Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001177387.1
Sequence Length
6866 nt
GC Content
0.4342
AUCUGAACAGAAUUAAGACGAACGAGCUUUCACAAUUGCAGCAGAUGAAGAUCCAUUGGUAAAUUGAUCAGGAUUUUUGGCCUACCCUCCAAAGAAAAGGAGCGGAAAGAAUGUCGGAGCGGGCCGCGGAUGACGUCAGGGGGGAGCCGCGCCGCGCGGCGGCGGCGGCGGGCGGAGCAGCGGCCGCGGCCGCCCGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCUCCGCAGCCCCAGCGGCAGCAGCACCCGCCACCGCCGCCACGGCGCACACGGCCGGAGGACGGCGGGCCCGGCGCCGCCUCCACCUCGGCCGCCGCAAUGGCGACGGUCGGGGAGCGCAGGCCUCUGCCCAGUCCUGAAGUGAUGCUGGGACAGUCGUGGAAUCUGUGGGUUGAGGCUUCCAAACUUCCUGGGAAGGACGGGACAGAAUUGGACGAAAGUUUCAAGGAGUUUGGGAAAAACCGCGAAGUCAUGGGGCUCUGUCGGGAAGACAUGCCAAUAUUUGGUUUCUGUCCAGCCCAUGAUGAUUUCUACUUGGUGGUGUGUAACGACUGUAAUCAGGUUGUCAAACCGCAGGCAUUUCAAUCACAUUAUGAAAGAAGACAUAGCUCAUCCAGCAAGCCGCCUUUGGCCGUUCCUCCCACUUCAGUAUUUUCCUUCUUCCCUUCUCUGUCCAAAAGCAAAGGAGGCAGUGCAAGUGGAAGCAACCGUUCUUCCAGUGGAGGUGUUCUUAGCGCAUCCUCAUCAAGUUCCAAGUUGUUGAAAUCACCCAAAGAGAAACUGCAGCUCAGGGGGAACACCAGGCCAAUGCAUCCCAUUCAGCAAAGUAGAGUUCCCCAUGGUAGAAUCAUGACACCCUCUGUGAAAGUGGAAAAGAUUCAUCCGAAAAUGGAUGGCACACUACUGAAAUCUGCGGUGGGGCCAACCUGUCCUGCUACUGUGAGUUCCUUAGUCAAGCCUGGCCUUAACUGCCCCUCAAUACCAAAGCCAACCUUGCCUUCACCUGGACAGAUUCUGAAUGGCAAAGGGCUUCCUGCACCGCCCACUCUGGAAAAGAAACCUGAAGACAAUUCCAAUAAUAGGAAAUUUUUAAAUAAGAGAUUAUCAGAAAGAGAGUUUGAUCCUGACAUCCACUGUGGGGUUAUUGAUCUCGACACCAAGAAGCCCUGCACCCGGUCUUUGACAUGCAAGACACAUUCCUUAACCCAGCGCAGGGCUGUCCAGGGUAGAAGAAAACGAUUUGAUGUGUUAUUAGCCGAGCACAAAAACAAAACCAGGGAAAAGGAAUUGAUUCGCCAUCCGGACUCUCAGCAACCACCGCAGCCUCUCAGGGACCCGCAUCCCGCCCCUCCUAGAACGUCACAGGAGCCGCACCAAAACCCUCACGGAGUGAUUCCUUCCGAAUCAAAGCCUUUUGUAGCUAGUAAACCUAAACCUCACACCCCCAGUCUUCCAAGGCCUCCAGGCUGCCCUGCUCAGCAAGGUGGGAGUGCCCCCAUUGACCCUCCUCCAGUCCAUGAAUCUCCACACCCUCCCCUGCCUGCCACUGAGCCAGCUUCUCGGUUAUCCAGUGAGGAGGGCGAAGGCGAUGACAAAGAAGAGUCUGUUGAAAAACUGGACUGUCAUUAUUCAGGUCAUCAUCCUCAGCCAGCAUCUUUUUGCACAUUUGGGAGCCGGCAGAUAGGAAGAGGCUAUUACGUGUUUGACUCCAGGUGGAAUCGACUUCGCUGCGCCCUCAACCUCAUGGUGGAGAAGCAUCUGAAUGCACAGCUAUGGAAGAAAAUCCCACCAGUGCCCAGUACCACCUCACCCAUCUCCACACGUAUUCCUCACCGGACAAACUCUGUGCCGACAUCACAAUGUGGAGUCAGCUAUCUGGCAGCAGCCACCGUCUCUACAUCCCCAGUCCUGCUCUCAUCUACCUGCAUCUCCCCAAAUAGCAAAUCGGUACCAGCUCAUGGAACCACACUAAAUGCACAGCCUGCUGCUUCAGGGGCGAUGGAUCCUGUGUGCAGUAUGCAAUCCAGACAAGUGUCCUCUUCAUCCUCAUCCCCUUCCACGCCCUCUGGCCUUUCCUCGGUUCCUUCCUCCCCCAUGUCCAGGAAACCUCAGAAAUUGAAAUCCAGCAAAUCUUUGAGGCCCAAGGAGUCUUCUGGUAACAGCACUAACUGUCAAAAUGCCAGUAGCAGUACCAGUGGCGGCUCAGGAAAGAAACGCAAAAACAGUUCCCCACUGUUGGUUCACUCUUCCUCCUCCUCUUCCUCCUCCUCCUCUUCUUCUCAUUCCAUGGAGUCUUUUAGGAAAAACUGUGUGGCUCACUCUGGGCCUCCCUACCCCUCAACGGUAACAUCUUCCCAUAGCAUCGGCCUCAACUGUGUGACGAAUAAAGCAAAUGCGGUGAACGUCCGGCAUGACCAGUCAGGGAGGGGCCCCCCCACCGGGAGCCCUGCUGAAUCCAUCAAGAGGAUGAGUGUGAUGGUGAACAGCAGUGAUUCUACUCUUUCUCUUGGGCCAUUCAUUCACCAGUCCAAUGAACUGCCUGUCAACUCCCACGGCAGUUUUUCCCACUCACACACUCCUCUAGACAAACUCAUAGGAAAGAAAAGAAAGUGCUCACCCAGCUCGAGCAGCAUCAACAACAGCAGCAGCAAACCCACAAAGGUUGCCAAAGUGCCAGCCGUGAACAAUGUCCACAUGAAACACACAGGCACCAUCCCAGGGGCACAAGGACUGAUGAACAGUUCCCUCCUUCAUCAGGAUAUCUCCUCACCUUGCUUACGAACAGGAAUUUCAGCAACAUCACCCCAGAGCCCUGACUUAAAAUCCAAAGGCACGUCCCUGACAGCUGAAAAUAGCACGGGGAGGAAUAAUGCGGACACUUUUGAGGACAAGUUACACCUCCACUCAGCACUCUGGACUCCACGAUGCCUUUGAGUCUGUUUUCCCAACCUCCUGUGGGCCUCAAGGGUAGAAACCUGCCGGGCUGUUGUUUUAACGAGGAUUUCCCUGAAGCUAUGUCUCUAGCAGUGAGUACUCAUAAAGGACACUGGAUCAAGUUCAGCCACCGAAUUGCUUUUAUCAGUGUUAAAGUGGUCUGAACUGCUUGCUACCAAUCUGUGAGAAGUUUUUGUUUUUGUUUUGUUUUUUAACUUGCAGUAUAUCACAGAGCCACUCUUCAAGUAGAUUGGCUGGGCAAAAGAAUGUUUUGGCAAGAGCGUUACUGUAGACCUUUCUCCCUCCUUCCUUUUACUACCAUUUUUUUUUAACACUGUCAUCUGUAGGUCACUCUCCAGCAGUUAGGCACCUUAACUGGAGACCAGAAACCUUCCAGAGAACACAGGGCUGCAUCCCGAGCAACCCUCUGAAGAAGGGAAUUAGGCUUUAGAUUUUGAUAGCAAUGUUCCAGGAAUGAAAUAUAGAUGUUAGCCCAAGACACCAUGACAAAAUAGCCCAGCCUUUUGAGAGUAAUUUGGGAAAAGAAGCUGUCAGAAGUUUCUAACUUACAAACUGGUUUGAAAUUUUUGAUGCCCAGACAGCAAGUAUAAAUCAUUUUGGAGGCUUACUUUUCAUGAUACAAAAGCAAUUCUGUGUGAUUUUUUUUUUUAAGAAGAAAGAAAAUGCAAGCUAGUUUUGAGAAAGGAAGGCCAAAUUGGGUCGGGGGAGGGUGGGAGUGAGGAAGUUAAAAUCACUAUAGGGAGAAAAAACUUUUUUCAAGAUUUCCAAAGAGAUGAAAUUUUCUUAAUCCUUUUAAGUUUUCAUAGUAAACAGUAUGGCAGAUUGGGUUGGUUGUCCUACCUGGUCUAUUUUUAAAAGUCACCUUUUAAAGUGACAUUAUUAGAUACACUUAAAUGUUUCCAAGGCACUCUCUACAUUACCCUUGUUUUUCUCUUUGGAUACUGUCCUGGGACUAAGUGUAGAUUUCUGCUUCAAGCACUUCUGGCAUUGUGUGUUUUUGUAUGCACUCCCCUUCAUGCCACUUCAGAUGUUUAUUUGGAUGUGGUUGGGGACGAGAGCAGACACCAAGGAAAGGGAGUUGGAGAGAAUGUAAGUCCUGACCUGAAGGUCUUUUGUGAUGCAUGUAUAGGAUUGCCCUGACACACACCCUCCUUUCUUGGGAUUAUACCAGCCAUCUUCCUGAGAGUUUUGGAGCCCUCUAGGAUAUUUUUUCUAGUACCCCACCCCCCACCCCUAAAGAAAGACCUUAAUAUGUUAAAACAGCAUUGCUUGGAGAAGGUGUCAUUGAAUUCCGGGACGAGCCGGAGCCUUUAAAUGGGUGCUUCCACCACUACAGGCUCCUGACACGAGUAACAGGCACUGUUGCUUAGAAGAACACACGAAGUUGCCGAACACAGGGUAAAAUUUCCAAGGCGCUGAUCGUUGCCCUGGCCAGGGCCUGAUGAGAGCCAGUCAGUACAUUCUUUUUUUCCUACAGUUCUUGGGUUUCAAACUUCAGUUUCAGGGAAUUUCAAGUCAACAACAGGUAGAAUGAAUAAACUUGGUUACCAGCCUAAUAAUGUGAAUUGCUACAGAAUUAUUCUUAUUAUGUAAGAAAACAAAAACUUUAUGCAGAUACUUUAGCUAUAAAUUGAUGUAAAAUACUGAUUUUUUUAAAGGAAGGAGAGAACAGUAUCUUGUUCAAUUAUUAUGCAAUCAAUCAGUAAAUGUUUUUAAAAUGAUACUACAGGAGAGCUUAGUAAGGAGAGGGCAUGGAUGGGCCAGUUUGGCAUAGUUGGGAGAAAUCAGUCUGGUUUCCAUCCCAGUCGGGGAAGAGAGAGGUGAGAGGGAAUCAGAACGUACCUAGUUGAUUCCUUGGUGACAAGUGCAAUGGGGUAUGGGUAGAAUUUAUUUUCAGAGCCAAGAGGACUUGAUGGUUAUAAAUAAAGUUGCCUUUAGCAAUGGAAUUUACAGAUCGAUCAUGUUGUUCCGAAAGAUGUGAAUAGGAUCCACAAUAACAAGUUGAUUCAGACUAAUGUAGAUAUUUAGAUU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1937.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2070.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 2195.30
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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