Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001130910.2
Sequence Length
1536 nt
GC Content
0.4486
AGCUGUCACAGGAAGCUGCUUCGGGGGGUGAGCAAACUUUUUAAAAUGCAGAAAUUAUGAUCUACACCCGUUUCUUAAAAGGCAGUCUGAAGAUGGCCAAUUACACGCUGGCACCAGAGGAUGAAUAUGAUGUCCUCAUAGAAGGUGAACUGGAGAGCGAUGAGGCAGAGCAAUGUGACAAGUAUGACGCCCAGGCACUCUCAGCCCAGCUGGUGCCAUCACUCUGCUCUGCUGUGUUUGUGAUCGGUGUCCUGGACAAUCUCCUGGUUGUGCUUAUCCUGGUAAAAUAUAAAGGACUCAAACGCGUGGAAAAUAUCUAUCUUCUAAACUUGGCAGUUUCUAACUUGUGUUUCUUGCUUACCCUGCCCUUCUGGGCUCAUGCUGGGGGCGAUCCCAUGUGUAAAAUUCUCAUUGGACUGUACUUCGUGGGCCUGUACAGUGAGACAUUUUUCAAUUGCCUUCUGACUGUGCAAAGGUACCUAGUGUUUUUGCACAAGGGAAACUUUUUCUCAGCCAGGAGGAGGGUGCCCUGUGGCAUCAUUACAAGUGUCCUGGCAUGGGUAACAGCCAUUCUGGCCACUUUGCCUGAAUUCGUGGUUUAUAAACCUCAGAUGGAAGACCAGAAAUACAAGUGUGCAUUUAGCAGAACUCCCUUCCUGCCAGCUGAUGAGACAUUCUGGAAGCAUUUUCUGACUUUAAAAAUGAACAUUUCGGUUCUUGUCCUCCCCCUAUUUAUUUUUACAUUUCUCUAUGUGCAAAUGAGAAAAACACUAAGGUUCAGGGAGCAGAGGUAUAGCCUUUUCAAGCUUGUUUUUGCCAUAAUGGUAGUCUUCCUUCUGAUGUGGGCGCCCUACAAUAUUGCAUUUUUCCUGUCCACUUUCAAAGAACACUUCUCCCUGAGUGACUGCAAGAGCAGCUACAAUCUGGACAAAAGUGUUCACAUCACUAAACUCAUCGCCACCACCCACUGCUGCAUCAACCCUCUCCUGUAUGCGUUUCUUGAUGGGACAUUUAGCAAAUACCUCUGCCGCUGUUUCCAUCUGCGUAGUAACACCCCACUUCAACCCAGGGGGCAGUCUGCACAAGGCACAUCGAGGGAAGAACCUGACCAUUCCACCGAAGUGUAAACUAGCAUCCACCAAAUGCAAGAAGAAUAAACAUGGAUUUUCAUCUUUCUGCAUUAUUUCAUGUAAAUUUUCUACACAUUUGUAUACAAAAUCGGAUACAGGAAGAAAAGGGAGAGGUGAGCUAACAUUUGCUAAGCACUGAAUUUGUCUCAGGCACCGUGCAAGGCUCUUUACAAACGUGAGCUCCUUCGCCUCCUACCACUUGUCCAUAGUGUGGAUAGGACUAGUCUCAUUUCUCUGAGAAGAAAACUAAGGCGCGGAAAUUUGUCUAAGAUCACAUAACUAGGAAGUGGCAGAACUGAUUCUCCAGCCCUGGUAGCAUUUGCUCAGAGCCUACGCUUGGUCCAGAACAUCAAACUCCAAACCCUGGGGACAAACGACAUGAAAUAAAUGUAUUUUAAAACAUCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-434.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -462.62
Frequency: 0.0000
Diversity: 400.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((..(((((((.........(((((((......((((........)))).......)).))))))))))))....))))))....(((((((((.........))))....((((((.........))))))......((((..((((((((((((..(((((((((..((((...((((.(.((...(((.......)))..))).))))..))))..)))))))))..))...((..(((((.(((((((((..((......(((((((((((............))))...(((((((((((((....(((...........)))...))))))...)))))))...(((((((((.(((((..(((...((((((((((((((((((((.(((...(((.....)))...)))..)))))).......((((.((((...........(((((((.(((.(.((((((.(((.((((....)))).)))...)))))).).))).)))))))(((((((((.(((((....((((..((((....))))..))))..)))))((.(((......))).))......((((....))))(((((.(((((((.((((....((((((.((((((((((((....(((((......((....)).......)))))....))))).))....))))).))))))...))))....((((((((.(((((((.(((((......))))).)))))))..........)))....))))).((((((...)))))).............(((((...)))))))))))).)))))...)))))))))..................))))))))......((((((((.(((..(((((.((((....)))).)))..)).)))...))))))))..............))))))....)))).....))))...)))((((((((((.((......(((((((((....(((........)))...)).)))))))((.((((.....((((...........)))).....)))).))..((((.(((..((((...........))))..))).))))..............((((((..((((((....(((((((....................)))))))...))))))...))))))..........)).))))))).))).))))))).)))))))..........))))))).))..))))).)))))))))..))(((((((((((....))))..(((..(((((((((((((...........)))).)))).....(((((......))))).........))))).)))....(((........)))..((((((...(((.((((....)))))))..))))))(((....))).))))))).)))))..)))))..))))...(((((.....))))).......((((.......)))).........))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((..(((((((,,,...,{{(((((({{{...,((((.......|)))}...,,.,)}.)})))))))))}....)))))}....(((((((((.........))))....((((((........,))))))......((((..(((((((((({{..(((((((((..((((...{{.{...{,...(((((...{(((...))))))))).))))..)))))))))..}}..,{{..(((((.(((((((((..((..,,,,{((({{{((((.,,,.....,..))))...{{(((((((((({....{{{..,........})).,,)))))}...})))))}...(((((((((,((({{..|||,..((((((((((((((((((((.(((...(((.....)))...)))..)))))}{{((((((((.((({{.........,}...))).)))))))|,||||,(((,(((({{{{||||,|||{{{|,,,,}.|,|||{(((((|{{{((((((..,,||||},...,,.,{|,}}}}|||.||||,...,}}}|{{{.(((......))).)}}|..,.((({....}))).|{{,.(((.(((.((((....((((((.((((((((((((....(((((.....,((....)).,.....)))))....))))).))....))))).))))))...)))).))).))),.||..,,,,,,.,,,,{|||||,,)))),)}},}},.,}}}}}},.,))}|||||||{.((((((...)))))}....}}},,,...||((|...,))))}}}}}}}|}}|||.((((({|.,,,..................}))))))..,,,.,|{{{{{{{,|||},||(((.((((....)))).)))..,,,|||,,.,}}))))),.............))))))....)))).....))))...}}}{(((((((((.((.{,...(((((((((....(((........)))...))}}))))))((.((((.....((((...........)))),....)))).))..((((.(((..((((,........,.))))..))).))))......{{{{....,,{|||}.{(((((....(((((((....,.......,}.,....)))))))...)))))},,.,,,,}),.....,},.)).)))))))}})).,)))))).)))))))........,,)))))}}.))..))))).))))))))).,)}(((((({,,{{....}}|||,{{{..{(((({((({{{(,,,,,,,,...)))),)))),.,..(((((......))))).,.......})))).))}.,,,|||,...,...,,...((((((...(((.((({....}))))))..)))))),{|....))),})))))).)))))..)))))..))))...(((((.....))))).......{{{(,,,,,,.,}}),}}}},...))))).
Back