Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001136177.3

Sequence Length

2796 nt

GC Content

0.5168

AACUGAGCGAGGAGCAAUUGAUUAAUAGCUCGGCGAGGGGACUCACUGACUGUUAUAAUAACACUACACCAGCAACUCCUGGCUUCCCAGCAGCCGGAACACAGACAGGAGAGAGUAGCGAGGGAGUUGGGUCUCCAGGUUGUGCGAGGAGCAAAUGAUGACCGCCAAGGCCGUAGACAAAAUCCCAGUAACUCUCAGUGGUUUUGUGCACCAGCUGUCUGACAACAUCUACCCGGUGGAGGACCUCGCCGCCACGUCGGUGACCAUCUUUCCCAAUGCCGAACUGGGAGGCCCCUUUGACCAGAUGAACGGAGUGGCCGGAGAUGGCAUGAUCAACAUUGACAUGACUGGAGAGAAGAGGUCGUUGGAUCUCCCAUAUCCCAGCAGCUUUGCUCCCGUCUCUGCACCUAGAAACCAGACCUUCACUUACAUGGGCAAGUUCUCCAUUGACCCUCAGUACCCUGGUGCCAGCUGCUACCCAGAAGGCAUAAUCAAUAUUGUGAGUGCAGGCAUCUUGCAAGGGGUCACUUCCCCAGCUUCAACCACAGCCUCAUCCAGCGUCACCUCUGCCUCCCCCAACCCACUGGCCACAGGACCCCUGGGUGUGUGCACCAUGUCCCAGACCCAGCCUGACCUGGACCACCUGUACUCUCCGCCACCGCCUCCUCCUCCUUAUUCUGGCUGUGCAGGAGACCUCUACCAGGACCCUUCUGCGUUCCUGUCAGCAGCCACCACCUCCACCUCUUCCUCUCUGGCCUACCCACCACCUCCUUCCUAUCCAUCCCCCAAGCCAGCCACGGACCCAGGUCUCUUCCCAAUGAUCCCAGACUAUCCUGGAUUCUUUCCAUCUCAGUGCCAGAGAGACCUACAUGGUACAGCUGGCCCAGACCGUAAGCCCUUUCCCUGCCCACUGGACACCCUGCGGGUGCCCCCUCCACUCACUCCACUCUCUACAAUCCGUAACUUUACCCUGGGGGGCCCCAGUGCUGGGGUGACCGGACCAGGGGCCAGUGGAGGCAGCGAGGGACCCCGGCUGCCUGGUAGCAGCUCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCUAUAACCCACACCACCUGCCACUGCGGCCCAUUCUGAGGCCUCGCAAGUACCCCAACAGACCCAGCAAGACGCCGGUGCACGAGAGGCCCUACCCGUGCCCAGCAGAAGGCUGCGACCGGCGGUUCUCCCGCUCUGACGAGCUGACACGGCACAUCCGAAUCCACACUGGGCAUAAGCCCUUCCAGUGUCGGAUCUGCAUGCGCAACUUCAGCCGCAGUGACCACCUCACCACCCAUAUCCGCACCCACACCGGUGAGAAGCCCUUCGCCUGUGACUACUGUGGCCGAAAGUUUGCCCGGAGUGAUGAGAGGAAGCGCCACACCAAGAUCCACCUGAGACAGAAAGAGCGGAAAAGCAGUGCCCCCUCUGCAUCGGUGCCAGCCCCCUCUACAGCCUCCUGCUCUGGGGGCGUGCAGCCUGGGGGUACCCUGUGCAGCAGUAACAGCAGCAGUCUUGGCGGAGGGCCGCUCGCCCCUUGCUCCUCUCGGACCCGGACACCUUGAGAUGAGACUCAGGCUGAUACACCAGCUCCCAAAGGUCCCGGAGGCCCUUUGUCCACUGGAGCUGCACAACAAACACUACCACCCUUUCCUGUCCCUCUCUCCCUUUGUUGGGCAAAGGGCUUUGGUGGAGCUAGCACUGCCCCCUUUCCACCUAGAAGCAGGUUCUUCCUAAAACUUAGCCCAUUCUAGUCUCUCUUAGGUGAGUUGACUAUCAACCCAAGGCAAAGGGGAGGCUCAGAAGGAGGUGGUGUGGGGACCCCUGGCCAAGAGGGCUGAGGUCUGACCCUGCUUUAAAGGGUUGUUUGACUAGGUUUUGCUACCCCACUUCCCCUUAUUUUGACCCAUCACAGGUUUUUGACCCUGGAUGUCAGAGUUGAUCUAAGACGUUUUCUACAAUAGGUUGGGAGAUGCUGAUCCCUUCAAGUGGGGACAGCAAAAAGACAAGCAAAACUGAUGUGCACUUUAUGGCUUGGGACUGAUUUGGGGGACAUUGUACAGUGAGUGAAGUAUAGCCUUUAUGCCACACUCUGUGGCCCUAAAAUGGUGAAUCAGAGCAUAUCUAGUUGUCUCAACCCUUGAAGCAAUAUGUAUUAUAAACUCAGAGAACAGAAGUGCAAUGUGAUGGGAGGAACAUAGCAAUAUCUGCUCCUUUUCGAGUUGUUUGAGAAAUGUAGGCUAUUUUUUCAGUGUAUAUCCACUCAGAUUUUGUGUAUUUUUGAUGUACACUGUUCUCUAAAUUCUGAAUCUUUGGGAAAAAAUGUAAAGCAUUUAUGAUCUCAGAGGUUAACUUAUUUAAGGGGGAUGUACAUAUAUUCUCUGAAACUAGGAUGCAUGCAAUUGUGUUGGAAGUGUCCUUGGUGCCUUGUGUGAUGUAGACAAUGUUACAAGGUCUGCAUGUAAAUGGGUUGCCUUAUUAUGGAGAAAAAAAAUCACUCCCUGAGUUUAGUAUGGCUGUAUAUUUCUGCCUAUUAAUAUUUGGAAUUUUUUUUAGAAAGUAUAUUUUUGUAUGCUUUGUUUUGUGACUUAAAAGUGUUACCUUUGUAGUCAAAUUUCAGAUAAGAAUGUACAUAAUGUUACCGGAGCUGAUUUGUUUGGUCAUUAGCUCUUAAUAGUUGUGAAAAAAUAAAUCUAUUCUAACGCAAAACCACUAACUGAAGUUCAGAUAAUGGAUGGUUUGUGACUAUAGUGUAAAUAAAUACUUUUCAACAAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-943.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -990.87

