Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001174104.2

Sequence Length

1644 nt

GC Content

0.5827

AAUUCUACCCCCCUUGGUGCCAACAGAUGAGGUUCACAAUCUCUUCCACAAAACAUGCAGUUAAAUAUCUGAGGAUAUUCAGGGACUUGGAUUUGGUGGCAGGAGAUCAACAUAAACCAAGACAAGGAAGAAGUCAAAGAAAUGAAUCAAGUAGAUUCUCUGGGAUAUAAGGAAAGGAAGGGGGCUGGCUCGGAGGAAGAGAGGUGGGGAGGUGAUCAGGGUUCACAGAGGAGGGAACUGAAUGACAUCCCAGGAUUACAUAAACUGUCAGAGGCAGCCGAAGAGUUCACAAGUGUGAAGCCUGGAAGCCGGCGGGUGCCGCUGUGUAGGAAAGAAGCUAAAGCACUUCCAGAGCCUGUCCGGAGCUCAGAGGUUCGGAAGACUUAUCGACCAUGGAGCGCGCGUCCUGCUUGUUGCUGCUGCUGCUGCCGCUGGUGCACGUCUCUGCGACCACGCCAGAACCUUGUGAGCUGGACGAUGAAGAUUUCCGCUGCGUCUGCAACUUCUCCGAACCUCAGCCCGACUGGUCCGAAGCCUUCCAGUGUGUGUCUGCAGUAGAGGUGGAGAUCCAUGCCGGCGGUCUCAACCUAGAGCCGUUUCUAAAGCGCGUCGAUGCGGACGCCGACCCGCGGCAGUAUGCUGACACGGUCAAGGCUCUCCGCGUGCGGCGGCUCACAGUGGGAGCCGCACAGGUUCCUGCUCAGCUACUGGUAGGCGCCCUGCGUGUGCUAGCGUACUCCCGCCUCAAGGAACUGACGCUCGAGGACCUAAAGAUAACCGGCACCAUGCCUCCGCUGCCUCUGGAAGCCACAGGACUUGCACUUUCCAGCUUGCGCCUACGCAACGUGUCGUGGGCGACAGGGCGUUCUUGGCUCGCCGAGCUGCAGCAGUGGCUCAAGCCAGGCCUCAAGGUACUGAGCAUUGCCCAAGCACACUCGCCUGCCUUUUCCUGCGAACAGGUUCGCGCCUUCCCGGCCCUUACCAGCCUAGACCUGUCUGACAAUCCUGGACUGGGCGAACGCGGACUGAUGGCGGCUCUCUGUCCCCACAAGUUCCCGGCCAUCCAGAAUCUAGCGCUGCGCAACACAGGAAUGGAGACGCCCACAGGCGUGUGCGCCGCACUGGCGGCGGCAGGUGUGCAGCCCCACAGCCUAGACCUCAGCCACAACUCGCUGCGCGCCACCGUAAACCCUAGCGCUCCGAGAUGCAUGUGGUCCAGCGCCCUGAACUCCCUCAAUCUGUCGUUCGCUGGGCUGGAACAGGUGCCUAAAGGACUGCCAGCCAAGCUCAGAGUGCUCGAUCUCAGCUGCAACAGACUGAACAGGGCGCCGCAGCCUGACGAGCUGCCCGAGGUGGAUAACCUGACACUGGACGGGAAUCCCUUCCUGGUCCCUGGAACUGCCCUCCCCCACGAGGGCUCAAUGAACUCCGGCGUGGUCCCAGCCUGUGCACGUUCGACCCUGUCGGUGGGGGUGUCGGGAACCCUGGUGCUGCUCCAAGGGGCCCGGGGCUUUGCCUAAGAUCCAAGACAGAAUAAUGAAUGGACUCAAACUGCCUUGGCUUCAGGGGAGUCCCGUCAGGACGUUGAGGACUUUUCGACCAAUUCAACCCUUUGCCCCACCUUUAUUAAAAUCUUAAACAACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-608.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -636.62

