((....((((....(((((.(((.{.....}))).).))))...))))))))).))))}))))){{({.{{.}},..((((((.....))))))((((((((((((...,(({..,))}....))))).)))))))|||}}})))}}).,,.......,,...)))..)))))))))}},)),.,}...))),....}))))))))),....)))))))..)...))))))).}}.(((((....))}})).||{(((((.((.(((.((((((........((.((((..(((..{{.,((((...,||||..}}{.(((((.{...((((......)))))))))),,{({(({{(((((..(((((((.{.{.(((((..,.{((....)}}.,.))))).).}.))))))}((.(((((((.((((.........)))).))))))).))}}}}.((((.(((((.((((((((.(........).)))))))).)).).)).)))),,((((((((....{({........)))..(((..{.....}..)))((((((((((......))))))).))))))))))),||||(((|...,})))).,,)}}))))))...((((((,({.((((((((((.......((((((((((.(((,...}}.{((.....|}}((((.,((,(((((((.(((((............}})}}.......,{.((((..,((....||...}}}}.}}..}}|||||||.,}}||..((((..((((((((......),})))))))))){||{{|{|||||..||,...|||{.{||,,|{,{.,,.,.}}..|}}}|}|,,||,...((((((.(((,{{(..(((........))),,..))},))))})||||,,..|||||((((((((....{{,........,||,......,|,{{{{(,{....{{((,.{{{............)))}})),},))))),,,.}},,..(((((((...))))))))))))))..,))))))..))}}...))))}}}}))))..)))))))))))))))))))),)}))))))..)))..)))).)).........)))))).))))}.....)))))}......))))))))))))).................