Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001136541.2

Sequence Length

2741 nt

GC Content

0.5144

AUUAUACAGACGCAUAACUGGAGGUGGGAUCCACACAGCUCAGAACAGCUGGAUCUUGCUCAGUCUCUGCCAGGGGAAGAUUCCUUGGAGGAGGCCCUGCAGCGACAUGGAGGGAGCUGCUUUGCUGAGAGUCUCUGUCCUCUGCAUCUGGGUGCAACAAAACGUUCCAAGUGGGACAGAUACUGGAGAUCCUCAAAGUAAGCCCCUCGGUGACUGGGCUGCUGGCACCAUGGACCCAGAGAGCAGUAUCUUUAUUGAGGAUGCCAUUAAGUAUUUCAAGGAAAAAGUGAGCACACAGAAUCUGCUACUCCUGCUGACUGAUAAUGAGGCCUGGAACGGAUUCGUGGCUGCUGCUGAACUGCCCAGGAAUGAGGCAGAUGAGCUCCGUAAAGCUCUGGACAACCUUGCAAGACAAAUGAUCAUGAAAGACAAAAACUGGCACGAUAAAGGCCAGCAGUACAGAAACUGGUUUCUGAAAGAGUUUCCUCGGUUGAAAAGUGAGCUUGAGGAUAACAUAAGAAGGCUCCGUGCCCUUGCAGAUGGGGUUCAGAAGGUCCACAAAGGCACCACCAUCGCCAAUGUGGUGUCUGGCUCUCUCAGCAUUUCCUCUGGCAUCCUGACCCUCGUCGGCAUGGGUCUGGCACCCUUCACAGAGGGAGGCAGCCUUGUACUCUUGGAACCUGGGAUGGAGUUGGGAAUCACAGCCGCUUUGACCGGGAUUACCAGCAGUACCAUGGACUACGGAAAGAAGUGGUGGACACAAGCCCAAGCCCACGACCUGGUCAUCAAAAGCCUUGACAAAUUGAAGGAGGUGAGGGAGUUUUUGGGUGAGAACAUAUCCAACUUUCUUUCCUUAGCUGGCAAUACUUACCAACUCACACGAGGCAUUGGGAAGGACAUCCGUGCCCUCAGACGAGCCAGAGCCAAUCUUCAGUCAGUACCGCAUGCCUCAGCCUCACGCCCCCGGGUCACUGAGCCAAUCUCAGCUGAAAGCGGUGAACAGGUGGAGAGGGUUAAUGAACCCAGCAUCCUGGAAAUGAGCAGAGGAGUCAAGCUCACGGAUGUGGCCCCUGUAAGCUUCUUUCUUGUGCUGGAUGUAGUCUACCUCGUGUACGAAUCAAAGCACUUACAUGAGGGGGCAAAGUCAGAGACAGCUGAGGAGCUGAAGAAGGUGGCUCAGGAGCUGGAGGAGAAGCUAAACAUUCUCAACAAUAAUUAUAAGAUUCUGCAGGCGGACCAAGAACUGUGACCACAGGGCAGGGCAGCCACCAGGAGAGAUAUGCCUGGCAGGGGCCAGGACAAAAUGCAAACUUUUUUUUUUUUCUGAGACAGAGUCUUGCUCUGUCGCCAAGUUGGAGUGCAAUGGUGCGAUCUCAGCUCACUGCAAGCUCUGCCUCCCGUGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUUGGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUACAGGCGCCUACCACCAUGCCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAAUAGAGAUGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCCUGACCUCUUGAUCUGCCCACCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCAUCGCUUUUGACCCAAAUGCAAACAUUUUAUUAGGGGGAUAAAGAGGGUGAGGUAAAGUUUAUGGAACUGAGUGUUAGGGACUUUGGCAUUUCCAUAGCUGAGCACAGCAGGGGAGGGGUUAAUGCAGAUGGCAGUGCAGCAAGGAGAAGGCAGGAACAUUGGAGCCUGCAAUAAGGGAAAAAUGGGAACUGGAGAGUGUGGGGAAUGGGAAGAAGCAGUUUACUUUAGACUAAAGAAUAUAUUGGGGGGCCGGGUGUAGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCGAGCACUUUGGGAGGCCAAGGCGGGCGGAUCACGAGGUCAGGAGAUCGAGACCAUCCUGGCUAACACAGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAAUUAGCCGGGCAUGGUGGCGGGCGCCUGUAGUUCCAGCUAACUGGGCGGCUGAGGCAGGAGAAUGGCGUGAACCUGGGAGGUGGAGCUUGCAGUGAGCCGAGAUAUCGCCACUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGCGAGACUCCAUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAUAUAUUGACGGAAGAAUAGAGAGGAGGCUUGAAGGAACCAGCAAUGAGAAGGCCAGGAAAAGAAAGAGCUGAAAAUGGAGAAAGCCCAAGAGUUAGAACAGUUGGAUACAGGAGAAGAAACAGCGGCUCCACUACAGACCCAGCCCCAGGUUCAAUGUCCUCCGAAGAAUGAAGUCUUUCCCUGGUGAUGGUCCCCUGCCCUGUCUUUCCAGCAUCCACUCUCCCUUGUCCUCCUGGGGGCAUAUCUCAGUCAGGCAGCGGCUUCCUGAUGAUGGUCAUUGGGGUGGUUGUCAUGUGAUGGGUCCCCUCCAGGUUACUAAAGGGUGCAUGUCCCCUGCUUGAACACUGAAGGGCAGGUGGUGGGCCAUGGCCAUGGUCCCCAGCUGAGGAGCAGGUGUCCCUGAGAACCCAAACUUCCCAGAGAGUAUGUGAGAACCAACCAAUGAAAACAGUCCCAUCGCUCUUACCCGGUAAGUAAACAGUCAGAAAAUUAGCAUGAAAGCAGUUUAGCAUUGGGAGGAAGCUCAGAUCUCUAGAGCUGUCUUGUCGCCGCCCAGGAUUGACCUGUGUGUAAGUCCCAAUAAACUCACCUACUCAUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1196.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1239.12

