Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001163424.2
Sequence Length
418 nt
GC Content
0.5263
CUAGAGCGCCGCGGCCCCGAGAUGAAGCCGGCGGUGGACGAGAUGUUCCCCGAGGGCGCCGGGCCCUACGUGGACCUGGACGAGGCGGGAGGCAGCACCGGGCUCUUGAUGGACUUGGCAGCCAAUGAAAAGGCCGUUCAUGCAGACUUUUUUAACGAUUUUGAAGAUCUUUUUGAUGAUGAUGACAUCCAGUGAGAUGCCCUCUGGCUGCAGGCGGGGCCAAGCCCUUGGUACAGAGCCGCAGUGUGAGCCUGCGCAGGACAGUUUCAGGUGGUUUUAAAGAACACGUGGAAAUCCCUUGAAUUUAGGACCUGGUUAACCAGAAAGAUAAGACUGUUCUUAACGACCUAGAUGAUUCUGUUCAUCUCUGAACGGGAUCAGGUUUUGUCCUCACUCCAAUUAAAAGAAAGCAAUGUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-135.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -145.39
Frequency: 0.0000
Diversity: 106.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((((((..(.....)..))).))))))((((...((((...(((((((.....))))).))((((...(((((((((.(.((((.((((.((((((((.(.((.((((((.(((........)))(((.(((.((((..(((((((.....)))))))....))))))))))....((((......))))(((((((....)))).))))))))).)).).)...)))))).).))))..)))).).((((....(((((.(((...........))).)))))....)))).(((((((..((((....)))).....(((((....)))))....)))))))(((((((((((....)))))))))))..)))))))))....))))..........)))).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
......(((((((((..(.....)..)))}})))))((((,..{{{({{.(((((((.....))))).)).))|..,(((((({(({{.((((.((((.((((((({,{.((.((((((.(((........))),((,,,.,|,|,,,|{||{{,.....,}}}}}|{{{{.||||,{|{{....}}}|}}}.}}))),(((((((....)))).))))))))).)).,.,,..)))))).).))))..)))).)}}(((({{{(((((.(((,{{,....}},))).))}},..,{|{......,}}}..((((....)))).....,.,|}}}}}))),,..,{|||.,.{(((((((((((....)))))))))))),)))))))))....}}},...........,},.}})).
Back