Frequency: 0.0000

Diversity: 506.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....(((((.(((((((.........((((((((((((...(((((((..(((((...))))).....((((......)))).....(((((((.((..(((((((....((((((.((..((((.((..((((...((((..(((.(..((....).)..))))...))))..))))..)))))).)).))))))....).))))))..)).)))).)))............)))).)))..)))))))).(((....))).((((((((((((.........)))))((((.(((((..(....)..))))).)))).)))))))((((.(((....))))))).((((.((...((((((....)))))).....)))))).))))))))))))).)))(((((.(((((((((...((((((((((.((.((((((((((((.......(((((.(((.((((...((((((((.(((((((((((((....))))))((((((((..........((((......)))).(((........)))....(((((.(((((((..(((..............)))...)))....((((((.((.(((...)))..)).))))))..)))))))))...))))))))((((..(((.(((................))).)))..)))).(((.....)))..))))))).)).......))))))...))))...(((((.((((((.(((((..(((((((((((((((....((.(((((...(((......((((....)))).........((..((((......))))..))....((.((((.(...((((((((......((((..((((((((..((((.((((((((((((.(((((((((.(((((...)))))((((.(((..((((((((.....(((.....)))........(((((....)))))...))))))))..)))...)))))))))))(((.((.(((((((...((.....((((((((((((..(((.(((.(.((..(((((((.(((.((((..............((((...((.(((.......(.((((((....(((((......................)))))....))))))).......))))))))).)))).)))..))))))).)).).))))))..)))))).....(((.((((((.....((((((((....))))....)))))))))).)))..(((.((((((.(((((((((..(((((((((.....................))))))..((.....))..)))..))))))))).).))))))))((((.((..((((((((.(((...........(((.((.(((((.......((......)).((((((((.((((((........((((((....(((....)))....))))))))))))...))))))))....(((.((.......)).)))))))))).)))((((.....))))..))))))))))).)))))).((.((((((......)))))).))......(((((((((((((.((....)).))))))......)))))))...........))))))......)).))))))).)).)))..)).))).))))))))))))))).))))))..))))...........((((((((((((........))))).))...)))))))))))))..).)))).)).............)))...)))))))....))))))))))))).))........)))))))))))..)))))..((((((.......))))))(((((.((...(((((((.((((((((......((((((((..(((.((((........))))))))))))))).((((..((.(((((((((........))))))))))))))).....))))))))..))))))))).)))))...((....))((........))..))))))))..)))))))).)))).)))))))))))).(((((((.(((((((((...))))))((......))...((((.(((((.(((.(((.(((.......(((.(((...))).))).......))).)))))).))))..).))))(((((.(..(((....))).).)))))((((((.....)))))).))).))))))).....((((((((((((((.........))).......)))))))))))((((((((((....(((((((((((..((((((...))))))....))))))))))).....)))).))))))((((((((...((.((((((((((((((((.(.((((...)))).).)))))).))))((((((((...............))))))))((.((((.....((....))....)))).))(((((((((...(((..((..((((((.(((...........)))))))))..)).))))))))))))..(((((((((....)))))))))......(((((..((((......))))..)))))...)))))).))..))))))))..(((....((((..(((((((((..((((.((((......))))))))..)))))))))..))))...)))...(((.((.((((...)))).)).))).))))))....)))..))))).....................

