Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001130925.2
Sequence Length
2794 nt
GC Content
0.4807
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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-804.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -851.62
Frequency: 0.0000
Diversity: 465.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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