Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001142464.3
Sequence Length
1498 nt
GC Content
0.6182
CUCUGGGCCAAUAUGGCAGCGCCCAGCAACAAGACAGAGCUGGCCUGGAGUCCGCGGCUGGCCGCGUGAGUAGGUGAUUGUCUGACAAGCAGAGGCAUGAGCUGGGUCCAGGCCACCCUACUGGCCCGAGGCCUCUGUAGGGCCUGGGGAGGCACCUGCGGGGCCGCCCUCACAGGAACCUCCAUCUCUCAGGUCCCUCGCCGGCUCCCUCGGGGCCUCCACUGCAGCGCAGCUGCCCAUAGCUCUGAACAGUCCCUGGUUCCCAGCCCACCGGAACCCCGGCAGAGGCCCACCAAGGCUCUGGUGCCCUUUGAGGACCUGUUUGGGCAGGCGCCUGGUGGGGAACGGGACAAGGCGAGCUUCCUGCAGACGGUGCAGAAAUUUGCGGAGCACAGCGUGCGUAAGCGGGGCCACAUUGACUUCAUCUACCUGGCCCUGCGCAAGAUGCGGGAGUAUGGUGUCGAGCGGGACCUGGCUGUGUACAACCAGCUGCUCAACAUCUUCCCCAAGGAGGUCUUCCGGCCUCGCAACAUCAUCCAGCGCAUCUUCGUCCACUACCCUCGGCAGCAGGAGUGUGGGAUUGCUGUCCUGGAGCAGAUGGAGAACCACGGUGUGAUGCCCAACAAGGAGACGGAGUUCCUGCUGAUUCAGAUCUUUGGACGCAAAAGCUACCCCAUGCUCAAGUUGGUGCGCCUGAAGCUGUGGUUCCCUCGAUUCAUGAACGUCAACCCCUUCCCAGUGCCCCGGGACCUGCCCCAGGACCCUGUGGAGCUGGCCAUGUUUGGCCUGCGGCACAUGGAGCCUGACCUUAGUGCCAGGGUCACCAUCUACCAGGUUCCUUUGCCCAAAGACUCAACAGGUGCAGCAGAUCCCCCCCAGCCCCACAUCGUAGGAAGUGGAAGAGACGCCGGAGGAGUGGAACCUCUACUACCCGAUGCAGCUGGACCUGGAGUAUGUGAGGAGUGGCUGGGACAACUACGAGUUUGACAUCAAUGAAGUGGAGGAAGGCCCUGUCUUCGCCAUGUGCAUGGCGGGUGCUCAUGACCAGGCGACGAUGGCUAAGUGGAUCCAGGGCCUGCAGGAGACCAACCCAACCCUGGCCCAGAUCCCCGUGGUCUUCCGCCUCGCCGGGUCCACCCGGGAGCUCCAGACAUCCUCUGCAGGGCUGGAGGAGCCGCCCCUGCCCGAGGACCACCAGGAAGAAGACGACAACCUGCAGCGACAGCAGCAGGGCCAGAGCUAGUCUGAGCCGGCGCGAGGGCACGGGCUGUGGCCCGAGGAGGCGGUGGACUGAAGGCAUGAGAUGCCCUUUGAGUGUACAGCAAAUCAAUGUUUUCCUGCUUGGGGCUCUCUUCCCUCAUCUCUAGCAGUAUGGCAUCCCCUCCCCAGGAUCUCGGGCUGCCAGCGAUGGGCAGGCGAGACCCCUCCAGAAUCUGCAGGCGCCUCUGGUUCUCCGAAUUCAAAUAAAAAGGGGCGGGAGCGCUGUUGGUUGUGCGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-637.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -660.96
Frequency: 0.0000
Diversity: 377.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((.((((((..((((((((((.((..(.((((((...(.(((((...(((((((....))))).)).))))).)))))))((.((.(((((((.....((((((((((((((......)))))...((((.(((((((((((....)))).)))))))))))..(((...)))..(((((((.((....(((((..((((.((((.(((((((((((.(((((.((...((((....(((((.(....(((((..((((((.(((..((((....))))((((((..(((((......))))).))))))(((.(((((....)))))..)))))).)))))))))))....))))))....)))).)).)))))....(((((.(((...)).).)))))(((((((((....((.....))....)))))))))(((...)))(((((...(((((.((((((...((((.((....)).)))))))))).))))))))))...)))))))..))))..(((((((.((((((((((((((....((((((.((.(((((.((.((.(.(.((((((((((((((((.((((..((.((((((((((..(.