Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001178130.3
Sequence Length
6265 nt
GC Content
0.4238
CAAAAAGAGAAACUGUUGGGAGAGGAAUCGUAUCUCCAUAUUUCUUCUUUCAGCCCCAAUCCAAGGGUUGUAGCUGGAACUUUCCAUCAGUUCUUCCUUUCUUUUUCCUCUCUAAGCCUUUGCCUUGCUCUGUCACAGUGAAGUCAGCCAGAGCAGGGCUGUUAAACUCUGUGAAAUUUGUCAUAAGGGUGUCAGGUAUUUCUUACUGGCUUCCAAAGAAACAUAGAUAAAGAAAUCUUUCCUGUGGCUUCCCUUGGCAGGCUGCAUUCAGAAGGUCUCUCAGUUGAAGAAAGAGCUUGGAGGACAACAGCACAACAGGAGAGUAAAAGAUGCCCCAGGGCUGAGGCCUCCGCUCAGGCAGCCGCAUCUGGGGUCAAUCAUACUCACCUUGCCCGGGCCAUGCUCCAGCAAAAUCAAGCUGUUUUCUUUUGAAAGUUCAAACUCAUCAAGAUUAUGCUGCUCACUCUUAUCAUUCUGUUGCCAGUAGUUUCAAAAUUUAGUUUUGUUAGUCUCUCAGCACCGCAGCACUGGAGCUGUCCUGAAGGUACUCUCGCAGGAAAUGGGAAUUCUACUUGUGUGGGUCCUGCACCCUUCUUAAUUUUCUCCCAUGGAAAUAGUAUCUUUAGGAUUGACACAGAAGGAACCAAUUAUGAGCAAUUGGUGGUGGAUGCUGGUGUCUCAGUGAUCAUGGAUUUUCAUUAUAAUGAGAAAAGAAUCUAUUGGGUGGAUUUAGAAAGACAACUUUUGCAAAGAGUUUUUCUGAAUGGGUCAAGGCAAGAGAGAGUAUGUAAUAUAGAGAAAAAUGUUUCUGGAAUGGCAAUAAAUUGGAUAAAUGAAGAAGUUAUUUGGUCAAAUCAACAGGAAGGAAUCAUUACAGUAACAGAUAUGAAAGGAAAUAAUUCCCACAUUCUUUUAAGUGCUUUAAAAUAUCCUGCAAAUGUAGCAGUUGAUCCAGUAGAAAGGUUUAUAUUUUGGUCUUCAGAGGUGGCUGGAAGCCUUUAUAGAGCAGAUCUCGAUGGUGUGGGAGUGAAGGCUCUGUUGGAGACAUCAGAGAAAAUAACAGCUGUGUCAUUGGAUGUGCUUGAUAAGCGGCUGUUUUGGAUUCAGUACAACAGAGAAGGAAGCAAUUCUCUUAUUUGCUCCUGUGAUUAUGAUGGAGGUUCUGUCCACAUUAGUAAACAUCCAACACAGCAUAAUUUGUUUGCAAUGUCCCUUUUUGGUGACCGUAUCUUCUAUUCAACAUGGAAAAUGAAGACAAUUUGGAUAGCCAACAAACACACUGGAAAGGACAUGGUUAGAAUUAACCUCCAUUCAUCAUUUGUACCACUUGGUGAACUGAAAGUAGUGCAUCCACUUGCACAACCCAAGGCAGAAGAUGACACUUGGGAGCCUGAGCAGAAACUUUGCAAAUUGAGGAAAGGAAACUGCAGCAGCACUGUGUGUGGGCAAGACCUCCAGUCACACUUGUGCAUGUGUGCAGAGGGAUACGCCCUAAGUCGAGACCGGAAGUACUGUGAAGAUGUUAAUGAAUGUGCUUUUUGGAAUCAUGGCUGUACUCUUGGGUGUAAAAACACCCCUGGAUCCUAUUACUGCACGUGCCCUGUAGGAUUUGUUCUGCUUCCUGAUGGGAAACGAUGUCAUCAACUUGUUUCCUGUCCACGCAAUGUGUCUGAAUGCAGCCAUGACUGUGUUCUGACAUCAGAAGGUCCCUUAUGUUUCUGUCCUGAAGGCUCAGUGCUUGAGAGAGAUGGGAAAACAUGUAGCGGUUGUUCCUCACCCGAUAAUGGUGGAUGUAGCCAGCUCUGCGUUCCUCUUAGCCCAGUAUCCUGGGAAUGUGAUUGCUUUCCUGGGUAUGACCUACAACUGGAUGAAAAAAGCUGUGCAGCUUCAGGACCACAACCAUUUUUGCUGUUUGCCAAUUCUCAAGAUAUUCGACACAUGCAUUUUGAUGGAACAGACUAUGGAACUCUGCUCAGCCAGCAGAUGGGAAUGGUUUAUGCCCUAGAUCAUGACCCUGUGGAAAAUAAGAUAUACUUUGCCCAUACAGCCCUGAAGUGGAUAGAGAGAGCUAAUAUGGAUGGUUCCCAGCGAGAAAGGCUUAUUGAGGAAGGAGUAGAUGUGCCAGAAGGUCUUGCUGUGGACUGGAUUGGCCGUAGAUUCUAUUGGACAGACAGAGGGAAAUCUCUGAUUGGAAGGAGUGAUUUAAAUGGGAAACGUUCCAAAAUAAUCACUAAGGAGAACAUCUCUCAACCACGAGGAAUUGCUGUUCAUCCAAUGGCCAAGAGAUUAUUCUGGACUGAUACAGGGAUUAAUCCACGAAUUGAAAGUUCUUCCCUCCAAGGCCUUGGCCGUCUGGUUAUAGCCAGCUCUGAUCUAAUCUGGCCCAGUGGAAUAACGAUUGACUUCUUAACUGACAAGUUGUACUGGUGCGAUGCCAAGCAGUCUGUGAUUGAAAUGGCCAAUCUGGAUGGUUCAAAACGCCGAAGACUUACCCAGAAUGAUGUAGGUCACCCAUUUGCUGUAGCAGUGUUUGAGGAUUAUGUGUGGUUCUCAGAUUGGGCUAUGCCAUCAGUAAUGAGAGUAAACAAGAGGACUGGCAAAGAUAGAGUACGUCUCCAAGGCAGCAUGCUGAAGCCCUCAUCACUGGUUGUGGUUCAUCCAUUGGCAAAACCAGGAGCAGAUCCCUGCUUAUAUCAAAACGGAGGCUGUGAACAUAUUUGCAAAAAGAGGCUUGGAACUGCUUGGUGUUCGUGUCGUGAAGGUUUUAUGAAAGCCUCAGAUGGGAAAACGUGUCUGGCUCUGGAUGGUCAUCAGCUGUUGGCAGGUGGUGAAGUUGAUCUAAAGAACCAAGUAACACCAUUGGACAUCUUGUCCAAGACUAGAGUGUCAGAAGAUAACAUUACAGAAUCUCAACACAUGCUAGUGGCUGAAAUCAUGGUGUCAGAUCAAGAUGACUGUGCUCCUGUGGGAUGCAGCAUGUAUGCUCGGUGUAUUUCAGAGGGAGAGGAUGCCACAUGUCAGUGUUUGAAAGGAUUUGCUGGGGAUGGAAAACUAUGUUCUGAUAUAGAUGAAUGUGAGAUGGGUGUCCCAGUGUGCCCCCCUGCCUCCUCCAAGUGCAUCAACACCGAAGGUGGUUAUGUCUGCCGGUGCUCAGAAGGCUACCAAGGAGAUGGGAUUCACUGUCUUGACUCUACUCCACCCCCUCACCUCAGGGAAGAUGACCACCACUAUUCCGUAAGAAAUAGUGACUCUGAAUGUCCCCUGUCCCACGAUGGGUACUGCCUCCAUGAUGGUGUGUGCAUGUAUAUUGAAGCAUUGGACAAGUAUGCAUGCAACUGUGUUGUUGGCUACAUCGGGGAGCGAUGUCAGUACCGAGACCUGAAGUGGUGGGAACUGCGCCACGCUGGCCACGGGCAGCAGCAGAAGGUCAUCGUGGUGGCUGUCUGCGUGGUGGUGCUUGUCAUGCUGCUCCUCCUGAGCCUGUGGGGGGCCCACUACUACAGGACUCAGAAGCUGCUAUCGAAAAACCCAAAGAAUCCUUAUGAGGAGUCGAGCAGAGAUGUGAGGAGUCGCAGGCCUGCUGACACUGAGGAUGGGAUGUCCUCUUGCCCUCAACCUUGGUUUGUGGUUAUAAAAGAACACCAAGACCUCAAGAAUGGGGGUCAACCAGUGGCUGGUGAGGAUGGCCAGGCAGCAGAUGGGUCAAUGCAACCAACUUCAUGGAGGCAGGAGCCCCAGUUAUGUGGAAUGGGCACAGAGCAAGGCUGCUGGAUUCCAGUAUCCAGUGAUAAGGGCUCCUGUCCCCAGGUAAUGGAGCGAAGCUUUCAUAUGCCCUCCUAUGGGACACAGACCCUUGAAGGGGGUGUCGAGAAGCCCCAUUCUCUCCUAUCAGCUAACCCAUUAUGGCAACAAAGGGCCCUGGACCCACCACACCAAAUGGAGCUGACUCAGUGAAAACUGGAAUUAAAAGGAAAGUCAAGAAGAAUGAACUAUGUCGAUGCACAGUAUCUUUUCUUUCAAAAGUAGAGCAAAACUAUAGGUUUUGGUUCCACAAUCUCUACGACUAAUCACCUACUCAAUGCCUGGAGACAGAUACGUAGUUGUGCUUUUGUUUGCUCUUUUAAGCAGUCUCACUGCAGUCUUAUUUCCAAGUAAGAGUACUGGGAGAAUCACUAGGUAACUUAUUAGAAACCCAAAUUGGGACAACAGUGCUUUGUAAAUUGUGUUGUCUUCAGCAGUCAAUACAAAUAGAUUUUUGUUUUUGUUGUUCCUGCAGCCCCAGAAGAAAUUAGGGGUUAAAGCAGACAGUCACACUGGUUUGGUCAGUUACAAAGUAAUUUCUUUGAUCUGGACAGAACAUUUAUAUCAGUUUCAUGAAAUGAUUGGAAUAUUACAAUACCGUUAAGAUACAGUGUAGGCAUUUAACUCCUCAUUGGCGUGGUCCAUGCUGAUGAUUUUGCAAAAUGAGUUGUGAUGAAUCAAUGAAAAAUGUAAUUUAGAAACUGAUUUCUUCAGAAUUAGAUGGCUUAUUUUUUAAAAUAUUUGAAUGAAAACAUUUUAUUUUUAAAAUAUUACACAGGAGGCUUCGGAGUUUCUUAGUCAUUACUGUCCUUUUCCCCUACAGAAUUUUCCCUCUUGGUGUGAUUGCACAGAAUUUGUAUGUAUUUUCAGUUACAAGAUUGUAAGUAAAUUGCCUGAUUUGUUUUCAUUAUAGACAACGAUGAAUUUCUUCUAAUUAUUUAAAUAAAAUCACCAAAAACAUAAACAUUUUAUUGUAUGCCUGAUUAAGUAGUUAAUUAUAGUCUAAGGCAGUACUAGAGUUGAACCAAAAUGAUUUGUCAAGCUUGCUGAUGUUUCUGUUUUUCGUUUUUUUUUUUUUUCCGGAGAGAGGAUAGGAUCUCACUCUGUUAUCCAGGCUGGAGUGUGCAAUGGCACAAUCAUAGCUCAGUGCAGCCUCAAACUCCUGGGCUCAAGCAAUCCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1832.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1955.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 1611.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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