Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001159710.2

Sequence Length

1593 nt

GC Content

0.5022

CUUCACAGUGAAAUGUAUUUGACGGGGCUGGGUGCAGUGGCUCAAGCCCGUAAUCCCAACACCUUGAGAGGCUGAGACAGGAGGAUUGCUUGAGUCCAGGAGCUCGAGACCAGCCUGGGCAUAUGCACUGGGCUCAGUUCCUCUCAUUUCCAUCACGGGAUAUGUUGAUAGAGACAUCCAGCUACUCUGUCAGUCCUCGGGCUGGUUCCCCCGGCCCACAGCGAAGUGGAAAGGUCCACAAGGACAGGAUUUGUCCACAGACUCCAGGACAAACAGAGACAUGCAUGGCCUGUUUGAUGUGGAGAUCUCUCUGACCGUCCAAGAGAACGCCGGGAGCAUAUCCUGUUCCAUGCGGCAUGCUCAUCUGAGCCGAGAGGUGGAAUCCAGGGUACAGAUAGGAGAUACCUUUUUCGAGCCUAUAUCGUGGCACCUGGCUACCAAAGUACUGGGAAUACUCUGCUGUGGCCUAUUUUUUGGCAUUGUUGGACUGAAGAUUUUCUUCUCCAAAUUCCAGUGGAAAAUCCAGGCGGAACUGGACUGGAGAAGAAAGCACGGACAGGCAGAAUUGAGAGACGCCCGGAAACACGCAGUGGAGGUGACUCUGGAUCCAGAGACGGCUCACCCGAAGCUCUGCGUUUCUGAUCUGAAAACUGUAACCCAUAGAAAAGCUCCCCAGGAGGUGCCUCACUCUGAGAAGAGAUUUACAAGGAAGAGUGUGGUGGCUUCUCAGAGUUUCCAAGCAGGGAAACAUUACUGGGAGGUGGACGGAGGACACAAUAAAAGGUGGCGCGUGGGAGUGUGCCGGGAUGAUGUGGACAGGAGGAAGGAGUACGUGACUUUGUCUCCCGAUCAUGGGUACUGGGUCCUCAGACUGAAUGGAGAACAUUUGUAUUUCACAUUAAAUCCCCGUUUUAUCAGCGUCUUCCCCAGGACCCCACCUACAAAAAUAGGGGUCUUCCUGGACUAUGAGUGUGGGACCAUCUCCUUCUUCAACAUAAAUGACCAGUCCCUUAUUUAUACCCUGACAUGUCGGUUUGAAGGCUUAUUGAGGCCCUACAUUGAGUAUCCGUCCUAUAAUGAGCAAAAUGGAACUCCCAUAGUCAUCUGCCCAGUCACCCAGGAAUCAGAGAAAGAGGCCUCUUGGCAAAGGGCCUCUGCAAUCCCAGAGACAAGCAACAGUGAGUCCUCCUCACAGGCAACCACGCCCUUCCUCCCCAGGGGUGAAAUGUAGGAUGAAUCACAUCCCACAUUCUUCUUUAGGGAUAUUAAGGUCUCUCUCCCAGAUCCAAAGUCCCGCAGCAGCCGGCCAAGGUGGCUUCCAGAUGAAGGGGGACUGGCCUGUCCACAUGGGAGUCAGGUGUCAUGGCUGCCCUGAGCUGGGAGGGAAGAAGGCUGACAUUACAUUUAGUUUGCUCUCACUCCAUCUGGCUAAGUGAUCUUGAAAUACCACCUCUCAGGUGAAGAACCGUCAGGAAUUCCCAUCUCACAGGCUGUGGUGUAGAUUAAGUAGACAAGGAAUGUGAAUAAUGCUUAGAUCUUAUUGAUGACAGAGUGUAUCCUAAUGGUUUGUUCAUUAUAUUACACUUUCAGUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-554.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -583.06