Thermodynamic Ensemble Prediction

...{(((.((((((((...,......,{.,((((((({...((({{((..{((({...})))}.....((((......)))).....(((((((.((..(((((((....((((((.((..((((.{(..((((...((((,.(((.(..,{....,.}..)))),,.}))),.))))..},)))).)).))))))..,.)}))))))..)).)))).)))............})))}}})..)))))))).(({....))).((((((((((((.,.....,.)))))((((.(((((..{....}..))))).)))).)))))))((((.(((....))))))).((((.((...((((((....)))))).....))))))..(({{(,(((((((({((({{{,,,,....,,...((((((((((.((.((((((((((((..,,...(((((.(((,((((...((((((((.(((((((((((((....)))))),(((((((.....,}}..((((......)))).(((........)))....(((((.(((((((.,(((..............))}.,.)))....((((((.((.(({...,))..)).))))))..)))))))))...}))))))|((((..(((.(((................))).)))..))))}{{{.....)))..))))))).)).......)))))),,,)),,...(((((.{(((((.(((((..(((((((((((((((....((.(((((...(((......((({...,||||,,.......((..((((......))))..)}....,,..,,,.||,,{((((({|,.....((((..((((((((,.{(((.((((((((((((.(((((((((.({(((,,.}|||}{((({(((,.((((((({.....,{,.....|||......,.(((((,.,.}}})).}.})))))}),,))}.,,)))))))))))(((.((.(((((((...((..{..((((((((((((..(((.(((.(.(({{((((,{(.(((.((((..............{{({..,((,(((.,.....{.((((((.{..(((((............,,.....},.)))))..|.))))))}.....}.))))})))).)))).)))..))))))),)).,.))))))..))))))..,..(((.((((({....{((((((((....)))}...,)))))))))).))).,|.((((((((.(((((((((..(((((((((.....................))))))..({.....))..)))..))))))))).)})}))))))((((.((..(((((((,,(({.,...{{{{{{{{{.,({{.,,{,,..,,.((......}}.((((((((.((((((........((((((....(((....)))....))))))))))))...)))))))).,{{(((.({.,...,.)).}}}))))))).)|,((((.....))))..})))))))))).)))))).{(.((((((......)))))).))......(((((((((((((.((....)).))))))......)))))))...........))))))..}...)).))))))).)).)))..)}.))).))))))))))))))).))))))..))))..........,((((((((((((........})))).))...)))))))))))))..)})|,(((({...}))))....)))...)))))))....))))))))))))).)),.......)))))))))))..)))))..{(((((.......)))))|(((((.((...(((((((.((((((((......((((((({.,(((.((((........))))))))))))))).((((..((.(((((((((,.....,.))))))))))))))).....))))))))..))))))))).)))))}..{{....}}((.,.....}))..)))))))),.)))))))).)))).))))))))))))....,,,{,{{.((((({...}))))).,,,,...))},...||,}((((.(((.(((.(((.......(((.(({...})).))).......))).)))))).))))..,,.)))))))).}}...)))...,..))))))))}))},{{(({{{(((({,{{{{,{{{{{.....((((((((((((((.........}}).......))))))))))),(((((((((....(((((((((((..((((((...))))))....))))))))))).....))))},))))}((((((((...((.((((((((((((((((.(.((((...)))).).))))))},))}((((((({..{(({...,.,},,))))))))((.((((.....((,...)),,..}))).)){((((((((...(((..((..((((((.(((.,.......,.)))))))))..)).)))))))))))),.(((((((((....))))))))).,....(((((..((((......))))..)))))...)))))).}}..))))))))...,,....((((..(((((((((..((({{((((......))))))))..)))))))))..))))..((({{{{((((((.((((...))))....))).)))))))))...,,}||||,.....,}},)))))))))}}.