Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001144777.3
Sequence Length
3814 nt
GC Content
0.3812
AGAGCGAGCUAGAGAGCGAGAGCGGUGAGACUCUGCGGACGUCUUCCCGCCCGCCGCGCUCCGCCCCACCCAGCCUCCGCAGCCUCGGGCCGGAUCGCCCGGCGGGGAAGAUGCGCCUCAAGAACCAGAUAAUUAGCACCAUGGAGCCUCAGGUGUCAAAUGGUCCGACAUCCAAUACAAGCAAUGGACCCUCCAGCAACAACAGAAACUGUCCUUCUCCCAUGCAAACAGGGGCAACCACAGAUGACAGCAAAACCAACCUCAUCGUCAACUAUUUACCCCAGAAUAUGACCCAAGAAGAAUUCAGGAGUCUCUUCGGGAGCAUUGGUGAAAUAGAAUCCUGCAAACUUGUGAGAGACAAAAUUACAGGACAGAGUUUAGGGUAUGGAUUUGUUAACUAUAUUGAUCCAAAGGAUGCAGAGAAAGCCAUCAACACUUUAAAUGGACUCAGACUCCAGACCAAAACCAUAAAGGUCUCAUAUGCCCGUCCGAGCUCUGCCUCAAUCAGGGAUGCUAACCUCUAUGUUAGCGGCCUUCCCAAAACCAUGACCCAGAAGGAACUGGAGCAACUUUUCUCGCAAUACGGCCGUAUCAUCACCUCACGAAUCCUGGUUGAUCAAGUCACAGGAGUGUCCAGAGGGGUGGGAUUCAUCCGCUUUGAUAAGAGGAUUGAGGCAGAAGAAGCCAUCAAAGGGCUGAAUGGCCAGAAGCCCAGCGGUGCUACGGAACCGAUUACUGUGAAGUUUGCCAACAACCCCAGCCAGAAGUCCAGCCAGGCCCUGCUCUCCCAGCUCUACCAGUCCCCCAACCGGCGCUACCCAGGUCCACUUCACCACCAGGCUCAGAGGUUCAGGCUGGACAAUUUGCUUAAUAUGGCCUAUGGCGUAAAGAGGUUCUCCCCAAUUACCAUUGAUGGAAUGACAAGCCUUGUGGGAAUGAACAUCCCUGGUCACACAGGAACUGGGUGGUGCAUCUUUGUCUACAACCUGUCCCCCGAUUCCGAUGAGAGUGUCCUCUGGCAGCUCUUUGGCCCCUUUGGAGCAGUGAACAACGUAAAGGUGAUUCGUGACUUCAACACCAACAAGUGCAAGGGAUUCGGCUUUGUCACCAUGACCAACUAUGAUGAGGCGGCCAUGGCCAUCGCCAGCCUCAACGGGUACCGCCUGGGAGACAGAGUGUUGCAAGUUUCCUUUAAAACCAACAAAGCCCACAAGUCCUGAAUUUCCCAUUCUUACUUACUAAAAUAUAUAUAGAAAUAUAUACGAACAAAACACACGCGCGCACACACACACAUACACGAAAGAGAGAGAAACAAACUUUUCAAGGCUUAUAUUCAACCAUGGACUUUAUAAGCCAGUGUUGCCUAAGUAUUAAAACAUUGGAUUAUCCUGAGGUGUACCAGGAAAGGAUUUUAUAAUGCUUAGAAAAAAAGAAAAAAAAAAAACAAAAAAUACCUUUGAUGCAUUGAAUGUUCUUUCAUAGCUGUCGUUGUUGAAUAUAAUAUACAUAGAUAGCGAUGUGCAGGGAUUUUUACCCAGCCAGCUAACUUUACUACCUUCCUUGAAGGUGGAUCUUUUUAAGAUGACCAUUCGCUCAUUUGAAGAAGAAAAACAAAAAACAAAAAAAAUAAUAAAAAUAAAACAAUUUUUACAAAGUAAUGGGAUUCAAAGAAAGGAAAAAAAGAUUUUUCUUUUUUGUCAAAAUAUCGAUCCAAUCAGAUUGGUAAAAACCCCCACACAAAUUAAAGAGGAAUAAUAAAAAUUGCAAAAAUAAAAAAAAACUUUUGCAAAUUUUUUUAUUUUUCCUUCUUUCUUUUAUAUCAUGUGAACUAAAACAGUCUUCUGUUAGGGGAUGGGGGCAAGGGGGAUACCUGAUGACAUUAACAAUUUAAUAACAUUAACAUUGUUGCCAAAGAGGUGGUCUCUUUGCUGAAAAUGGGUUUCAAGAAAAAUCUAUUUUUAUAAAAUAUAAAGAAUUUUUACAAGAGAAUCUGGAUUUGAGAAAAAAAUAUUUUGACUGGCUAAUUUAGGGGAAAUUGACAACUUUGUCGCGUUCAUACUGCACUGGUAACUUUUUAGAGAUCAAGAUGUGUGUUUUAAACUGGAUUCGUAGACUGUUUUUUGAAGGAUGGGCUAUAAACAGAUGAUCUUCAUAUCUUUUCAUAGCAUGUAAUAAUAAUUAAAAAACAAUUAUUAAUUACUAGGGGAAAGGAGUGUUCGUUCUACCCAGGGUACCACAGUUCCCCACAGUCAAAACCCAAAAGCAAGGAGAUGAGUUGAAAGACAGUUUUUCUUUAAGUCAUCAGUAUGGGAUGUCAGCAGAACAAAAAUUAAAAAGAUUAAUUUUCCUUUUGAUCUAAAACUUCCUUAGUUUGAGCAGUAGGUGCUACAAAAUUAUUUACAUAUCUUAGUAUCAUAGUUAAAUGUAAUGUGUUUAGGAGAGGAAAACAAAAGAUACAUUUGCUUUAAAUUCAUUAAGAAAUUUUCAAAUUCACUUUGUAGCCCAUGCUGAUAGAAUUGGGCUGUGUUGGUACAUUUGAAACACUGUUUAUGUUGCUUGAAACACUUAUUUAUUUAAUCGCCGAUGUGAUGAUGCCUAUGGCCGAGAUCAAAUAUAGCUAGAUUGGCUAGACUACUUAUUUGUUUACUUAAACUAUGGGAAGAAGCAUAUUAUUGUGUCAUUCUGUUGUGUGUGUAUGUGUAUAUACAAUAUAAAUAUAUAUAUAUAAAGUUAUUUUUUCUUUGGGUUAAUUUAUUAUAAGUUGUAACACUUGGCUAGUUUUGUUUGUAUAUGUCUUAAAAUGUUUUCUUAUGAUAUUUAAGUGACAGUUAAAGAGGUAUCAAGGUAACUUGUGUAGAACUAUUCUUUGAUAUAUUGUCAUGUUUGUUGUGAAUAUUUUUUCUUACUGCACAGUAGAAAAAUAAAAACAACUGAGUCUUUAUUUUAAUGUAACUCAGAUUGGGGAAAACAAAACAGAGCUAAGGGAACAAAAUGACUGAGGGAGCACUCUCCCACGUCCAGUGCACUGAUCAUUUUAGUAUGUUUGUGCUUUGUACGGUUAUAUAUUUAAAACGAAAACAAAACAAAAAAAUACAAGGGUUCAUGCUCUUCCCUGGGUAAUAGAAACAGUUACUCGCUAUGCAUAAUCUAGUUGAUAGUUAAAUUUGCUAUUGCUUUUCUUGUCUUGUUAUAUAAAAUCUUUUCAAUACAAGUUUAGUCUUAAUGGUAAUAAAACGUUAUGGUUAUUUAUAACUUGUGCUUAUUUUGUGCAUUUUUUCCCAUGCUGAACCCACUAAGUGCAUGUAGACAGGACUGUUGUUUUCACACUGAAAAGGCAAACUUUGUAGUAGUCGUUGUAGUGGUAGACAGAUAACGAAUACCAAGGCUGCAUCAUAGACUCCUCCUUUAAAUUUUUUUUCUGUUUUUUUUUCCUCUUUUCGGUUUUGGAUAUAACACCAGAUUUCAGUUCAGAGAACACUCGUUCAACAUUCAGGGAAAGCUUUUUACGUCACCUGCUAUGAAUGAACGUAGUUUGCUGGCAAAGUUUUGAUGCAUUUGCUAAGCAUUAGUGGGAAAGGCAUGCCAAAAUCUUCUCUAUAAUGUGUUCAAUCUUGGGGGAAAAAAAAAGGAAAAAAAAUCUUAGGACCAGGCAGUUGUAUACUUUAGUUAUUAAUGAAUGACUUCAUGUUAAUCUUGCUAGUUUAGAUGAUUUCCAAGGGAAAGUAUUGUAAAUGUUUUUUUUUCAUAAUCUUGUUGUGUUUGAAUUAUUUGUACUUUAUCUGUCCAGACAAUAAAUGAAAGUGUGUAGAAUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-959.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1040.19
Frequency: 0.0000
Diversity: 1168.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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