Frequency: 0.0000

Diversity: 373.88

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((......(.(((((((...(((((((((((((..((((((...((.......))..))))))..)))).....((((((..(((.((((((((..((......(((...)))......)).)))))))))))))))))(((.(((......))).)))..........))))))))).((((((..(((((.(((((((.....)))))))........(((((....)))))..(((((.....))))).........)))))..))))))((((.((((((((((..((((.((((...((.(((((.((....(((...((((((((((.....))))))...))))...))).(((..((((((((((((....(((((((...(((((.((........))...))))).(((((((((((((((.(((.....((((((.....(((((.(((((........(((.((((.(((((...((((((((((((((...((((((......(((....))))))))).)))))))))))((((((((((.((((..(.((((((((..(((....((..(((.((.((.(((((....))))).)).))))).))....))))))))))).)))))....))))..))..........((((...)))))))).....(((((((((....(((((........)))))...)))))))))((((((......))))))....((((((((.(((((((((((.(.((((((.(.((((((......))))))(((((((((((((...(((((...(((((((((..(((.....)))))))..)))))...)))))..((.(((((.....)))))))..))))))))..)))))).))))))..).)))))))...(((((((.............)))))))(((((((((((((.(((((((((((......((((((......((((..(((...............)))..))))..))))))(((((((((((.(.(((.....)))...).))).))))))))...))))...))))))).))))......)))...)))))).........(((((((.(((....))))))))))...((((((((((...((....(((((.....)))))..))...(((.((((........))))))).(((((.(((((.....))))).)))))..))))).)))))......)))).)))))))))))...))))).))))..)))))))).))))).))))))........((((......))))...))).))))))))))))))).)))))))(((((((.(((..((.(((.(((..........))).))).))..))).)))))))(((....)))......))))))))).)))..))))).))))))).))))))))..))))))))))))))...))))))).).......))))))..............((((((.....(((((((...((((((.....))))))...))))))))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{(((((.,....,.({{{{{(,.,(((((((({{{{{.,({{{{(|,,|{.......,,..}}))}}.,)|}|.,...((((((..(({{((((((((..((....,.((,...})),,....)).))))))))))))))))),,{{((,,,,,,|}}}.,}},|,,,.,,}}))))))))).((((((..(((((.(((((((.....)))))))........(((((....}))))..(((((|...}))))).........)))))..))))))((((.((((((((((..((((.((((...((.(((((.((....(((...((((((((((.....))))))...))))...))).(((..((((((((((((....(((((({...(((((.((........))...))))).,((((((((((((({.(((.,{{,,,(({....},{||||{{{(((........)))......{,,{,...{,{(((((((((((...((((((......(((....))))))))).)))))))))))||,,(((((({({{,..{.((((((((.,(((....((,,({,{{(,((.(((((....))))).}}.})))),}}...,}))))))))))},}}}}....||||.....,,,}.....((((...))))})}},,}{{(((((((((..,,(((({.......,))}))}..)))))))))|(((((......))))}}....((((((((.(((((((((.({(........}}|{,((({{{..{|,||||(.,....|,))}....(((({,(((.((({(,.,{(((((((..((({.((((((((((({....,({{{((((((.((.....(((.....))).....)).))))},..}}}}.}}}}...((((((((((.............))))},.}}))))...((((.(((((((((((......((((((..,..,((({..{{{...,,,,,,,.....)}}..})))},))))))(((((((((((,,.(((.....)))...).))).))))))))...))))...))))))).))))..))))))).))))).),,)).{{...(((((((.(((....))))))))))....}}...))))))))..,}.}}||.)))))))).)}.))..))))))})))))|(((.(((((.({(((((.(((((.....))))).)))))).))))).)))}.......)))).)))))))),,,...|{{{{{,|,,{{|,,{{({,...))))).,,.,.}}..).))))}}.})))))))...))).})))))))))))))}.)))))))(((((((.(((..((.(((.(((........,.))).))).))..))).))))))){{{....))}......))))))))).)))..))))).))))))).))))))))..)))))))))))))).,.|||||||.,.......))))},.....,,....,,|{{{{({.....(((((((...((((((.....))))))...))))))))))))}.