Frequency: 0.0000

Diversity: 570.08

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..........(((((((.(((((..((.((((((...)))))).))..........((((((.......((((..((((((..(.(((((((((...((((((.................(((.........)))........(((((.....))))).(((((((....(((.((((((((((((((((((.(((((..(((((((((((((((((.(((.(((...((.......))...)))...)))..))))))........(((((((((((...((..(((((....)))))..))(((....((((((((((((((.(((((((.((((........)))).(((((((...(((.(((..((((((((((.((......((((((((((..(((((((.((((...((.((....)).))..((((((...(((.....)))..))))))........)))).))))).)).....))))).)).))).......))))))))))))))))))(((((...........)))))(.(((((((((....((((.(((((((......).)))))).)))).((..(((((...)))))..))..))))))))))((((..(((((...)))))....)))).)))))))((..(((((((..((((...)))).))))))).))))))))).))))..((((((.((((...)))).)))))).((.(((..((.(((......))).))..))).))............)))))).)))))))))))))))))).(((((.(((((..((.........((((((((((((((...)).)))))))).))))))))))))))))....(((((((....)))))))..((((((((....))).))).))..(((....)))..))).))))))))))))).)))...(((((((((((..(((((((.....((((((((..(((...)))...(((((.(((.((...(.(((((..(((.(((.....))).)))..)))))))).))))))))..))))).)))(((.((((((((...(((((((((....)))))...((((((....)))))).((((.((((.((......))...((((.((....((.((((..((((................))))..)))).))..)).))))..))))))))..)))).....))))).)))))).)))))))...)))))).....)))))))))))).........((((((....(((((((...))).))))...)))))).((((((....).)))))(((.((((..........))))...)))....))))))))..)))(((((...((((((......)))))).........)))))....)))))))((((.((((.(((.(((.....))).)))))))))))..((((((.(((.((...)).))))))))).))))))..))))))))).).......))))))..)))))))))).))))).))))))).((((.....))))((((((.....))))))............................................

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,,,,.,{.,,(((((,(((,,..{,.{{|||,....|||||{||{{{......,,(((((.....{{((((..,,||||}}|}||||,||||.}}||,|||}}}}........,}}}}|,,..||.,},,,{,..,,,...(((((.....)))))|||(((||.{{{((,.,((,{{((((({{{.{{(,(((({,,{{((((((((((((.{{.((((((,,,,,.{{({{{.,|...,|..,|)}}..}}},,}......,.{((((((((((.{{((..(((((....)))))..))((,..,,((((((((((({((.{(((({,.{,,(,....,,.|}}}.,({(((,{{.(((.(((..((((((((({,((......((((((((((,.(((((((.((((,..((.{{.,,.}}.}}.{{((((({,.{,,..,}}})),,))}))).......,)))).))))).)).....})))).)).))).,.....))))))))))))))))))||,||}..,.,,.,,,|||||(,({(((((({.,.{(((({((((,{{.....,|{||}|||.,,,,.|||}||||,....||||{{||,,||||||}|||((((.,(((({...})))).,..)))).,)))}})||}}|||||||}}|||,.{,||||||||,,,,.))))))))),}}})..((((((.((((...)))).)))))),|,.|||,,||,{|..|,...,,),)),.))),,)},.........,)))))).)))))).))))))))))|.{((({.(((((..{{........}{{((((((((((({...}).)))))))).))}||||}}}}}}}}}....({(((((....)))))}}..((((((((....))).))).))..|}},,..})}}.))),))}}})))})))),}}}.,.|||}}|}{||},,}.}}}}},,,,,,|}|||||}}|||}}..,,.,,((({{{((({{(..{(.(((((,.(((.(((.....)}).)))..))}})})).})})))))..}}},|,{{|||{|,.{.||}},.,{.(.(((((....))))).},|(((((....))))))})}||||}}}}}}.,,.,,|||,.{{{{.{{{{,,,,.((((..((((................))))..)))).}},.)),)))}.,||||||||...,,,,||{.|||||.{{..((({((((((..{{(,{.({....))}))))))))).|||...,.{{|||{....{||||{|,.,))),}))).,,)))))).((((({....}.)))))..,{(((,,...}|||{,{.,.{(({((({.,||||})},{||||{{{{{...((((((......))))))........,.|{{{{(,((({,,{(({,{.{{,{}||{}|||.,}}}))})))}))))})))..{{||||.|||,||}}.})}))))}))||{||})))..}||,|||||.|{{.....|||,,,..,))),,))),}))))}.)))))))}||||}}}}.))}){||||{,,,,,})),)),..,}}..,,....,,,},.}}}},........,,,........