Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001136125.3

Sequence Length

1810 nt

GC Content

0.5972

GUCAGGGAAGCGGCGCGCGCGCGCGGGCGGCGGGCGGGCUGGGGAUCCGCCGCGCAGUGCCAGCGCCAGCGCCAGACCCGCGCCCCGCGCUCUCCGGCCCGUCGCCUGCCUUGGGACUCGCGAGCCCGCACUCCCGCCCUGCCUGUUCGCUGCCCGAGUAUGGAGCUGCUGUGUUGCGAAGGCACCCGGCACGCGCCCCGGGCCGGGCCGGACCCGCGGCUGCUGGGGGACCAGCGUGUCCUGCAGAGCCUGCUCCGCCUGGAGGAGCGCUACGUACCCCGCGCCUCCUACUUCCAGUGCGUGCAGCGGGAGAUCAAGCCGCACAUGCGGAAGAUGCUGGCUUACUGGAUGCUGGAGGACUGGGAGGUGCUGGUCCUAGGGAAGCUCAAGUGGGACCUGGCUGCUGUGAUUGCACAUGAUUUCCUGGCCUUCAUUCUGCACCGGCUCUCUCUGCCCCGUGACCGACAGGCCUUGGUCAAAAAGCAUGCCCAGACCUUUUUGGCCCUCUGUGCUACAGAUUAUACCUUUGCCAUGUACCCGCCAUCCAUGAUCGCCACGGGCAGCAUUGGGGCUGCAGUGCAAGGCCUGGGUGCCUGCUCCAUGUCCGGGGAUGAGCUCACAGAGCUGCUGGCAGGGAUCACUGGCACUGAAGUGGACUGCCUGCGGGCCUGUCAGGAGCAGAUCGAAGCUGCACUCAGGGAGAGCCUCAGGGAAGCCUCUCAGACCAGCUCCAGCCCAGCGCCCAAAGCCCCCCGGGGCUCCAGCAGCCAAGGGCCCAGCCAGACCAGCACUCCUACAGAUGUCACAGCCAUACACCUGUAGCCCUGGAGAGGCCCUCUGGAGUGGCCACUAAGCAGAGGAGGGGCCGCUGCCACCCACCUCCCUGCCUCCAGGAACCACACCACAUCUAAGCCUGAAGGGGCGUCUGUUCCCCCUUCACAAAGCCCAAGGGAUCUGGUCCUACCCAUCCCCGCAGUGUGCACUAAGGGGCCCGGCCAGCCAUGUCUGCAUUUCGGUGGCUAGUCAAGCUCCUCCUCCCUGCAUCUGACCAGCAGCGCCUUUCCCAACUCUAGCUGGGGGUGGGCCAGGCUGAUGGGACAGAAUUGGAUACAUACACCAGCAUUCCUUUUGAACGCCCCCCCCCACCCCUGGGGGCUCUCAUGUUUUCAACUGCCAAAAUGCUCUAGUGCCUUCUAAAGGUGUUGUCCCUUCUAGGGUUAUUGCAUUUGGAUUGGGGUCCCUCUAAAAUUUAAUGCAUGAUAGACACAUAUGAGGGGGAAUAGUCUAGAUGGCUCCUCUCAGUACUUUGGAGGCCCCUAUGUAGUCCGUGCUGACAGCUGCUCCUAGAGGGAGGGGCCUAGGCCUCAGCCAGAGAAGCUAUAAAUUCCUCUUUGCUUUGCUUUCUGCUCAGCUUCUCCUGUGUGAUUGACAGCUUUGCUGCUGAAGGCUCAUUUUAAUUUAUUAAUUGCUUUGAGCACAACUUUAAGAGGACAUAAUGGGGUCCUGGCCAUCCCACAAGUGGUGGUAACCCUGGUGGUUGCUGUUUUCCUCCCUUCUGCUACUGGCAAAAGGAUCUUUGUGGCCAAGGAGCUGCUAUAGCCUGGGGUGGGGUCAUGCCCUCCUCUCCCAUUGUCCCUCUGCCCCAUCCUCCAGCAGGGAAAAUGCAGCAGGGAUGCCCUGGAGGUGGCUGAGCCCCUGUCUAGAGAGGGAGGCAAGCCCUGUUGACACAGGUCUUUCCUAAGGCUGCAAGGUUUAGGCUGGUGGCCCAGGACCAUCAUCCUACUGUAAUAAAGAUGAUUGUGAAAUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-734.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -764.50