Frequency: 0.0000

Diversity: 636.95

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......(((........)))(((.((((((.(((((((.((((.....((((....(((...((((((.((((((((...)))))))).))))))...)))((((((.(((((..(((((((.(((((((.....((((((((((.(((((((.((.......(((((....)))))...((((.(((...)))..))))........((((.((((....)))))))).)).)))))))..))))...........(((((((((............((((((.(((.(((.(((.(((((((....(((.(((..(.......).)))..))).))))))))))))))))(((((.(((((((....)).)))))..(((((......)))))(((((..(((((((((.....((.((......))))....(((((.(......)))))).....((((((....)))))).....((((((((((((........))).)))))).))).......(((.....))))))))))..)).)))))((.((((.....(((((((((..........))))))))))))).))))))).)))))).)))))))))((((.((((.(((.((((((((.(.(((((....))))).).)))((..(((((.(((((((((((...(((((.((.........)))))))..))))).)).)))).)))))...))(((((........)))))........))))).))).))))...)))).((..((((((((...........((((.((((((((...((((((......)))))))))))))).))))((.(((.........))).))....)))))).))..))))))))...(((((((((((((((...((((((.(((((..(((((........((((((((((.((((((((..((((((((.....))))).)))...))).)....))))))).(((((....))))).((((((........((((.(((((..(((((.((((.........)))).)))))..))))).)))))))))).((((.(((((((((.(..........).)))))))))))))...(((...))).))))))).))))).))))))))))).(((((((((((((((........)))))....................((((............))))....(((((((((((.(.((((((((((((((.((((((((....)))))).))..........((((((((((((.(((((..((((((((((((((((((..(((((((((((.(((((..(((((.((((((((((((((((((((((((.(((((.((.(((((((((((((((((.((((..(((((((((((((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((.((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((((..((((..(.(..(((((((.((((.................(.((((((((....(((.....)))..)))))))).).(((((...((((....))))...)))))......((((........))))...........(((((..(....)..)))))...................)))))))))))..).).)))).))))))((((((...))))))......((((((.((...)).)))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).)))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))))))))).))))))))).)))))))))).))))))))))).)))))))))))))))))))))..)))).))))))))))))))))).)).))))).)))))))))))))))))))))))).)))))..))))).)))))))))))...))))))))))))))))))..))))).))))))))))))........((((........))))....(((((.......(((((.....((.(..(((..((..........(((............)))((((..((....))..)))).....((((..(......)..))))........))..))))))))))).....)))))..........)))))).)))))))..).).)))))))))))..))))))).))).......))))))....))))))))).))))))).)))))))..)))))....((((((((((((..(((((.((((((..(((((.((((.((((((.....((((........)))).....))).))).))))(((.(((.(((((((....)))))))))).))).....((((....))))...))))).((((......)))))))))).))))).)))))))........)))))..((((.((((((...(((((..(((...........))).....)))))..))))))))))(((((((....)).)))))....))))))...))))..)))).)))))))...)))))).....))).............