((((((((...(((..((((((..(((.(.(((((....)))))))))..)))).)).....)))..))))).))).)....))))))))))))..(((........))).......((((........)))).)))).)))))..(((((.((((((((((....)))))((.((((...(((((((((((((......))))))..........)))))))..)))))).)).))).))))).)))))).))))))))).)).((((.((....)).)))).......))))).)))))))).............))))).))))))..))).)).))))))))))))).)))))......((........))...)).)))))))..((((..(((.(((((.((..((((((....)).))))..))))))).)))))))...))))))))).((((((((.((.(((.(((..(((.(((((((...((((((.((((.((((((.(((((....)))))))((((.((((.(((((.((((((.(((.....))).))))))..)))))((....)).............(((((.((....)).)))))((....))..)))))))).)))).)))).))))))))).)))).).))..).))))).))((((((((((..(((..............)))..)).))))))))(((...(((((((.(((.((.((((.((.(((((.(((.((((........)))).))).))))).)).)))))).))).))).))))..)))...))))))))))))))).)).))................)..)).)).)))))))).)))).)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{(.((((((..((((((((((.((..{.{(((((...{.(((((.,.(((((((....))))).}}.})))).}}}}))){{.{{.(((((((.....((((((((((((({.,{{,{,||||...||||.,,|||||(((({{..||||.|||||||||||.,({{...}))..(((((({.{{,,{,(((((..((({{(({{,,((((((((((.(((((.((...((((....(((((.{....(((((..((((((.(((,.((((....)))),,|,||}.(((({.{{{.{|,,|((((,,,,{{,.,||,,..}}))))).}))))))})))))))))))....|)))))....)))).}).)))))....{((({.,((,,.}},),)}}},(((((((((....((.....))....)))))))))(({...}))((({(...(((((.((((((...((((.((....)).)))))))))).)))))}))))...)})}}||..}})}|{(((((((.((((((((((((((....((((((.((.(((((.((.((.(.(.((((((((((((((((.((((..((.((((((((((..{.((((((((...(((..((((((..(((.{.(((({....})))),)))..)))).)).....)))..))))).))).}....))))))))))))..{{{........}}).......((((........)))).)))).)))))},(((((.((((((((((....))))){(.((((.,.(((((((((((((......)))))),.........}))))))..)))))}.)).))).))))).})))))}})))))))).)).((((.((....)).)))).......))))).)))))))).............))))).))))))..))).)).))))))))))))).)))))..|,..,}},,,{....},..}}.)))))))..||||}}||{.{((((,({..{|||||,,,,)).}})}.})))))}}.}})))))...))))))))).(((((((({{{.((,.(({..(((.(((((((...((((({,(((({(((({(.(((((....)))))}}{{({{{({{.(((((.((((((,(((.....))).))))))..))))}{{....)).............(((((.((....)).)))))((,,,,}}..}))))})),)))).))))}))))))))).)))).}.))..}.))))).}}(((((((({{..|||,.,,|...,...,.))}..)),,)))))))(((...(((((((.(((.((.((((.((.(((((.(((.((((........)))).))).))))).)).)))))).))).))).))))..)))..,))))))))))))))).}}.}|,...............),,)).)).)))))))).)))).)).)}
Back