Frequency: 0.0000

Diversity: 673.58

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((((((.(.((.((..(((((.(((((.((((((((((((.(...(((......)))....).))))).)).).))))))))))))))..(((((((((..(((((.((((((.(..((((((..(((.........)))..)))))).)))))))...((.(((((((.(.(((....))).)))))).)).)).))))))))))))))(((((((((.(((.(((((......))))).)))))))(((..(((((((((((((((..........))).))))....))))).))).)))))))).(((..((((((..(((((((....(((((((...(((.((((((((..(((((.((.((((((.((.(((.((((....(((((...((((.((.(((.((((.((((...........))))..))))..((((((((((((((((.(((.(((((((...((((((((((...........)))))))))).(((((...)))))....((((..(((.(((((..(((..(((.....(((...))).....))))))....))))).)))..))))))))).))...)))))))).....((.((((..((((.(((((...(((((........))))).))))).))))..)))).))..((((.......))))...)))))))))))))).)).)))))))))....))))....))))).)))...))))))))))..)))))))).))).((((((....((....(((((.((((((.(((.........))).)))))).(((((((.((((((....)).)))).....((((.((((((((....))).....))))))))))))))))....................((((((((.(......)))))))))....((....(((((..(((...))).))))).)))))))...))...)))))))))))))....)))))))....)))))).)))..)).)).).))))))(((((((((.((((((((..((((..(((((((.((((.(.((((.(((.....((.(((..(((((.((((......((.(((.....))).))...((((((....)))))).....)))).)))))))))).....))).....((((((...(((.((.((((((.((((((((((((((((((...(((((((((((((........((((..((.(((((((...(((((....((((.....))))((((.(((....)))))))))))))))).))).))..)).))........))))))).(((((....))))).(((((.((..((((....(((((((.(((..((.....))..))).....((((.......))))..(((.((((.(((((...................))))).)))))))....)))))))....))))..))))))).))))))))))).)))))))))))))..(((((.(((((((..((((.((((...)))).)))).((((((....)))))).(((((..((..((((((((((.((................)).))))..))))))..))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).).)))).).)))))).)))))))(((.(((((....))))).))).......)))))..))))((((.(((((((....).)))))).)))).........)))))..............

Thermodynamic Ensemble Prediction

,{({((({,(,((((({,({(((.(((({(((((((((((((,(...{((,{{{,.|,}|..|),)}})),)}.}.)))))))}}))))).}{{{((({{{..{(({{.{{((((.{..((((((..(({.........)))..)))))).))))))}...((.(((((((.(,(((....)))||})))}.}}.|},}))))))))))))}(((((((((.(((.(((((......))))).)))))))(((..(((((((((((((((..........)))}}))),...})))).))).))))))))..,,....((((....))))..,,{(((((,,..,{(({{(({((((,.{(((({(((((((((({{,{({...||,...|||||||,(({({((({({.,((||{,{,...,.,||,..}}}}..|}}}..((((((((((((((((.(((.(((((((...((((((((((...........)))))))))).(((((...)))))....((((..(((.(((((..(({.,({{{{.|.(((...))),|}},,))))).),.))))).)))..))))))))).))...))))))))...||{{{.,|)))}|(({{(((({.{{((((........})))|.,},))|))|)||||,|,,||,((((.......)))).,,)}))}))})))}))})}},)))}))))).}))))))),},)))))},},..,||||}}}}))))}})))))))),.))|))|,,}..})))))))))}||||{{.{((.{{{{,,.,|,|,||||||,({(((((,((((((.,,,||,|||}.....((((.((((((((....}}}..,..)))))))))}}})))).................,..((((((((.(......)))))))))....||....(((({.,(({...,}),))))).|{{|}}}},....,{||||..|||,|||{{{.,,,,,.....,)))))).)))..)))))))}))},,)}}||||,|||||{|||||||||||..((({.{{|{|||,{||||{.{||,,.,||{.|||,.,((({.{{{,...,,|{,.,||....{|{..{|{{{(,,,,,....,)))))}..,,},}}.,,}},}}}||..,,,||,.,,,,(((({...|}}}}|,|,{{|{{{{{{||{{,..,|{{|||{{{({((((..((((({{{......,,...,.,.....,.,.{{(((((....{(((.....))))}))}}}},...})))))))})))},,,}}}))}}|||||.,,},,}}|}}}))}))),{{|||,,.,|)}}}|||{||||{,,(({{....({({{{{.(({..((.....))..)))..,..{{{{.......}})),.,{{.{|||}{{{((,,,...{{{,,....}},,)}},),)))}},.....}}}})}}.,,.||||({((((((((((,((((.((.(((....))))).))))..{{{{{{{,{{{{((((.((((...}))).}))).{{{{{{,,,,)))))){{{|,..)))){{(((,.((((({{.{||,.||||{,,,,.||{{{((((((....{{{{......))))....)))).))))))}....))))).)))))),))))..})))),))))))))}}}))(((((....))))).}}},||,{,|}||}}.,)})})))),}}})))}}}}})))}((((((.,...........)))))}..,,........