Thermodynamic Ensemble Prediction

......(((........}}}{(((((((((.(((((((.((({...{{({{{....,|||..((((((.((((((((...}))))))).)))))),,,||,((((((.(((((,.(((((((.(((((((({.((((((({,,{{,{,((((,((........|||||}.}})))))}}}.|||{({{.,,}}}..|||,.{{{|,||{|||,|{{(|||{|,{|||,,.|||,,,}}||{{|||{..{{{,,.{{{(((((((,.....,,,,,,,,|{{|,..,((,{{{.|||.||,,|||}}.}||{{((({{({{{..{{..|||{{||..||},|||||||,|{|{(((({.(((((((....)).)))))..(((((......))))}{(({{..|{(({((((......,.{{......},,.....(((((.(......)))))),,,,.{{{{,|,,,.,}}}}}.....(({(((((((((........))),,))))).})).....,{(((,.,,.||||}|||}|,,||{|}||||,.{{|({|...(((((((((.,,.....,})))))))))}|||,,.||}))..,,,||.}))}}}})}||{|}||||,{||,{||||,|||(.{((((,...))))).}})})||,|{{{{|,||{{{{(((((..,(((({{((.........))))))),.))))).}}.}))),)))))}),))|((({{{,,,,,,|||||,....,..|||||,|||,}|}|{{,}}|||,,,....{{{|,|.....},}}}}|||}|||||{||..}|||||,......}}})))})))))))})),}}}.{((......,,.))}.,||....||||{{|,,{{{.,,...)))}}}|||||,,.|}||}}}|,|||.}|,,||}}|}}}},,,},.},||||||||||.,((((((({{((((((((.....))))).))}...,||.|.{{{{{,{|||{(((((....))))).((((((.,....{{(((,,(,,,.,,.,|||}||||}}}}{{{{{|{,,.||||{{{|,,||{|,||||||,,.((((.(((((((((.{..........,.)))))))))))))...|}},,.,))}),,)))))))),,.,,))),)))),.((((((((({(((((........)))))........,,....{.{{{{{{{(,....,,.,},,))))},..(((((((((((.,,{(((((((((((((.{(((((((....)))))).)}.........,((((((((((((.(((((..((((((((((((((((((,.(((((((((((.(((((..(((((.((((((((((((((((((((((((.(((((.((.(((((((((((((((((.((((.,(((((((((((((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((.((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((((..((((..{.(..(((((((.{({{.................(.((((((((....{((.....}))..}))))))).).{((((.,.((({..,.|}||...}}},..,,,..{{|,....}}.,))))}}.........{((({..(.,,.}..})))).....,,.....,,,....))),)))))))..).,.)))).))))))((((({...))))))......((((((.((...)).)))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).)))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).))))))))))).))))))))))))))))))))).,)))).))))))))))))))))).)).))))).)))))))))))))))))))))))).)))))..))))).))))))))))).}.))))))))))))))))))..))))).}))))))))))),,,,....,,{{..,,,,.,|||,,,,.(({((({.,..,{,,((.,,..,.....||{,.,,..........{||,....,|,.....,,((((..((....))..)))).....((((..(......)..))))........,},})))}).,,)))..,,})}))),.........)))))))))))))).,),).)))))))))))..))))))).)))..})))))))))}}.})))))))),..,)))))).))))))).,))))),{,{((((((((((((..(((((.((((((,.(((((,((((.((((((.....((((........)))).....))).))).))))(((.(((.(((((((....)))))))))).)))..,..((((....)))).,.})))}.,{({,.....}}}))))))).))))).)))))))........)))))}.{{{{.((((((...(((((.,({{...........))}..,}.)))))..))))))}))}(((((((....)).))))).,},)))))).}}})))}.,))).)))))))...))))),.......,,}}}.........